Biologisk Institut

 

 
  1. Udgivet

    SOAPdenovo-Trans: de novo transcriptome assembly with short RNA-Seq reads

    Xie, Y., Wu, G., Tang, J., Luo, R., Patterson, J., Liu, S., Huang, W., He, G., Gu, S., Li, S., Zhou, X., Lam, T., Li, Y., Xu, X., Wong, G. K. & Wang, J., 2014, I: Bioinformatics. 30, 12, s. 1660-1666 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Noninvasive prenatal paternity testing by maternal plasma DNA sequencing in twin pregnancies

    Xie, Y., Qu, N., Lin, S., Jiang, H., Zhang, Y., Zhang, X., Liang, H., Chen, F. & Ou, X., 2020, I: Electrophoresis. 41, 12, s. 1095-1102

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Spatial chromatin accessibility sequencing resolves high-order spatial interactions of epigenomic markers

    Xie, Y., Ruan, F., Li, Y., Luo, M., Zhang, C., Chen, Z., Xie, Z., Weng, Z., Chen, W., Chen, W., Fang, Y., Sun, Y., Guo, M., Wang, J., Xu, S., Wang, H. & Tang, C., 2024, I: eLife. 12, 20 s., RP87868.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Shotgun metagenomics of 250 adult twins reveals genetic and environmental impacts on the gut microbiome

    Xie, H., Guo, R., Zhong, H., Feng, Q., Lan, Z., Qin, B., Ward, K. J., Jackson, M. A., Xia, Y., Chen, X., Chen, B., Xia, H., Xu, C., Li, F., Xu, X., Al-Aama, J. Y., Yang, H., Wang, J., Kristiansen, K., Wang, J. & 5 flere, Steves, C. J., Bell, J. T., Li, J., Spector, T. D. & Jia, H., 2016, I: Cell Systems. 3, 6, s. 572-584.e3 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    An integrated gene catalog and over 10,000 metagenome-assembled genomes from the gastrointestinal microbiome of ruminants

    Xie, F., Jin, W., Si, H., Yuan, Y., Tao, Y., Liu, J., Wang, X., Yang, C., Li, Q., Yan, X., Lin, L., Jiang, Q., Zhang, L., Guo, C., Greening, C., Heller, R., Guan, L. L., Pope, P. B., Tan, Z., Zhu, W. & 4 flere, Wang, M., Qiu, Q., Li, Z. & Mao, S., 2021, I: Microbiome. 9, 20 s., 137.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    ERK and USP5 govern PD-1 homeostasis via deubiquitination to modulate tumor immunotherapy

    Xiao, X., Shi, J., He, C., Bu, X., Sun, Y., Gao, M., Xiang, B., Xiong, W., Dai, P., Mao, Q., Xing, X., Yao, Y., Yu, H., Xu, G., Li, S., Ren, Y., Chen, B., Jiang, C., Meng, G., Lee, Y. R. & 4 flere, Wei, W., Freeman, G. J., Xie, C. & Zhang, J., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 19 s., 2859.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    High-fat feeding rather than obesity drives taxonomical and functional changes in the gut microbiota in mice

    Xiao, L., Sonne, S. B., Feng, Q., Chen, N., Xia, Z., Li, X., Fang, Z., Zhang, D., Fjære, E., Midtbø, L. K., Derrien, M., Hugenholtz, F., Tang, L., Li, J., Zhang, J., Liu, C., Hao, Q., Vogel, U. B., Mortensen, A., Kleerebezem, M. & 8 flere, Licht, T. R., Yang, H., Wang, J., Li, Y., Arumugam, Mani, Wang, J., Madsen, L. & Kristiansen, Karsten, 8 apr. 2017, I: Microbiome. 5, 12 s., 43.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    A catalog of the mouse gut metagenome: [incl. Author Correction]

    Xiao, L., Feng, Q., Liang, S., Sonne, S. B., Xia, Z., Qiu, X., Li, X., Long, H., Zhang, J., Zhang, D., Liu, C., Fang, Z., Chou, J., Glanville, J., Hao, Q., Kotowska, D. E., Colding, C. S., Licht, T. R., Wu, D., Yu, J. & 17 flere, Sung, J. J. Y., Liang, Q., Li, J., Jia, H., Lan, Z., Tremaroli, V., Dworzynski, P., Nielsen, H. B., Bäckhed, G. F., Dore, J., Le Chatelier, E., Ehrlich, S. D., Lin, J. C., Arumugam, Mani, Wang, J., Madsen, L. & Kristiansen, Karsten, 2015, I: Nature Biotechnology. 33, 10, s. 1103-1108 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    A reference gene catalogue of the pig gut microbiome

    Xiao, L., Estellé, J., Kiilerich, P., Ramayo-Caldas, Y., Xia, Z., Feng, Q., Liang, S., Pedersen, A. Ø., Kjeldsen, N. J., Liu, C., Maguin, E., Doré, J., Pons, N., Le Chatelier, E., Prifti, E., Li, J., Jia, H., Liu, X., Xu, X., Ehrlich, S. D. & 4 flere, Madsen, L., Kristiansen, Karsten, Rogel-Gaillard, C. & Wang, J., 2016, I: Nature Microbiology. 1, 6 s., 16161.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Identification of a disease-causing mutation in a Chinese patient with retinitis pigmentosa by targeted next-generation sequencing

    Xiao, J., Guo, X., Wang, Y., Shao, M., Wei, X., Du, L., Li, L., Sun, Y. & Yang, Y., 8 nov. 2017, I: European Journal of Ophthalmology. 27, 6, s. 791-796 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt