Biologisk Institut

 

 
  1. 2024
  2. Udgivet

    Regional impacts of warming on biodiversity and biomass in high latitude stream ecosystems across the Northern Hemisphere

    Jackson, M. C., Friberg, N., Moliner Cachazo, L., Clark, D. R., Mutinova, P. T., O’Gorman, E. J., Kordas, R. L., Gallo, B., Pichler, D. E., Bespalaya, Y., Aksenova, O. V., Milner, A., Brooks, S. J., Dunn, N., Lee, K. W. K., Ólafsson, J. S., Gíslason, G. M., Millan, L., Bell, T., Dumbrell, A. J. & 1 flere, Woodward, G., 2024, I: Communications Biology . 7, 1, 8 s., 316.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    MYC activity at enhancers drives prognostic transcriptional programs through an epigenetic switch

    Jakobsen, S. T., Jensen, R. A. M., Madsen, M. S., Ravnsborg, T., Vaagenso, C. S., Siersbæk, M. S., Einarsson, H., Andersson, Robin, Jensen, O. N. & Siersbæk, R., 2024, I: Nature Genetics. 56, s. 663–674 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Long-read genome sequencing provides novel insights into the harmful algal bloom species Prymnesium parvum

    Jian, J., Wu, Z., Silva-núñez, A., Li, X., Zheng, X., Luo, B., Liu, Y., Fang, X., Workman, C. T., Larsen, T. O., Hansen, Per Juel & Sonnenschein, E. C., 2024, I: Science of the Total Environment. 908, 168042.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Translational frontiers: insight from lymphatics in skin regeneration

    Jiang, Y. & Perez-Moreno, Mirna, 2024, I: Frontiers in Physiology. 15, 8 s., 1347558.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Flooding stress and responses to hypoxia in plants

    Jimenez Serna, Juan de la Cruz, Mustroph, A., Pedersen, Ole, Weits, D. A. & Schmidt-schippers, R., 2024, I: Functional Plant Biology. 51, 4, 5 s., FP24061.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. E-pub ahead of print

    Overcoming constraints to measuring O2 diffusivity and consumption of intact roots

    Jimenez Serna, Juan de la Cruz, Armstrong, W., Colmer, T. D. & Pedersen, Ole, 2024, (E-pub ahead of print) I: Plant Physiology. kiae046.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Chromatin image-driven modelling

    Kadlof, M., Banecki, K., Chilinski, Mateusz & Plewczynski, D., 2024, I: Methods. 226, s. 54-60 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Optimizing cleaning strategies for biofouling in reverse osmosis membrane systems: A comparative study using a self-formed instrument

    Khani, M., Hansen, Mads Frederik, Rasekh, B., Nosrati, M., Burmølle, Mette, Ghasemipanah, K. & Zamir, S. M., 2024, I: Journal of Industrial and Engineering Chemistry. 132, s. 448-460 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Fertilizer regime and cultivar affect barley growth and rhizobiome composition

    Kindtler, Nikolaj Lunding, Sheikh, Sanea, Richardy, J., Krogh, E., Maccario, Lorrie, Vestergård, M., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Ekelund, Flemming & Laursen, Kristian Holst, 2024, I: Applied Soil Ecology. 198, 13 s., 105384.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Microbial community composition unaffected by mycorrhizal plant removal in sub-arctic tundra

    Kirchhoff, L., Gavazov, K., Blume-Werry, G., Krab, E. J., Lett, Signe, Pedersen, Emily Pickering, Peter, M., Pfister, S., Väisänen, M. & Monteux, S., 2024, I: Fungal Ecology. 69, 11 s., 101342.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Cross-feeding während der Ausbreitung auf Oberflächen

    Kovács, Á. T. & Kiesewalter, Heiko T., 2024, I: BioSpektrum. 30, 1, s. 71 1 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Dynamics of inflammation-associated plasma proteins following faecal microbiota transplantation in patients with psoriatic arthritis and healthy controls: exploratory findings from the FLORA trial [Inkl. Correction]

    Kragsnaes, M. S., Jensen, J. R. B., Nilsson, A. C., Malik, M. I., Munk, H. L., Pedersen, J. K., Horn, H. C., Kruhøffer, M., Kristiansen, Karsten, Mullish, B. H., Marchesi, J. R., Kjeldsen, J., Röttger, R. & Ellingsen, T., 2024, I: RMD Open. 10, 1, 13 s., e003750.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet
  15. Udgivet

    Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes

    Kuderna, L. F. K., Ulirsch, J. C., Rashid, S., Ameen, M., Sundaram, L., Hickey, G., Cox, A. J., Gao, H., Kumar, A., Aguet, F., Christmas, M. J., Clawson, H., Haeussler, M., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J. & 72 flere, Rouselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S., Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., KU, thw266, Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Karakikes, I., Wang, K. C., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Siepel, A., Kundaje, A., Paten, B., Lindblad-Toh, K., Rogers, J., Marques Bonet, T. & Farh, K. K. H., 2024, I: Nature. 625, s. 735–742 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Endogenous Tagging of Ciliary Genes in Human RPE1 Cells for Live-Cell Imaging

    Kuhns, S., Juhl, A. D., Anvarian, Zeinab, Wüstner, D., Pedersen, Lotte Bang & Andersen, J. S., 2024, Methods in Molecular Biology. Humana Press, s. 147-166 20 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 2725).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    A druggable conformational switch in the c-MYC transactivation domain

    Lama, D., Vosselman, T., Sahin, Cagla, Liaño-pons, J., Cerrato, C. P., Nilsson, L., Teilum, Kaare, Lane, D. P., Landreh, M. & Arsenian Henriksson, M., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 14 s., 1865.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Organismal and cellular growth control by cholesterol as a nutritronal signal

    Lassen, Mette, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 146 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  19. E-pub ahead of print

    BeetleAtlas: An Ontogenetic and Tissue-specific Transcriptomic Atlas of the Red Flour Beetle Tribolium castaneum

    Leader, D. P., Naseem, Muhammad Tayyib & Halberg, Kenneth Veland, 2024, (E-pub ahead of print) I: Journal of Molecular Biology. 168520.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Genomic and functional diversity of cultivated Bifidobacterium from human gut microbiota

    Li, W., Liang, H., He, W., Gao, X., Wu, Z., Hu, T., Lin, X., Wang, M., Zhong, Y., Zhang, H., Ge, L., Jin, X., Xiao, L. & Zou, Y., 2024, I: Heliyon. 10, 5, 14 s., e27270.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Efficient statistical and computational methods for large scale sequencing data

    Li, Zilong, 2024, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 149 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportDoktordisputatsForskning

  22. Udgivet

    vcfpp: a C++ API for rapid processing of the variant call format

    Li, Z., 2024, I: Bioinformatics. 40, 2, 4 s., btae049.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Flooding-adaptive root and shoot traits in rice

    Lin, C., Zhang, Z., Shen, X., Liu, Dan & Pedersen, Ole, 2024, I: Functional Plant Biology. 51, 1, 13 s., FP23226.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Isolation of potentially novel species expands the genomic and functional diversity of Lachnospiraceae

    Lin, X., Hu, T., Wu, Z., Li, L., Wang, Y., Wen, D., Liu, X., Li, W., Liang, H., Jin, X., Xu, X., Wang, J., Yang, H., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2024, I: iMeta. 3, 2, 18 s., e174.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Introgression and disruption of migration routes have shaped the genetic integrity of wildebeest populations

    Liu, X., Lin, L., Sinding, M. H. S., Bertola, L. D., Hanghøj, K., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Schubert, M., Pečnerová, P., Balboa, R. F., Li, Z., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Pinto, R. R., Wang, X., Kuja, J., Brüniche-Olsen, A., Meisner, J., Santander, C. G. & 8 flere, Ogutu, J. O., Masembe, C., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Muwanika, V., Siegismund, Hans Redlef, Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida & Heller, Rasmus, 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 2921.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Can large language models reason about medical questions?

    Liévin, V., Hother, C. E., Motzfeldt, A. G. & Winther, Ole, 2024, I: Patterns. 5, 3, 12 s., 100943.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt