Biologisk Institut

 

 
  1. Udgivet

    Identification and evolution of avian endogenous foamy viruses

    Chen, Y., Wei, X., KU, thw266, Holmes, E. C. & Cui, J., 2019, I: Virus Evolution. 5, 2, 6 s., vez049.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. E-pub ahead of print

    International consensus guidelines for the definition, detection, and interpretation of autophagy-dependent ferroptosis

    Chen, X., Tsvetkov, A. S., Shen, H., Isidoro, C., Ktistakis, N. T., Linkermann, A., Koopman, W. J. H., Simon, H., Galluzzi, L., Luo, S., Xu, D., Gu, W., Peulen, O., Cai, Q., Rubinsztein, D. C., Chi, J., Zhang, D. D., Li, C., Toyokuni, S., Liu, J. & 49 flere, Roh, J., Dai, E., Juhasz, G., Liu, W., Zhang, J., Yang, M., Liu, J., Zhu, L., Zou, W., Piacentini, M., Ding, W., Yue, Z., Xie, Y., Petersen, Morten, Gewirtz, D. A., Mandell, M. A., Chu, C. T., Sinha, D., Eftekharpour, E., Zhivotovsky, B., Besteiro, S., Gabrilovich, D. I., Kim, D., Kagan, V. E., Bayir, H., Chen, G., Ayton, S., Lünemann, J. D., Komatsu, M., Krautwald, S., Loos, B., Baehrecke, E. H., Wang, J., Lane, J. D., Sadoshima, J., Yang, W. S., Gao, M., Münz, C., Thumm, M., Kampmann, M., Yu, D., Lipinski, M. M., Jones, J. W., Jiang, X., Zeh, H. J., Kang, R., Klionsky, D. J., Kroemer, G. & Tang, D., 2024, (E-pub ahead of print) I: Autophagy. s. 1-34

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Viral integration drives multifocal HCC during the occult HBV infection

    Chen, X-P., Long, X., Jia, W., Wu, H-J., Zhao, J., Liang, H-F., Laurence, A., Zhu, J., Dong, D., Chen, Y., Lin, L., Xia, Y-D., Li, W-Y., Li, G-B., Zhao, Z-K., Wu, K., Hou, Y., Yu, J-J., Xiao, W., Wang, G-P. & 6 flere, Zhu, P., Chen, W., Bai, M., Jian, Y., Kristiansen, Karsten & Chen, Q., 2019, I: Journal of Experimental & Clinical Cancer Research. 38, 11 s., 261.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Sequencing of methylase-accessible regions in integral circular extrachromosomal DNA reveals differences in chromatin structure

    Chen, W., Weng, Z., Xie, Z., Xie, Y., Zhang, C., Chen, Z., Ruan, F., Wang, J., Sun, Y., Fang, Y., Guo, M., Tong, Y., Li, Y. & Tang, C., 2021, I: Epigenetics & Chromatin. 14, 11 s., 40.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Whole-genome sequence of a flatfish provides insights into ZW sex chromosome evolution and adaptation to a benthic lifestyle

    Chen, S., Zhang, G., Shao, C., Huang, Q., Liu, G., Zhang, P., Song, W., An, N., Chalopin, D., Volff, J-N., Hong, Y., Li, Q., Sha, Z., Zhou, H., Xie, M., Yu, Q., Liu, Y., Xiang, H., Wang, N., Wu, K. & 25 flere, Yang, C., Zhou, Q., Liao, X., Yang, L., Hu, Q., Zhang, J., Meng, L., Jin, L., Tian, Y., Lian, J., Yang, J., Miao, G., Liu, S., Liang, Z., Yan, F., Li, Y., Sun, B., Zhang, H., Zhang, J., Zhu, Y., Du, M., Zhao, Y., Schartl, M., Tang, Q. & Wang, J., 2014, I: Nature Genetics. 46, 3, s. 253-262 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Vegetation phenology and its ecohydrological implications from individual to global scales

    Chen, S., Fu, Y. H., Hao, F., Li, X., Zhou, S., Liu, C. & Tang, Jing, 2022, I: Geography and Sustainability. 3, 4, s. 334-338 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Informing the SWAT model with remote sensing detected vegetation phenology for improved modeling of ecohydrological processes

    Chen, S., Fu, Y. H., Wu, Z., Hao, F., Hao, Z., Guo, Y., Geng, X., Li, X., Zhang, X., Tang, Jing, Singh, V. P. & Zhang, X., 2023, I: Journal of Hydrology. 616, 13 s., 128817.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    A new temperature-photoperiod coupled phenology module in LPJ-GUESS model v4.1: Optimizing estimation of terrestrial carbon and water processes

    Chen, S., Fu, Y. H., Li, M., Jia, Z., Cui, Y. & Tang, Jing, 2024, I: Geoscientific Model Development. 17, 7, s. 2509-2523 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Influences of Shifted Vegetation Phenology on Runoff Across a Hydroclimatic Gradient

    Chen, S., Fu, Y. H., Geng, X., Hao, Z., Tang, Jing, Zhang, X., Xu, Z. & Hao, F., 2022, I: Frontiers in Plant Science. 12, 13 s., 802664.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    A method for noninvasive detection of fetal large deletions/duplications by low coverage massively parallel sequencing

    Chen, S., Lau, T. K., Zhang, C., Xu, C., Xu, Z., Hu, P., Xu, J., Huang, H., Pan, L., Jiang, F., Chen, F., Pan, X., Xie, W., Liu, P., Li, X., Zhang, L., Li, S., Li, Y., Xu, X., Wang, W. & 3 flere, Wang, J., Jiang, H. & Zhang, X., 2013, I: Prenatal Diagnosis. 33, 6, s. 584-590 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Targeted next-generation sequencing identifies nine novel filaggrin gene variants in Chinese Han patients with ichthyosis vulgaris

    Chen, S., Kong, X., Wei, X., Sun, Y., Yin, D., Zhang, Q., Du, L., Man, J., Mao, L., Li, H., Tu, Y. & Yang, Y., nov. 2017, I: British Journal of Dermatology. 177, 5, s. E202-E203 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Evidence for early domestic yak, taurine cattle, and their hybrids on the Tibetan Plateau

    Chen, N., Zhang, Z., Hou, J., Chen, J., Gao, X., Tang, L., Wangdue, S., Zhang, X., Sinding, Mikkel Holger Strander, Liu, X., Han, J., Lü, H., Lei, C., Marshall, F. & Liu, X., 2023, I: Science Advances. 9, 50, 13 s., eadi6857.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Global genetic diversity, introgression, and evolutionary adaptation of indicine cattle revealed by whole genome sequencing

    Chen, N., Xia, X., Hanif, Q., Zhang, F., Dang, R., Huang, B., Lyu, Y., Luo, X., Zhang, H., Yan, H., Wang, S., Wang, F., Chen, J., Guan, X., Liu, Y., Li, S., Jin, L., Wang, P., Sun, L., Zhang, J. & 37 flere, Liu, J., Qu, K., Cao, Y., Sun, J., Liao, Y., Xiao, Z., Cai, M., Mu, L., Siddiki, A. Z., Asif, M., Mansoor, S., Babar, M. E., Hussain, T., Silva, G. L. L. P., Gorkhali, N. A., Terefe, E., Belay, G., Tijjani, A., Zegeye, T., Gebre, M. G., Ma, Y., Wang, Y., Huang, Y., Lan, X., Chen, H., Migliore, N. R., Colombo, G., Semino, O., Achilli, A., Sinding, Mikkel Holger Strander, Lenstra, J. A., Cheng, H., Lu, W., Hanotte, O., Han, J., Jiang, Y. & Lei, C., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 13 s., 7803.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Central and peripheral nervous system progenitors derived from human pluripotent stem cells reveal a unique temporal and cell-type specific expression of PMCAs

    Chen, M., Laursen, S. H., Habekost, M., Knudsen, C. H., Buchholdt, S. H., Huang, J., Xu, F., Liu, X., Bolund, L., Luo, Y., Nissen, P., Febbraro, F. & Denham, M., 2018, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 6, s. 1-10 5.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    The Pyramiding of Three Key Root Traits Aid Breeding of Flood-Tolerant Rice

    Chen, L., Zhu, T., Peralta Ogorek, Lucas León, Wang, Y., Sauter, M. & Pedersen, Ole, 2022, I: Plants. 11, 15, 10 s., 2033.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Large-scale ruminant genome sequencing provides insights into their evolution and distinct traits

    Chen, L., Qin, Q., Jiang, Y., Wang, K., Lin, Z., Li, Z., Bibi, F., Yang, Y., Wang, J., Nie, W., Su, W., Liu, G., Li, Q., Fu, W., Pan, X., Liu, C., Yang, J., Zhang, C., Yin, Y., Wang, Y. & 32 flere, Zhao, Y., Zhang, C., Wang, Z., Qin, Y., Liu, W., Wang, B., Ren, Y., Zhang, R., Zeng, Y., Rodrigues da Fonseca, Rute Andreia, Wei, B., Li, R., Wan, W., Zhao, R., Zhu, W., Wang, Y., Duan, S., Gao, Y., Zhang, Y. E., Chen, C., Hvilsom, C., Epps, C. W., Chemnick, L. G., Doug, Y., Mirarab, S., Siegismund, Hans Redlef, Ryder, O. A., Gilbert, M Thomas P, Lewin, H. A., KU, thw266, Heller, Rasmus & Wang, W., 2019, I: Science. 364, 6446, s. 1152-

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Mutational landscape of gastric adenocarcinoma in Chinese: implications for prognosis and therapy

    Chen, K., Yang, D., Li, X., Sun, B., Song, F., Cao, W., Brat, D. J., Gao, Z., Li, H., Liang, H., Zhao, Y., Zheng, H., Li, M., Buckner, J., Patterson, S. D., Ye, X., Reinhard, C., Bhathena, A., Joshi, D., Mischel, P. S. & 12 flere, Croce, C. M., Wang, Y. M., Raghavakaimal, S., Li, H., Lu, X., Pan, Y., Chang, H., Ba, S., Luo, L., Cavenee, W. K., Zhang, W. & Hao, X., 2015, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112, 4, s. 1107-1112 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Environmental and physiological controls on diurnal and seasonal patterns of biogenic volatile organic compound emissions from five dominant woody species under field conditions

    Chen, J., Tang, Jing & Yu, X., 2020, I: Environmental Pollution. 259, 12 s., 113955.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Whole-genome sequencing of Oryza brachyantha reveals mechanisms underlying Oryza genome evolution

    Chen, J., Huang, Q., Gao, D., Wang, J., Lang, Y., Liu, T., Li, B., Bai, Z., Goicoechea, J. L., Liang, C., Chen, C., Zhang, W., Sun, S., Liao, Y., Zhang, X., Yang, L., Song, C., Wang, M., Shi, J., Liu, G. & 21 flere, Liu, J., Zhou, H., Zhou, W., Yu, Q., An, N., Chen, Y., Cai, Q., Wang, B., Liu, B., Min, J., Huang, Y., Wu, H., Li, Z., Zhang, Y., Yin, Y., Song, W., Jiang, J., Jackson, S. A., Wing, R. A., Wang, J. & Chen, M., 2013, I: Nature Communications. 4, 9 s., 1595.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    RPA coordinates DNA end resection and prevents formation of DNA hairpins

    Chen, H., Lisby, Michael & Symington, L. S., 2013, I: Molecular Cell. 50, 4, s. 589-600 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Morphometric and molecular identification of individual barnacle cyprids from wild plankton: an approach to detecting fouling and invasive barnacle species

    Chen, H., Høeg, Jens Thorvald & Chan, B. K. K., 2013, I: Biofouling. 29, 2, s. 133-45 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    A chromosome-level genome assembly of rugged rose (Rosa rugosa) provides insights into its evolution, ecology, and floral characteristics

    Chen, F., Su, L., Hu, S., Xue, J., Liu, H., Liu, G., Jiang, Y., Du, J., Qiao, Y., Fan, Y., Liu, Huan, Yang, Q., Lu, W., Shao, Z., Zhang, J., Zhang, L., Chen, F. & Cheng, Z. (., 2021, I: Horticulture Research. 8, 13 s., 141.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Transcriptome and network changes in climbers at extreme altitudes

    Chen, F., Zhang, W., Liang, Y., Huang, J., Li, K., Green, C. D., Liu, J., Zhang, G., Zhou, B., Yi, X., Wang, W., Liu, H., Xu, X., Shen, F., Qu, N., Wang, Y., Gao, G., San, A., JiangBai, L., Sang, H. & 6 flere, Fang, X., Kristiansen, Karsten, Yang, H., Wang, J., Han, J. J. & Wang, J., 2012, I: P L o S One. 7, 2, s. e31645-e31645

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Isolation and whole genome sequencing of fetal cells from maternal blood towards the ultimate non-invasive prenatal testing

    Chen, F., Liu, P., Gu, Y., Zhu, Z., Nanisetti, A., Lan, Z., Huang, Z., Liu, J. S., Kang, X., Deng, Y., Luo, L., Jiang, D., Qiu, Y., Pan, J., Xia, J., Xiong, K., Liu, C., Xie, L., Shi, Q., Li, J. & 7 flere, Zhang, X., Wang, W., Drmanac, S., Bolund, L., Jiang, H., Drmanac, R. & Xu, X., dec. 2017, I: Prenatal Diagnosis. 37, 13, s. 1311-1321 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Single cell atlas for 11 non-model mammals, reptiles and birds

    Chen, D., Sun, J., Zhu, J., Ding, X., Lan, T., Wang, X., Wu, W., Ou, Z., Zhu, L., Ding, P., Wang, H., Luo, L., Xiang, R., Wang, X., Qiu, J., Wang, S., Li, H., Chai, C., Liang, L., An, F. & 40 flere, Zhang, L., Han, L., Zhu, Y., Wang, F., Yuan, Y., Wu, W., Sun, C., Lu, H., Wu, J., Sun, X., Zhang, S., Sahu, S. K., Liu, P., Xia, J., Zhang, L., Chen, H., Fang, D., Zeng, Y., Wu, Y., Cui, Z., He, Q., Jiang, S., Ma, X., Feng, W., Xu, Y., Li, F., Liu, Z., Chen, L., Chen, F., Jin, X., Qiu, W., Wang, T., Li, Y., Xing, X., Yang, H., Xu, Y., Hua, Y., Liu, Y., Liu, H. & Xu, X., 2021, I: Nature Communications. 12, 17 s., 7083.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt