Biologisk Institut

 

 
  1. 2023
  2. Udgivet

    Bacteriophages suppress CRISPR–Cas immunity using RNA-based anti-CRISPRs

    Camara, Sarah, Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Fagerlund, R. D., Madsen, Jonas Stenløkke, Fineran, P. C., Sørensen, Søren Johannes & Pinilla Redondo, Rafael, 2023, I: Nature. 623, 7987, s. 601-607 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Basal level of ppGpp coordinates Escherichia coli cell heterogeneity and ampicillin resistance and persistence

    Grucela, Paulina Katarzyna & Zhang, Yong, 2023, I: Microbial Cell. 10, 11, s. 248-260 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Benchmarking RNA Editing Detection Tools

    Morales, D. R., Rennie, Sarah & Uchida, S., 2023, I: BioTech. 12, 3, 18 s., 56.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Between inflammation, homeostasis and adaptation: Systemic and tissue-specific responses to maternal immune activation

    Hansen, Signe Schmidt Kjølner, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 177 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  6. Udgivet

    Bi-directional interactions between anti-diabetics and human gut microbiota

    Ren, H., 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 108 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  7. Udgivet

    Biofilm formation and cell plasticity drive diazotrophy in an anoxygenic phototrophic bacterium

    Fernandez Juarez, Victor, Hallstrøm, S., Pacherres, Cesar, Wang, J., Coll-Garcia, G., Kühl, Michael & Riemann, Lasse, 2023, I: Applied and Environmental Microbiology. 89, 11, s. 1-19 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Biological soil crusts on agricultural soils of mesic regions promote microbial cross-kingdom co-occurrences and nutrient retention

    Kurth, J. K., Albrecht, M., Glaser, K., Karsten, U., Vestergaard, G., Armbruster, M., Kublik, S., Schmid, C. A. O., Schloter, M. & Schulz, S., 2023, I: Frontiers in Microbiology. 14, 16 s., 1169958.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Biology and ecology of Juniperus drupacea Labill

    Boratyński, A., Dönmez, A. A., Bou Dagher-Kharrat, M., Romo, Á., Tan, K., Ok, T., Iszkuło, G., Sobierajska, K. & Marcysiak, K., 2023, I: Dendrobiology. 90, s. 1-29 29 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Bowhead NEIL1: molecular cloning, characterization, and enzymatic properties

    Holm, S., Larsen, R. M., Holst, C. M., Heide-Jørgensen, M. P., Steffensen, John Fleng, Stevnsner, T. & Larsen, K., 2023, I: Biochimie. 206, s. 136-149 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Bridging the gap in African biodiversity genomics and bioinformatics

    Sharaf, A., Ndiribe, C. C., Omotoriogun, T. C., Abueg, L., Badaoui, B., Badiane Markey, F. J., Beedessee, G., Diouf, D., Duru, V. C., Ebuzome, C., Eziuzor, S. C., Jaufeerally Fakim, Y., Formenti, G., Ghanmi, N., Guerfali, F. Z., Houaga, I., Ideozu, J. E., Katee, S. M., Khayi, S., Kuja, J. O. & 16 flere, Kwon-Ndung, E. H., Marks, R. A., Moila, A. M., Mungloo-Dilmohamud, Z., Muzemil, S., Nigussie, H., Osuji, J. O., Ras, V., Tchiechoua, Y. H., Zoclanclounon, Y. A. B., Tolley, K. A., Ziyomo, C., Mapholi, N., Muigai, A. W. T., Djikeng, A. & Ebenezer, T. G. E., 2023, I: Nature Biotechnology. 41, 9, s. 1348-1354 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    CNEReg Interprets Ruminant-specific Conserved Non-coding Elements by Developmental Gene Regulatory Network

    Pan, X., Ma, Z., Sun, X., Li, H., Zhang, T., Zhao, C., Wang, N., Heller, Rasmus, Hung Wong, W., Wang, W., Jiang, Y. & Wang, Y., 2023, I: Genomics, Proteomics and Bioinformatics. 21, 3, s. 632-648 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    CRI-SPA: a high-throughput method for systematic genetic editing of yeast libraries

    Cachera, P., Olsson, H., Coumou, H., Jensen, M. L., Sánchez, B., Strucko, T., Van den broek, M., Daran, J., Jensen, M., Sonnenschein, N., Lisby, Michael & Mortensen, U., 2023, I: Nucleic acids symposium series. 51, 17, 14 s., e91.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    CRISPRi screen for enhancing heterologous alpha-amylase yield in Bacillus subtilis

    Geissler, Adrian Sven, Fehler, A. O., Poulsen, L. D., Gonzalez-Tortuero, E., Kallehauge, T. B., Alkan, F., Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, Rasmussen, M. D., Breuener, A., Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2023, I: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 50, 1, 16 s., kuac028.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Can the Wild Perennial, Rhizomatous Rice Species Oryza longistaminata be a Candidate for De Novo Domestication?

    Tong, Shuai, Ashikari, M., Nagai, K. & Pedersen, Ole, 2023, I: Rice. 16, 1, 20 s., 13.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  16. E-pub ahead of print

    Carbon and nitrogen uptake through photosynthesis and feeding by photosymbiotic Acantharia

    Mansour, J. S., Hansen, Per Juel, Leroux, C. & Not, F., 2023, (E-pub ahead of print) I: Open Research Europe.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Cationic amphiphilic antihistamines inhibit STAT3 via Ca2+-dependent lysosomal H+ efflux

    Liu, B., Chen, R., Zhang, Y., Huang, J., Luo, Y., Rosthøj, Susanne, Zhao, C. & Jaattela, Marja, 2023, I: Cell Reports. 42, 2, 20 s., 112137.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Cell Plasticity of Marine Mediterranean Diazotrophs to Climate Change Factors and Nutrient Regimes

    Fernandez Juarez, Victor, Zech, E. H., Pol-Pol, E. & Agawin, N. S. R., 2023, I: Diversity. 15, 3, 18 s., 316.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan

    Johansen, Joachim, Atarashi, K., Arai, Y., Hirose, N., Sørensen, Søren Johannes, Vatanen, T., Knip, M., Honda, K., Xavier, R. J., Rasmussen, Simon & Plichta, D. R., 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 1064-1078 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Changes in the functional diversity of modern bird species over the last million years

    Germain, Ryan Ross, Feng, S., Buffan, L., Carmona, C. P., Chen, G., Graves, G. R., Tobias, J. A., Rahbek, Carsten, Lei, F., Fjeldså, Jon, Hosner, Peter Andrew, Gilbert, M Thomas P, Zhang, G. & Nogues, David Bravo, 2023, I: PNAS. 120, 7, 9 s., e2201945119.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Characterization of industrially-produced Lacticaseibacillus rhamnosus GG and Lactobacillus acidophilus LA-5: Analysis of genomic integrity, transcriptome and phenotypes

    Strickertsson, Marianne Stage, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 206 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  22. Udgivet

    Chemical Stimulation of Heterocyte Differentiation by the Feather Moss Hylocomium splendens: a Potential New Step in Plant-Cyanobacteria Symbioses

    Alvarenga, Danillo Oliveira, Elmdam, I. V., Timm, A. B. & Rousk, Kathrin, 2023, I: Microbial Ecology. 86, s. 419-430 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Chromosome-scale genomes of commercial timber trees (Ochroma pyramidale, Mesua ferrea, and Tectona grandis)

    Sahu, S. K., Liu, M., Chen, Y., Gui, J., Fang, D., Chen, X., Yang, T., He, C., Cheng, L., Yang, J., Sahu, D. N., Li, L., Wang, H., Mu, W., Wei, J., Liu, J., Zhao, Y., Zhang, S., Lisby, M., Liu, X. & 4 flere, Xu, X., Li, L., Wang, S. & Liu, Huan, 2023, I: Scientific Data. 10, 1, 13 s., 512.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Chromosome-scale genomes of commercially important mahoganies, Swietenia macrophylla and Khaya senegalensis

    Sahu, S. K., Liu, M., Wang, G., Chen, Y., Li, R., Fang, D., Sahu, D. N., Mu, W., Wei, J., Liu, J., Zhao, Y., Zhang, S., Lisby, Michael, Liu, X., Xu, X., Li, L., Wang, S., Liu, Huan & He, C., 2023, I: Scientific Data. 10, 9 s., 832.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Chronic acidosis rewires cancer cell metabolism through PPARα signaling

    Rolver, M. G., Holland, L. K. K., Ponniah, M., Prasad, N. S., Yao, Jiayi, Schnipper, J., Kramer, S., Elingaard-Larsen, L., Pedraz-Cuesta, E., Liu, B., Pardo, L. A., Maeda, K., Sandelin, Albin Gustav & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2023, I: International Journal of Cancer. 152, 8, 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Cilia and flagella

    Pedersen, Lotte Bang, Jurisch-Yaksi, N., Schmid, F. M. & Christensen, Søren Tvorup, 2023, Encyclopedia of Cell Biology, Second Edition. Bradshaw, R. A., Hart, G. W. & Stahl, P. D. (red.). 2 udg. Oxford: Elsevier, Bind 3. s. 164-188 25 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt