Biologisk Institut

 

 
  1. Udgivet

    Conditional E2F1 activation in transgenic mice causes testicular atrophy and dysplasia mimicking human CIS.

    Agger, K., Santoni Rugiu, Eric, Holmberg, Christian, Karlström, O. & Helin, K., 2005, I: Oncogene. 24, 5, s. 780-9 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    The antibody response in serum, intestinal wall and intestinal lumen of NMRI mice infected with Echinostoma caproni

    Agger, M. K., Simonsen, P. E. & Vennervald, Birgitte J, 1993, I: Journal of Helminthology. Vol. 67, s. 169-178

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    PLZF targets developmental enhancers for activation during osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells

    Agrawal-Singh, S., Lerdrup, Mads, Gomes, A. R., van de Werken, H. J. G., Johansen, Jens Vilstrup, Andersson, Robin, Sandelin, Albin Gustav, Helin, K. & Hansen, K., 2019, I: eLife. 8, s. 1-32 32 s., e40364.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A novel and affordable bioaugmentation strategy with microbial extracts to accelerate the biodegradation of emerging contaminants in different media

    Aguilar-Romero, I., van Dillewijn, P., Nesme, Joseph, Sørensen, Søren Johannes, Nogales, R., Delgado-Moreno, L. & Romero, E., 2022, I: Science of the Total Environment. 834, 10 s., 155234.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Telomeric C-circles localize at nuclear pore complexes in Saccharomyces cerevisiae

    Aguilera, P., Dubarry, M., Hardy, J., Lisby, Michael, Simon, M. & Géli, V., 2022, I: EMBO Journal. 41, 6, 14 s., e108736.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Light harvesting among photosynthetic organisms

    Agustí, S., Enríquez, S., Frost-Christensen, H., Sand-Jensen, Kaj & Duarte, C. M., 1994, I: Functional Ecology. 8, 2, s. 273-279

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Integumentary L-histidine transport in a euryhaline polychaete worm: Regulatory roles of calcium and cadmium in the transport event

    Ahearn, H. R. H., Ahearn, G. A. & Gomme, J., 2000, I: Journal of Experimental Biology. 203, s. 2877-2885

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Cadmium stimulates integumentary uptake of [3H]L-histidine in marine polychaete worms

    Ahearn, H. R. H., Ahearn, G. A. & Gomme, J., 2000, I: The FASEB Journal. 4, s. A599-A599

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskning

  9. Udgivet

    A combined microcosm and mesocosm approach to examine factors affecting survival and mortality of Pseudomonas fluorescens Ag1 in seawater

    Ahl, T., Christoffersen, Kirsten Seestern, Riemann, B. & Nybroe, O., 1995, I: FEMS Microbiology Ecology. 17, 2, s. 107-116

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Genome wide association study of circulating interleukin 6 levels identifies novel loci

    Ahluwalia, T. S., Armstrong, N. J., Aslibekyan, S., Beekman, M., Cheng, Y., deGeus, E., Delgado, G. E., Marek, D., Kanoni, S., Nolte, I. M., Porcu, E., Seppala, I., Standl, M., Teumer, A., Thalamuthu, A., Trompet, S., Benjamin, E. J., Feitosa, M. F., Homuth, G., Lahti, J. & 30 flere, Liu, Y., Timpson, N. J., Visvikis-Siest, S., Voelker, U., Baune, B. T., Boomsma, D., Deary, I. J., Evans, D. M., Ferreira, M. A., Gaunt, T., Gudnason, V., Hamsten, A., Humphries, S. E., Koeing, W., Kumari, M., Lawlor, D. A., Nauck, M., Price, J. F., Sørensen, Thorkild I.A., Stacey, D., Stathopoulou, M. G., Tanaka, T., Wannamethee, S. G., Rotter, J. I., Dehghan, A., Boerwinkle, E., Sneider, H., Psaty, B. M., Prins, B. P. & Alizadeh, B. Z., 2020, I: European Journal of Human Genetics. 28, Supplement 1, s. 307-308 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    FUT2–ABO epistasis increases the risk of early childhood asthma and Streptococcus pneumoniae respiratory illnesses

    Ahluwalia, T. S., Eliasen, A. U., Sevelsted, A., Pedersen, C-E. T., Stokholm, J., Chawes, B., Bork-Jensen, J., Grarup, N., Pedersen, O., Hansen, T., Linneberg, A., Sharma, A., Weiss, S. T., Evans, M. D., Jackson, D. J., Morin, A., Krogfelt, K. A., Schjørring, S., Mortensen, P. B., Hougaard, D. M. & 13 flere, Bybjerg-Grauholm, J., Bækvad-Hansen, M., Mors, O., Nordentoft, Merete, Børglum, A. D., Werge, Thomas, Agerbo, E., Gern, J. E., Lemanske, R. F., Ober, C., Pedersen, A. G., Bisgaard, H. & Bønnelykke, Klaus, 2020, I: Nature Communications. 11, 12 s., 6398.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Tripartite Symbiotic Digestion of Lignocellulose in the Digestive System of a Fungus-Growing Termite

    Ahmad, F., Yang, G., Zhu, Y., Poulsen, Michael, Li, W., Yu, T. & Mo, J., 2022, I: Microbiology Spectrum. 10, 6, 18 s., e01234-22.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Lack of the Major Multifunctional Catalase KatA in Pseudomonas aeruginosa Accelerates Evolution of Antibiotic Resistance in Ciprofloxacin-Treated Biofilms

    Ahmed, M. N., Porse, A., Abdelsamad, A., Sommer, M., Høiby, Niels & Ciofu, Oana, 2019, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 63, 10, 12 s., e00766-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Potent Inhibitor of Human Trypsins from the Aeruginosin Family of Natural Products

    Ahmed, M. N., Wahlsten, M., Jokela, J., Nees, M., Stenman, U., Alvarenga, Danillo Oliveira, Strandin, T., Sivonen, K., Poso, A., Permi, P., Metsä-Ketelä, M., Koistinen, H. & Fewer, D. P., 2021, I: ACS chemical biology. 16, 11, s. 2537–2546 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Refinement of α-Synuclein Ensembles Against SAXS Data: Comparison of Force Fields and Methods

    Ahmed, M. C., Skaanning, L. K., Jussupow, A., Newcombe, Estella Anne, Kragelund, Birthe Brandt, Camilloni, C., Langkilde, Annette Eva & Lindorff-Larsen, Kresten, 2021, I: Frontiers in Molecular Biosciences. 8, 13 s., 654333.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Computing, Analyzing, and Comparing the Radius of Gyration and Hydrodynamic Radius in Conformational Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins

    Ahmed, M. C., Crehuet, R. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2020, Intrinsically Disordered Proteins: Methods and Protocols. Kragelund, B. B. & Skriver, K. (red.). Humana Press, s. 429-445 17 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2141).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Structural Ensemble Refinement of Intrinsically Disordered Proteins using Experimental Data

    Ahmed, M. C. H., 2020, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 175 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  18. Udgivet

    How well do force fields capture the strength of salt bridges in proteins?

    Ahmed, M. C. H., Papaleo, E. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2018, I: PeerJ. 6, 17 s., 4967.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Dioxin increases the interaction between aryl hydrocarbon receptor and estrogen receptor alpha at human promoters

    Ahmed, S., Valen, E., Sandelin, Albin Gustav & Matthews, J., 2009, I: Toxicological Sciences. 111, 2, s. 254-266

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Simultaneous visualization of flow fields and oxygen concentrations to unravel transport and metabolic processes in biological systems

    Ahmerkamp, S., Jalaluddin, F. M., Cui, Y., Brumley, D. R., Pacherres, Cesar, Berg, J. S., Stocker, R., Kuypers, M. M. M., Koren, K. & Behrendt, L., 2022, I: Cell Reports Methods. 2, 5, 18 s., 100216.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Developmental Biology of the Pancreas: Notch and BMP signalling in Pancreas Development

    Ahnfelt-Rønne, J., 2009, Biologisk Institut: Museum Tusculanum. 39 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  22. Udgivet

    Predictable waves of sequential forest degradation and biodiversity loss spreading from an African city

    Ahrends, A., Burgess, Neil David, Milledge, S. A. H., Bulling, M. T., Fisher, B., Smart, J. C. R., Clarke, G. P., Mhoro, B. E. & Jensen Lewis, M., 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 33, s. 14556-14561 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Funding begets biodiversity

    Ahrends, A., Burgess, Neil David, Gereau, R. E., Marchant, R., Bulling, M. T., Lovett, J. C., Platts, P. J., Kindemba, V. W., Owen, N., Fanning, E. & Rahbek, Carsten, 2011, I: Diversity and Distributions. 17, 2, s. 191-200 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Conservation and the botanist effect

    Ahrends, A., Rahbek, Carsten, Bulling, M. T., Burgess, Neil David, Platts, P. J., Lovett, J. C., Kindemba, V. W., Owen, N., Sallu, A. N., Marshall, A. R., Mhoro, B. E., Fanning, E. & Marchant, R., 2011, I: Biological Conservation. 144, 1, s. 131-140 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Generalist ground-nesting bees dominate diversity survey in intensively managed agricultural land

    Ahrenfeldt, E. J., Kollmann, J., Madsen, Henning Bang, Skov-Petersen, Hans & Sigsgaard, L, 2019, I: Journal of Melittology. 2019, s. 1-12 82.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Bacteria in the first void urine of urethritis patients and healthy controls analysed by 454 high throughput senquencing

    Ahrens, P., Frølund, M., Abu Al-Soud, W., Wikström, A., Lidbrink, P., Cullberg, M., Sørensen, Søren Johannes & Jensen, J. S., 2012.

    Publikation: KonferencebidragPosterForskning

  27. Udgivet

    Unravelling animal–microbiota evolution on a chip

    Aizpurua Arrieta, Ostaizka, Blijleven, Kees, Trivedi, Urvish, Gilbert, M Thomas P & Alberdi, Antton, 2023, I: Trends in Microbiology. 31, 10, s. 995-1002 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    A structural biology community assessment of AlphaFold2 applications

    Akdel, M., Pires, D. E., Porta Pardo, E., Jänes, J., Zalevsky, A. O., Meszaros, B., Bryant, P., Good, L. L., Laskowski, R. A., Pozzati, G., Shenoy, A., Zhu, W., Kundrotas, P., Serra, V. R., Rodrigues, C. H. M., Dunham, A. S., Burke, D., Borkakoti, N., Velankar, S., Frost, A. & 14 flere, Basquin, J., Lindorff-Larsen, Kresten, Bateman, A., Kajava, A., Valencia, A., Ovchinnikov, S., Durairaj, J., Ascher, D. B., Thornton, J. M., Davey, N. E., Stein, Amelie, Elofsson, A., Croll, T. & Beltrao, P., 2022, I: Nature Structural & Molecular Biology. 29, 11, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Replacement of proteasome subunits X and Y by LMP7 and LMP2 induced by interferon-gamma for acquirement of the functional diversity responsible for antigen processing

    Akiyama, K., Kagawa, S., Tamura, T., Shimbara, N., Takashima, M., Kristensen, P., Hendil, K. B., Tanaka, K. & Ichihara, A., 1994, I: FEBS Letters. 343, s. 85-88

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  30. Udgivet

    Clinically identified missense mutations in the Wilson Disease gene interfere with in vivo folding of ATP7B.

    Akram, Z., 2011

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  31. Udgivet

    High heavy metal load does not inhibit nitrogen fixation in moss-cyanobacteria associations

    Akther, H. & Rousk, Kathrin, 2019, I: Ecotoxicology. 28, 10, s. 1169-1176 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Light utilization efficiency in photosynthetic microbial mats

    Al-Naijar, M. A. A., de Beer, D., Kühl, Michael & Polerecky, L., 2012, I: Environmental Microbiology. 14, 4, s. 982-992 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Conversion and conservation of light energy in a photosynthetic microbial mat ecosystem

    Al-Najjar, A. A., de Beer, D., Jørgensen, B. B., Kühl, Michael & Polerecky, L., 2010, I: I S M E Journal. 4, 3, s. 440-9 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Conversion and conservation of light energy in a photosynthetic microbial mat ecosystem

    Al-Najjar, A. A., De Beer, D., Jørgensen, B. B., Kühl, Michael & Polerecky, L., 2011, I: Nederlands Tijdschrift voor Medische Microbiologie. 19, Suppl., s. S98-S99

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Spatial patterns and links between microbial community composition and function in cyanobacterial mats

    Al-Najjar, M. A. A., Ramette, A., Kühl, Michael, Hamza, W., Klatt, J. M. & Polerecky, L., 2014, I: Frontiers in Microbiology. 5, 11 s., 406.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    An invertebrate model for CNS drug discovery: transcriptomic and functional analysis of a mammalian P-glycoprotein ortholog

    Al-Qadi, S., Schiøtt, M., Hansen, S. H., Nielsen, P. A. & Badolo, L., 2015, I: B B A - General Subjects. 1850, 12, s. 2439-2451 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Blepharisma intermedium Padmavathi, 1959 (Ciliophora: Heterotrichida) from Al-Hassa Inland Hypersaline Oasis in Saudi Arabia

    Al-Rasheid, K. A. S., Nilsson, J. R. & Larsen, H. F., 2001, I: Acta Protozoologica. 40, s. 63-69

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  38. Udgivet

    Ubiquitin in signaling and protein quality control

    Al-Saoudi, S. V., 2016, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  39. Udgivet
  40. Udgivet

    Morphology of cyprid attachment organs compared across disparate barnacle taxa: does it relate to habitat?

    Al-Yahya, H., Chen, H., Chan, B. K. K., Kado, R. & Høeg, Jens Thorvald, 2016, I: Biological Bulletin. 231, 2, s. 120-129 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Bulk culture levels of specific cytotoxic T-cell activity against HIV-1 proteins are not associated with risk of death

    Aladdin, H., Ullum, H., Lepri, A. C., Leffers, H., Katzenstein, T., Gerstoft, Jan, Gjedde, S. B., Phillips, A. N., Skinhøj, P. & Pedersen, Bente Klarlund, aug. 1999, I: Scandinavian Journal of Immunology. 50, 2, s. 223-7 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Small Aral Sea brings hope for Lake Balkhash

    Aladin, N. V., Høeg, Jens Thorvald & Plotnikov, I., 2020, I: Science. 370, 6522, s. 1283 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Macroecology of macrophytes in the freshwater realm: Patterns, mechanisms and implications

    Alahuhta, J., Lindholm, M., Båstrup-Spohr, Lars, García-Girón, J., Toivanen, M., Heino, J. & Murphy, K., 2021, I: Aquatic Botany. 168, 10 s., 103325.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Comparative transcriptomics of primary cells in vertebrates

    Alam, T., Agrawal, S., Severin, J., Young, R. S., Andersson, R., Arner, E., Hasegawa, A., Lizio, M., Ramilowski, J. A., Abugessaisa, I., Ishizu, Y., Noma, S., Tarui, H., Taylor, M. S., Lassmann, T., Itoh, M., Kasukawa, T., Kawaji, H., Marchionni, L., Sheng, G. & 5 flere, Forrest, A. R. R., Khachigian, L. M., Hayashizaki, Y., Carninci, P. & de Hoon, M. J. L., 2020, I: Genome Research. 30, 7, s. 951-961 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms

    Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, Patrick Denis, Petersen, Bent, Riber, Leise, Kot, Witold & Hansen, Lars Hestbjerg, 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Impacts of twenty years of experimental warming on soil carbon, nitrogen, moisture and soil across alpine/subarctic tundra communities

    Alatalo, J. M., Jägerbrand, A. K., Juhanson, J., Michelsen, Anders & Ľuptáčik, P., 2017, I: Scientific Reports. 7, 11 s., 44489 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Groundwater chemistry determines the prokaryotic community structure of waterworks sand filters

    Albers, C. N., Ellegaard-Jensen, L., Harder, Christoffer Bugge, Rosendahl, Søren, Knudsen, B. E., Ekelund, Flemming & Aamand, J., 2015, I: Environmental Science & Technology (Washington). 49, 2, s. 839-846 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Rapid mineralization of biogenic volatile organic compounds in temperate and Arctic soils

    Albers, C. N., Kramshøj, M. & Rinnan, Riikka, 2018, I: Biogeosciences. 15, 11, s. 3591-3601 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Interactive effects of elevated CO2, warming, and drought on photosynthesis of Deschampsia flexuosa in a temperate heath ecosystem.

    Albert, K. R., Ro-Poulsen, Helge, Mikkelsen, T. N., Michelsen, A., Linden, L. V. D. & Beier, Claus, 2011, I: Journal of Experimental Botany. 62, 12, s. 4253-4266 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet