Biologisk Institut

 

 
  1. 2019
  2. Udgivet

    Patterns of host use by brood parasitic Maculinea butterflies across Europe

    Tartally, A., Thomas, J. A., Anton, C., Balletto, E., Barbero, F., Bonelli, S., Bräu, M., Casacci, L. P., Csósz, S., Czekes, Z., Dolek, M., Dziekanska, I., Elmes, G., Fürst, M. A., Glinka, U., Hochberg, M. E., Höttinger, H., Hula, V., Maes, D., Munguira, M. L. & 19 flere, Musche, M., Nowicki, P., Oliveira, P. S., Peregovits, L., Ritter, S., Schlick-Steiner, B. C., Settele, J., Sielezniew, M., Simcox, D. J., Stankiewicz, A. M., Steiner, F. M., Švitra, G., Ugelvig, Line Vej, Van Dyck, H., Varga, Z., Witek, M., Woyciechowski, M., Wynhoff, I. & Nash, David Richard, 2019, I: Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences. 374, 1769, 20180202.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Bioinformatic Analysis of Breast Tumor Interstitial Fluids: Insights into a Pan-molecular Secretome

    Terkelsen, Thilde Bagger, 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  4. Udgivet

    The scent of symbiosis: gut bacteria may affect social interactions in leaf-cutting ants

    Teseo, S., van Zweden, J. S., Pontieri, L., Kooij, P. W., Sørensen, Søren Johannes, Wenseleers, T., Poulsen, Michael, Boomsma, Jacobus J. & Sapountzis, P., 2019, I: Animal Behaviour. 150, s. 239-254

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Plastic leachates impair growth and oxygen production in Prochlorococcus, the ocean's most abundant photosynthetic bacteria

    Tetu, S. G., Sarker, I., Schrameyer, V., Pickford, R., Elbourne, L. D. H., Moore, L. R. & Paulsen, I. T., 2019, I: Communications Biology. 2, 9 s., 184.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    A fat-tissue sensor couples growth to oxygen availability by remotely controlling insulin secretion

    Texada, Michael James, Jørgensen, A. F., Christensen, Christian Fokdal, Koyama, Takashi, Malita, Alina, Smith, D. K., Marple, D. F. M., Danielsen, E. T., Petersen, S. K., Hansen, J. L., Halberg, Kenneth Veland & Rewitz, Kim, 2019, I: Nature Communications. 10, s. 1-16 1955.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Autophagy regulates steroid production by mediating cholesterol trafficking in endocrine cells

    Texada, Michael James, Malita, Alina & Rewitz, Kim, 2019, I: Autophagy. 15, 8, s. 1478-1480

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Autophagy-Mediated Cholesterol Trafficking Controls Steroid Production

    Texada, Michael James, Malita, Alina, Christensen, C. F., Dall, K. B., Faergeman, N. J., Nagy, S., Halberg, Kenneth Veland & Rewitz, Kim, 2019, I: Developmental Cell. 48, 5, s. 659-671, e1-e4

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Escherichia coli belonging to ST131 rarely transfers blactx-m-15 to fecal Escherichia coli

    Thingholm, K. R., Hertz, F. B., Løbner-Olesen, Anders, Frimodt-Møller, N. & Nielsen, K. L., 2019, I: Infection and Drug Resistance. 12, s. 2429-2435

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    A step-by-step guide to analyzing CAGE data using R/Bioconductor

    Thodberg, Malte & Sandelin, Albin Gustav, 18 jun. 2019, I: F1000Research. 8, 49 s., 886.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    CAGEfightR: analysis of 5'-end data using R/Bioconductor

    Thodberg, Malte, Thieffry, A., Vitting-Seerup, K., Andersson, Robin & Sandelin, Albin Gustav, 2019, I: BMC Bioinformatics. 20, 13 s., 487.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Comprehensive profiling of the fission yeast transcription start site activity during stress and media response

    Thodberg, Malte, Thieffry, A., Lange, Jette Bornholdt, Boyd, M., Holmberg, Christian, Azad, A., Workman, C. T., Chen, Y., Ekwall, K., Nielsen, Olaf & Sandelin, Albin Gustav, 28 feb. 2019, I: Nucleic Acids Research. 47, 4, s. 1671-1691 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Traditional plant functional groups explain variation in economic but not size-related traits across the tundra biome

    Thomas, H. J. D., Myers-Smith, I. H., Bjorkman, A. D., Elmendorf, S. C., Blok, D., Cornelissen, J. H. C., Forbes, B. C., Hollister, R. D., Normand, S., Prevéy, J. S., Rixen, C., Schaepman-Strub, G., Wilmking, M., Wipf, S., Cornwell, W. K., Kattge, J., Goetz, S. J., Guay, K. C., Alatalo, J. M., Anadon-Rosell, A. & 69 flere, Angers-Blondin, S., Berner, L. T., Björk, R. G., Buchwal, A., Buras, A., Carbognani, M., Christie, K., Collier, L. S., Cooper, E. J., Eskelinen, A., Frei, E. R., Grau, O., Grogan, P., Hallinger, M., Heijmans, M. M. P. D., Hermanutz, L., Hudson, J. M. G., Hülber, K., Iturrate-Garcia, M., Iversen, C. M., Jaroszynska, F., Johnstone, J. F., Kaarlejärvi, E., Kulonen, A., Lamarque, L. J., Lévesque, E., Little, C. J., Michelsen, Anders, Milbau, A., Nabe-Nielsen, J., Nielsen, S. S., Ninot, J. M., Oberbauer, S. F., Olofsson, J., Onipchenko, V. G., Petraglia, A., Rumpf, S. B., Semenchuk, P. R., Soudzilovskaia, N. A., Spasojevic, M. J., Speed, J. D. M., Tape, K. D., te Beest, M., Tomaselli, M., Trant, A., Treier, U. A., Venn, S., Vowles, T., Weijers, S., Zamin, T., Atkin, O. K., Bahn, M., Blonder, B., Campetella, G., Cerabolini, B. E. L., Chapin, F. S., Dainese, M., de Vries, F. T., Díaz, S., Green, W., Jackson, R. B., Manning, P., Niinemets, Ü., Ozinga, W. A., Peñuelas, J., Reich, P. B., Schamp, B., Sheremetev, S. & van Bodegom, P. M., 2019, I: Global Ecology and Biogeography. 28, 2, s. 78-95

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    The imitation dilemma: can parrots maintain their vocal individuality when imitating conspecifics?

    Thomsen, Heidi Maria, Balsby, T. J. S. & Dabelsteen, Torben, 2019, I: Behaviour. 156, 5-8, s. 787-814 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Svampe, mos og lav som mikrohabitater

    Thomsen, Iben Margrete, Skov, Simon & Bergstedt, C. E., 2019, I: Videnblade Park og Landskab. November 2019, 06.08-08, 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  16. Udgivet

    Mating-type switching by homology-directed recombinational repair: a matter of choice

    Thon, Genevieve, Maki, T., Haber, J. E. & Iwasaki, H., 2019, I: Current Genetics. 65, 2, s. 351-362

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Non-invasive profiling of protease-specific elastin turnover in lung cancer: biomarker potential

    Thorlacius-Ussing, J., Kehlet, S. N., Rønnow, S. R., Karsdal, M. A. & Willumsen, N., 2019, I: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology. 145, 2, s. 383-392

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Infant airway microbiota and topical immune perturbations in the origins of childhood asthma

    Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Waage, J., Mortensen, M., Brejnrod, A., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Brix, S., Sørensen, Søren Johannes, Stokholm, Jakob & Bisgaard, H., 2019, I: Nature Communications. 10, 8 s., 5001.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Wolbachia Horizontal Transmission Events in Ants: What Do We Know and What Can We Learn?

    Tolley, S. J. A., Nonacs, P. & Sapountzis, P., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, s. 1-9 296.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Effects of oxygen-glucose deprivation (OGD) on barrier properties and mRNA transcript levels of selected marker proteins in brain endothelial cells/astrocyte co-cultures

    Tornabene, E., Helms, H. C. C., Pedersen, Stine Helene Falsig & Larsen, Birger Brodin, 2019, I: PLoS ONE. 14, 8, 20 s., e0221103.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Effect of the Nursing Mother on the Gut Microbiome of the Offspring During Early Mouse Development

    Treichel, N. S., Prevorsek, Z., Mrak, V., Kostric, M., Vestergaard, G., Foesel, B., Pfeiffer, S., Stres, B., Schöler, A. & Schloter, M., 2019, I: Microbial Ecology. 78, 2, s. 517-527

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Intramolecular Interactions Dominate the Autoregulation of Escherichia coli Stringent Factor RelA

    Turnbull, K. J., Dzhygyr, I., Lindemose, Søren, Hauryliuk, V. & Roghanian, Mohammad, 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 12 s., 1966.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Structural studies of temperate phage genetic switches

    Varming, A., Rasmussen, K. K., Kilstrup, M., Hammer, K., Ringkjøbing Jensen, M., Ingmer, Hanne & Lo Leggio, Leila, 18 aug. 2019, s. e105-e105. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

  24. Udgivet

    Taxi drivers: the role of animals in transporting mycorrhizal fungi

    Vašutová, M., Mleczko, P., Lopez Garcia, A., Maček, I., Boros, G., Ševčík, J., Fujii, S., Hackenberger, D., Tuf, I. H., Hornung, E., Páll-Gergely, B. & Kjøller, Rasmus, 2019, I: Mycorrhiza. 29, 5, s. 413-434 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Natural 13C abundance reveals age of dietary carbon sources in nematode trophic groups

    Vestergård, M., Dam, M., Mortensen, Louise Hindborg, Dyckmans, J. & Christensen, B. T., 2019, I: Soil Biology & Biochemistry. 130, s. 1-7

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Proteins with calmodulin-like domains: structures and functional roles

    Villalobo, A., González-Muñoz, M. & Berchtold, Martin Werner, 2019, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 76, 12, s. 2299-2328

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    IsoformSwitchAnalyzeR: analysis of changes in genome-wide patterns of alternative splicing and its functional consequences

    Vitting-Seerup, K. & Sandelin, Albin Gustav, 2019, I: Bioinformatics. 35, 21, s. 4469-4471

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Regulation and structural aspects of the human Na+/H+ exchanger NHE1: Roles of the N-terminal region and interactions with lipids

    Vogensen, J., 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  29. Udgivet

    Characterizing Gene Expression and Fragility of the Fragile Site Gene PARK2

    Voutsinos, Vasileios, 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  30. Udgivet

    Fast response of fungal and prokaryotic communities to climate change manipulation in two contrasting tundra soils

    Voříšková, J., Elberling, Bo & Priemé, Anders, 2019, I: Environmental Microbiomes. 14, 1, 15 s., 6.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Alterations in the human gut microbiome associated with Helicobacter pylori infection

    Wang, D., Li, Y., Zhong, H., Ding, Q., Lin, Y., Tang, S., Zong, Y., Wang, Q., Zhang, X., Yang, H., Wang, R. & Liu, X., 2019, I: FEBS Open Bio. 9, 9, s. 1552-1560 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Structure of the human ClC-1 chloride channel

    Wang, Kaituo, Preisler, Sarah Spruce, Zhang, L., Cui, Y., Missel, Julie Winkel, Grønberg, C., Gotfryd, K., Lindahl, E., Andersson, M., Callø, Kirstine, Egea, P. F., Klærke, Dan Arne, Pusch, M., Pedersen, Per Amstrup, Zhou, Z. H. & Gourdon, Pontus Emanuel, 2019, I: PLOS Biology. 17, 4, s. 1-20 e3000218.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Efficient and unique cobarcoding of second-generation sequencing reads from long DNA molecules enabling cost-effective and accurate sequencing, haplotyping, and de novo assembly

    Wang, O., Chin, R., Cheng, X., Wu, M. K. Y., Mao, Q., Tang, J., Sun, Y., Anderson, E., Lam, H. K., Chen, D., Zhou, Y., Wang, L., Fan, F., Zou, Y., Xie, Y., Zhang, R. Y., Drmanac, S., Nguyen, D., Xu, C., Villarosa, C. & 19 flere, Gablenz, S., Barua, N., Nguyen, S., Tian, W., Liu, J. S., Wang, J., Liu, X., Qi, X., CHEN, Ao, Wang, H., Dong, Y., Zhang, W., Alexeev, A., Yang, H., Wang, J., Kristiansen, Karsten, Xu, X., Drmanac, R. & Peters, B. A., 2019, I: Genome Research. 29, 5, s. 798-808

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    The Draft Genome of the Small, Spineless Green Alga Desmodesmus costato-granulatus (Sphaeropleales, Chlorophyta)

    Wang, S., Li, L., Xu, Y., Melkonian, B., Lorenz, M., Friedl, T., Petersen, Morten, Sahu, S. K., Melkonian, M. & Liu, Huan, 2019, I: Protist. 170, 6, 5 s., 125697.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    A Multi-State Coarse-Grained Simulation Model Captures Conformational Cycling in P-Type ATPases

    Wang, Y., Saleh, N., Chu, X. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2019, I: Biophysical Journal. 116, 3, suppl. 1, s. 300a 1484-Plat.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Genetic basis of ruminant headgear and rapid antler regeneration

    Wang, Y., Zhang, C., Wang, N., Li, Z., Heller, R., Liu, R., Zhao, Y., Han, J., Pan, X., Zheng, Z., Dai, X., Chen, C., Dou, M., Peng, S., Chen, X., Liu, J., Li, M., Wang, K., Liu, C., Lin, Z. & 18 flere, Chen, L., Hao, F., Zhu, W., Song, C., Zhao, C., Zheng, C., Wang, J., Hu, S., Li, C., Yang, H., Jiang, L., Li, G., Liu, M., Sonstegard, T. S., KU, thw266, Jiang, Y., Wang, W. & Qiu, Q., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1153-+ eaav6335.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Editorial: Optics and Ecophysiology of Coral Reef Organisms

    Wangpraseurt, D., Larkum, A. W. D., Ferrier-Pagès, C., Salih, A., Warner, M. E., Dubinsky, Z. & Kühl, Michael, 2019, I: Frontiers in Marine Science. 6, 3 s., 742.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Microscale light management and inherent optical properties of intact corals studied with optical coherence tomography

    Wangpraseurt, D., Jacques, S. L., Lundby, N., Holm, J. B., Ferrier-Pagès, C. & Kühl, Michael, 2019, I: Journal of the Royal Society. Interface. 16, 151, s. 1-10 20180567.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Optical Properties of Corals Distort Variable Chlorophyll Fluorescence Measurements

    Wangpraseurt, D., Lichtenberg, Mads, Jacques, S. L., Larkum, A. W. D. & Kühl, Michael, 2019, I: Plant Physiology. 179, 4, s. 1608-1619

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Relatedness, admixture and the genetic history of Greenland-European contact

    Waples, R., 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  41. Udgivet

    Allele frequency-free inference of close familial relationships from genotypes or low-depth sequencing data

    Waples, R. K., Albrechtsen, Anders & Moltke, Ida, 2019, I: Molecular Ecology. 28, 1, s. 35-48 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Maternal and fetal genetic effects on birth weight and their relevance to cardio-metabolic risk factors

    Stokholm, Jakob, Michaelsen, Kim F., Freathy, R. M. & EGG Consortium, E. C., 2019, I: Nature Genetics. 51, 5, s. 804-814

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Characterization of host associated microbiota under influencing factors: A case study on human gut and Brachypodium root

    Wei, S., 2019, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  44. Udgivet

    An apical hypoxic niche sets the pace of shoot meristem activity

    Weits, D. A., Kunkowska, A. B., Kamps, N. C. W., Portz, K. M. S., Packbier, N. K., Nemec Venza, Z., Gaillochet, C., Lohmann, J. U., Pedersen, Ole, Van Dongen, J. T. & Licausi, F., 2019, I: Nature. 569, s. 714-717

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Local hypoxia in the shoot apex is maintained under normoxic growth and acts as an endogenous cue to regulate meristem activity

    Weits, D. A., Pedersen, Ole, Van Dongen, J. T. & Licausi, F., 2019, s. 32. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Soil amendment with sewage sludge affects soil prokaryotic community composition, mobilome and resistome

    Wolters, B., Fornefeld, E., Jechalke, S., Su, J., Zhu, Y., Sørensen, Søren Johannes, Smalla, K. & Jacquiod, S., 2019, I: F E M S Microbiology Reviews. 95, 1, s. 1-14 fiy193.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Broad North Atlantic distribution of a meiobenthic annelid – against all odds: [Inkl. correction]

    Worsaae, Katrine, Kerbl, A., Vang, Á. & Gonzalez, B. C., 2019, I: Scientific Reports. 9, 13 s., 15497.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Description of six new species of Mesonerilla (Nerillidae, Annelida) and an emended description of M. intermedia Wilke, 1953, from marine and cave environments

    Worsaae, Katrine, Mikkelsen, M. D. & Martínez, A., 2019, I: Marine Biodiversity. 49, 5, s. 2141-2165 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Diversity and evolution of the stygobitic Speleonerilla nom. nov. (Nerillidae, Annelida) with description of three new species from anchialine caves in the Caribbean and Lanzarote

    Worsaae, Katrine, Gonzalez, B. C., Kerbl, A., Nielsen, S. H., Jørgensen, J. T., Armenteros, M., Iliffe, T. M. & Martínez, A., 2019, I: Marine Biodiversity. 49, 5, s. 2167-2192

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Psammodrilidae Swedmark, 1952

    Worsaae, Katrine, 2019, Annelida: Annelida Basal Groups and Pleistoannelida, Sedentaria I. Purschke, G., Böggemann, M. & Westheide, W. (red.). De Gruyter, Bind 1. s. 143-156 (Handbook of Zoology).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    The needle mycobiome of Picea glauca – A dynamic system reflecting surrounding environment and tree phenological traits

    Würth, D. G., Dahl, M. B., Trouillier, M., Wilmking, M., Unterseher, M., Scholler, M., Sørensen, Søren Johannes, Mortensen, M. & Schnittler, M., 2019, I: Fungal Ecology. 41, s. 177-186 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt