Biologisk Institut

 

 
  1. Udgivet

    Draft genome sequences of the fish pathogen Vibrio harveyi strains VH2 and VH5

    Castillo Bermúdez, D. E., D'Alvise, P., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C. & Katharios, P., 2015, I: Genome Announcements. 3, 5, 2 s., e01062-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Genomic structure of bacteriophage 6H and its distribution as prophage in Flavobacterium psychrophilum strains

    Castillo Bermúdez, D. E., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2014, I: FEMS Microbiology Letters. 351, 1, s. 51-58 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Diversity and geographical distribution of Flavobacterium psychrophilum isolates and their phages: patterns of susceptibility to phage infection and phage host range

    Castillo Bermúdez, D. E., Christiansen, R. H., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2014, I: Microbial Ecology. 67, 4, s. 748-757 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Draft genome sequences of Vibrio alginolyticus strains V1 and V2, opportunistic marine pathogens

    Castillo Bermúdez, D. E., D'Alvise, P., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S. & Katharios, P., 2015, I: Genome Announcements. 3, 4, 2 s., e00729-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Draft genome sequence of Vibrio parahaemolyticus VH3, isolated from an Aquaculture environment in Greece

    Castillo Bermúdez, D. E., Jun, J. W., D'Alvise, P., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S. & Katharios, P., 2015, I: Genome Announcements. 3, 4, 2 s., e00731-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Comparative genome analyses of Vibrio anguillarum strains reveal a link with pathogenicity traits

    Castillo Bermúdez, D. E., Alvise, P. D., Xu, R., Zhang, F., Middelboe, Mathias & Gram, L., 28 feb. 2017, I: mSystems. 2, 1, 14 s., e00001-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Genomic diversity of bacteriophages infecting the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum

    Castillo Bermúdez, D. E. & Middelboe, Mathias, 2016, I: F E M S Microbiology Letters. 363, 24, 6 s., fnw272.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Comparative genome analysis provides Insights into the pathogenicity of Flavobacterium psychrophilum

    Castillo Bermúdez, D. E., Christiansen, R. H., Dalsgaard, I., Madsen, L., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2016, I: P L o S One. 11, 4, 18 s., e0152515.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Bacteriophage resistance mechanisms in the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum: linking genomic mutations to changes in bacterial virulence factors

    Castillo Bermúdez, D. E., Cristiansen, R. H., Dalsgaard, I., Madsen, L. & Middelboe, Mathias, 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 3, s. 1157-1167 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Ectopic expression of the calcium-binding protein parvalbumin in mouse liver endothelial cells

    Castillo, M. B., Berchtold, Martin Werner, Rülicke, T., Schwaller, B., Gotzos, V., Pinzani, M., Reichen, J. & Celio, M. R., 1997, I: Hepatology. 25, 5, s. 1154-9 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Comparative Genomic Analyses of Flavobacterium psychrophilum Isolates Reveals New Putative Genetic Determinants of Virulence Traits

    Castillo, D., Donati, V. L., Jørgensen, J., Sundell, K., Dalsgaard, I., Madsen, L., Wiklund, T. & Middelboe, Mathias, 2021, I: Microorganisms. 9, 8, 15 s., 1658.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Genome Sequences of Shewanella baltica and Shewanella morhuae Strains Isolated from the Gastrointestinal Tract of Freshwater Fish

    Castillo, D., Gram, L. & Dailey, F. E., 2018, I: Genome Announcements. 6, 25, s. 1-2 e00541-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Widespread distribution of prophage-encoded virulence factors in marine Vibrio communities

    Castillo, D., Kauffman, K., Hussain, F., Kalatzis, Panagiotis, Rørbo, N., Polz, M. F. & Middelboe, Mathias, 2018, I: Scientific Reports. 8, s. 1-9 9973.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Draft Genome Sequences of Six Vibrio diazotrophicus Strains Isolated from Deep Subsurface Sediments of the Baltic Sea

    Castillo, D., Vandieken, V., Engelen, B., Engelhardt, T. & Middelboe, Mathias, 2018, I: Genome Announcements. 6, 10, s. 1-2 e00081-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Phage defense mechanisms and their genomic and phenotypic implications in the fish pathogen Vibrio anguillarum

    Castillo, D., Rørbo, N., Jørgensen, J., Lange, J., Tan, D., Kalatzis, Panagiotis, Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2019, I: FEMS Microbiology Ecology. 95, 3, fiz004.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Large Phenotypic and Genetic Diversity of Prophages Induced from the Fish Pathogen Vibrio anguillarum

    Castillo, D., Andersen, N., Kalatzis, Panagiotis & Middelboe, Mathias, 2019, I: Viruses. 11, 11, 15 s., 983.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    In Vitro Evolution of Specific Phages Infecting the Fish Pathogen Flavobacterium psychrophilum

    Castillo, D., Højsting, A. R., Roosvall, A., Smyrlis, G., Jørgensen, J. & Middelboe, Mathias, 2022, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 3, 1, s. 28-37 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Genome-informed approach to identify genetic determinants of Flavobacterium psychrophilum phage susceptibility

    Castillo, D., Jørgensen, J., Sundell, K., Madsen, L., Dalsgaard, I., Wiklund, T. & Middelboe, Mathias, 2021, I: Environmental Microbiology. 23, 8, s. 4185-4199 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Complete Genome Sequence of Shewanella sp. WE21, a Rare Isolate with Multiple Novel Large Genomic Islands

    Castillo, D., Gram, L. & Dailey, F. E., 2018, I: Genome Announcements. 6, 16, s. 1-2 e00277-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Diversity of Flavobacterium psychrophilum and the potential use of its phages for protection against bacterial cold water disease in salmonids

    Castillo, D., Higuera, G., Villa, M., Middelboe, Mathias, Dalsgaard, I., Madsen, L. & Espejo, R. T., 2012, I: Journal of Fish Diseases Online. 35, 3, s. 193-201 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    CTLs' repertoire shaping in the thymus: a Monte Carlo simulation

    Castiglione, F., Santoni, D. & Rapin, N. P. J., 2011, I: Autoimmunity. 44, 4, s. 261-270 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Pseudo-nitzschia pungens (Bacillariophyceae): A cosmopolitan species?

    Casteleyn, G., Chepurnov, V., Leliaert, F., Mann, D., Bates, S., Lundholm, Nina, Rhodes, L., Sabbe, K. & Vyverman, W., 2007, I: Harmful Algae. s. 241–257

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    PICH deficiency limits the progression of MYC-induced B-cell lymphoma

    Castejón-Griñán, M., Albers, E., Simón-Carrasco, L., Aguilera, P., Sbroggio, M., Pladevall Morera, David, Ingham, Andreas, Lim, Ernest Wee Kiat, Guillen-Benitez, A., Pietrini, E., Lisby, Michael, Hickson, Ian David & Lopez-Contreras, Andres, 2024, I: Blood Cancer Journal. 14, 1, 15 s., 16.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Short-term changes in consumption and oviposition rates of Neoseiulus californicus strains (Acari: Phytoseiidae) after a diet shift

    Castagnoli, M., Simoni, S. & Nachman, Gøsta Støger, 2001, I: Experimental and Applied Acarology. 25, s. 969-983

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Prospects for population expansion of the exotic aoudad (Ammotragus lervia; Bovidae) in the Iberian Peninsula: clues from habitat suitability modelling

    Cassinello, J., Acevedo, P. & Hortal, J., 2006, I: Diversity and Distributions-a Journal of Biological Invasions and Biodiversity. 12, 6, s. 666-678

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Phosphorylation sites of Arabidopsis MAP kinase substrate 1 (MKS1).

    Caspersen, M. B., Qiu, J., Zhang, X., Andreasson, E., Naested, H., Mundy, J. & Svensson, B., 2007, I: BBA General Subjects. 1774, 9, s. 1156-63 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Restricted O2 consumption in pea roots induced by hexanoic acid is linked to depletion of Krebs cycle substrates

    Casolo, V., Zancani, M., Pellegrini, Elisa, Filippi, A., Gargiulo, S., Konnerup, D., Morandini, P. & Pedersen, Ole, 2023, I: Physiologia Plantarum. 175, 5, 13 s., e14024.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    A comparison of the mechanisms of electrolyte secretion in pancreas and salivary glands

    Case, R. M., Hunter, M., Novak, Ivana & Young, J. A., 1 jan. 1983, I: Scandinavian Journal of Gastroenterology, Supplement. 18, 87, s. 57-67 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    The role of buffer anions and protons in secretion by the rabbit mandibular salivary gland.

    Case, R. M., Conigrave, A. D., Favaloro, E. J., Novak, Ivana, Thompson, C. H. & Young, J. A., 1982, I: Journal of Physiology. 322, s. 273-86 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Electrolyte and protein secretion by the perfused rabbit mandibular gland stimulated with acetylcholine or catecholamines.

    Case, R. M., Conigrave, A. D., Novak, Ivana & Young, J. A., 1980, I: Journal of Physiology. 300, s. 467-87 20 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    The anionic basis of fluid secretion by the rabbit mandibular salivary gland.

    Case, R. M., Hunter, M., Novak, Ivana & Young, J. A., 1984, I: Journal of Physiology. 349, s. 619-30 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Secretion of saliva by the rabbit mandibular gland in vitro: the role of anions.

    Case, R. M., Conigrave, A. D., Hunter, M., Novak, Ivana, Thompson, C. H. & Young, J. A., 1981, I: Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Biological Sciences. 296, 1080, s. 179-92 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    RhoA exerts a permissive effect on volume-regulated anion channels in vascular endothelial cells.

    Carton, I., Trouet, D., Hermans, D., Barth, H., Aktories, K., Droogmans, G., Jorgensen, N. K., Hoffmann, E. K., Nilius, B. & Eggermont, J., 2002, I: American Journal of Physiology: Cell Physiology. 283, 1, s. C115-C125

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Is organic farming a mitigation option? - A study on N2O emission from winter wheat

    Carter S., M., Albert, K. & Ambus, Per Lennart, 2009, I: Institute of Physics Conference Series.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  35. Udgivet

    Effects of elevated atmospheric CO2, prolonged summer drought and temperature increase on N2O and CH4 fluxes in a temperate heathland

    Carter, M. S., Ambus, Per Lennart, Albert, K. R., Larsen, Klaus Steenberg, Andersson, M., Priemé, Anders, van der Linden, L. & Beier, Claus, 2011, I: Soil Biology & Biochemistry. 43, 8, s. 1660-1670 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    N2O and CH4 fluxes in a temperate heathland under future climatic conditions

    Carter, M. S., Ambus, P., Albert, K. R., Larsen, K. S., Andersson, M., Mikkelsen, T. N., Beier, C., Andresen, L. C. & Kongstad, J., 2009.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  37. Udgivet

    Kleptoplast photosynthesis is nutritionally relevant in the sea slug Elysia viridis

    Cartaxana, P., Trampe, Erik, Kühl, Michael & Cruz, S., 2017, I: Scientific Reports. 7, 10 s., 7714.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Photosynthesis from stolen chloroplasts can support sea slug reproductive fitness

    Cartaxana, P., Rey, F., LeKieffre, C., Lopes, D., Hubas, C., Spangenberg, J. E., Escrig, S., Jesus, B., Calado, G., Domingues, R., Kühl, Michael, Calado, R., Meibom, A. & Cruz, S., 2021, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 288, 1959, 9 s., 20211779.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Differential postprandial lipoprotein responses in type 2 diabetic men with and without clinical evidence of a former myocardial infarction.

    Carstensen, M., Thomsen, C., Gotzsche, O., Holst, Jens Juul, Schrezenmeir, J. & Hermansen, K., 2005, I: The review of diabetic studies : RDS. 1, 4, s. 175-84 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Multivariate Hawkes process models of the occurrence of regulatory elements

    Carstensen, L., Sandelin, Albin Gustav, Winther, Ole & Hansen, Niels Richard, 2010, I: BMC Bioinformatics. 11, s. 456

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Isolation of <Glu-Asn-Phe-His-Leu-Arg-Pro-NH2 (Antho-RPamide II), a novel, biologically active neuropeptide from sea anemones

    Carstensen, K., McFarlane, I. D., Rinehart, K. L., Hudman, D., Sun, F. & Grimmelikhuijzen, Cornelis (Cok), 1993, I: Peptides. 14, 2, s. 131-135 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Isolation of Leu-Pro-Pro-Gly-Pro-Leu-Pro-Arg-Pro-NH2 (Antho-RPamide), an N-terminally protected, biologically active neuropeptide from sea anemones

    Carstensen, K., Rinehart, K. L., McFarlane, I. D. & Grimmelikhuijzen, Cornelis (Cok), 1992, I: Peptides. 13, 5, s. 851-857 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Introducing the biogeographic species pool

    Carstensen, D. W., Lessard, J., Holt, B. G., Borregaard, Michael Krabbe & Rahbek, Carsten, 2013, I: Ecography. 36, 12, s. 1310-1318 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Biogeographical modules and island roles: a comparison of Wallacea and the West Indies

    Carstensen, D. W., Dalsgaard, Bo, Svenning, J., Rahbek, Carsten, Fjeldså, Jon, Sutherland, W. J. & Olesen, J. M., 2012, I: Journal of Biogeography. 39, 4, s. 739-749 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    The functional biogeography of species: biogeographical species roles of birds in Wallacea and the West Indies

    Carstensen, D. W., Dalsgaard, Bo, Svenning, J., Rahbek, Carsten, Fjeldså, Jon, Sutherland, W. J. & Olesen, J. M., okt. 2013, I: Ecography. 36, 10, s. 1097–1105 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Applying evolutionary biology to address global challenges

    Carroll, S. P., Jørgensen, P. S., Kinnison, M. T., Bergstrom, C. T., Denison, R. F., Gluckman, P., Smith, T. B., Strauss, S. Y. & Tabashnik, B. E., 2014, I: Science. 346, 6207, 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    New stalked and sessile cirripedes from the Eocene Mo Clay, northwest Jutland (Denmark)

    Carriol, R., Bonde, N. C., Jakobsen, S. L. & Høeg, Jens Thorvald, 2016, I: Museum National d'Histoire Naturelle. Geodiversitas. 38, 1, s. 21-32 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Evidence for L1-associated DNA rearrangements and negligible L1 retrotransposition in glioblastoma multiforme

    Carreira, P. E., Ewing, A. D., Li, G., Schauer, S. N., Upton, K. R., Fagg, A. C., Morell, S., Kindlova, M., Gerdes, P., Richardson, S. R., Li, B., Gerhardt, D. J., Wang, J., Brennan, P. M. & Faulkner, G. J., 2016, I: Mobile D N A. 7, 14 s., 21.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Autofluorescence imaging system to discriminate and quantify the distribution of benthic cyanobacteria and diatoms

    Carreira, C., Staal, M. J., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I: Limnology and Oceanography: Methods. 13, 4, s. 169-177 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Disruption of photoautotrophic intertidal mats by filamentous fungi

    Carreira, C., Staal, M. J., Falkoski, D., de Vries, R. P., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I: Environmental Microbiology. 17, 8, s. 2910-2921 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt