Biologisk Institut

 

 
  1. 2023
  2. Udgivet

    A global catalog of whole-genome diversity from 233 primate species

    Kuderna, L. F. K., Gao, H., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S. & 55 flere, Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., KU, thw266, Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Rogers, J., Farh, K. K. H. & Marques Bonet, T., 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, s. 906-913 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Biological soil crusts on agricultural soils of mesic regions promote microbial cross-kingdom co-occurrences and nutrient retention

    Kurth, J. K., Albrecht, M., Glaser, K., Karsten, U., Vestergaard, G., Armbruster, M., Kublik, S., Schmid, C. A. O., Schloter, M. & Schulz, S., 2023, I: Frontiers in Microbiology. 14, 16 s., 1169958.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Fitting Force Field Parameters to NMR Relaxation Data

    Kümmerer, Felix, Orioli, S. & Lindorff-Larsen, Kresten, 5 jun. 2023, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 19, 12, s. 3741-3751 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Rare Catechol-O-methyltransferase Missense Variants Are Structurally Unstable Proteasome Targets

    Larsen, Fia Brunsgaard Valsted, Cagiada, Matteo, Dideriksen, J., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2023, I: Biochemistry. 62, 8, 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Fra forsøg til forankring: Flersproget faglig skrivning på bacheloruddannelsen i biokemi

    Larsen, Sanne, Laursen, Katja Årosin & Skriver, Karen, 3 maj 2023, I: Dansk universitetspædagogisk tidsskrift [online]. s. 25-40 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  7. Udgivet

    Mind the gap

    Larsen-Ledet, Sven & Stein, Amelie, 2023, I: Structure. 31, 6, s. 641-643 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Rooting depth and xylem vulnerability are independent woody plant traits jointly selected by aridity, seasonality, and water table depth

    Laughlin, D. C., Siefert, A., Fleri, J. R., Tumber-Dávila, S. J., Hammond, W. M., Sabatini, F. M., Damasceno, G., Aubin, I., Field, R., Hatim, M. Z., Jansen, S., Lenoir, J., Lens, F., McCarthy, J. K., Niinemets, Ü., Phillips, O. L., Attorre, F., Bergeron, Y., Bruun, H. H., Byun, C. & 18 flere, Ćušterevska, R., Dengler, J., De Sanctis, M., Dolezal, J., Jiménez-Alfaro, B., Hérault, B., Homeier, J., Kattge, J., Meir, P., Mencuccini, M., Noroozi, J., Nowak, A., Peñuelas, J., Schmidt, M., Škvorc, Ž., Sultana, F., Ugarte, R. M. & Bruelheide, H., 2023, I: New Phytologist. 240, 5, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Evidence that the domesticated fungus Leucoagaricus gongylophorus recycles its cytoplasmic contents as nutritional rewards to feed its leafcutter ant farmers

    A. Leal-Dutra, Caio, Yuen, L. M., Guedes, B. A. M., Contreras Serrano, Marta, Marques, P. E. & Shik, Jonathan Z., 2023, I: IMA Fungus. 14, 1, 13 s., 19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Horse vocal communication: Investigating the function and production mechanisms of biphonation

    Lefevre, R. A., 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 208 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  11. Udgivet

    Fungi and bacteria in the beds of rural and urban infants correlate with later risk of atopic diseases

    Lehtimäki, J., Gupta, S., Hjelmsø, M., Shah, S., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Soverini, M., Li, Xuan Ji, Russel, J., Trivedi, Urvish, Brix, S., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2023, I: Clinical and Experimental Allergy. 53, 12, s. 1268-1278 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Liquid-Liquid Phase Separation Primes Spider Silk Proteins for Fiber Formation via a Conditional Sticker Domain

    Leppert, A., Chen, G., Lama, D., Sahin, Cagla, Railaite, V., Shilkova, O., Arndt, T., Marklund, E. G., Lane, D. P., Rising, A. & Landreh, M., 2023, I: Nano Letters. 23, 12, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Revised fission yeast gene and allele nomenclature guidelines for machine readability

    Lera-ramírez, M., Bähler, J., Mata, J., Rutherford, K., Hoffman, C. S., Lambert, S., Oliferenko, S., Martin, S. G., Gould, K. L., Du, L., Sabatinos, S. A., Forsburg, S. L., Nielsen, Olaf, Nurse, P. & Wood, V., 2023, I: Genetics. 225, 3, 10 s., iyad143.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Targeted imaging of uPAR expression in vivo with cyclic AE105 variants

    Leth, Julie Maja, Newcombe, Estella Anne, Grønnemose, A. L., Jørgensen, Jesper Tranekjær, Qvist, K., Clausen, Anne Skovsbo, Knudsen, Line Bruhn Schneider, Kjær, Andreas, Kragelund, Birthe Brandt, Jørgensen, Thomas Jørgen Dyreborg & Ploug, Michael, 2023, I: Scientific Reports. 13, 17 s., 17248.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Resolution of eleven reported and five novel Podaxis species based on ITS phylogeny, phylogenomics, morphology, ecology, and geographic distribution

    Li, Guangshuo, A. Leal-Dutra, Caio, Cuesta Mate, Ana, Conlon, B. H., Peereboom, N., Beemelmanns, C., Aanen, D. K., Rosendahl, Søren, de Beer, Z. W. & Poulsen, Michael, 2023, I: Persoonia: Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi. 51, s. 257-279 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Convergent molecular evolution of thermogenesis and circadian rhythm in Arctic ruminants

    Li, M., Li, X., Wu, Z., Zhang, G., Wang, N., Dou, M., Liu, S., Yang, C., Meng, G., Sun, H., Hvilsom, C., Xie, G., Li, Y., Li, Z. H., Wang, W., Jiang, Y., Heller, Rasmus & Wang, Y., 2023, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 290, 1999, 10 s., 20230538.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Seasonal and diel patterns of biogenic volatile organic compound fluxes in a subarctic tundra

    Li, Tao, Baggesen, N., Seco, Roger & Rinnan, Riikka, 2023, I: Atmospheric Environment. 292, 12 s., 119430.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    A catalog of bacterial reference genomes from cultivated human oral bacteria

    Li, W., Liang, H., Lin, X., Hu, T., Wu, Z., He, W., Wang, M., Zhang, J., Jie, Zhuye, Jin, X., Xu, X., Wang, J., Yang, H., Zhang, W., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2023, I: npj Biofilms and Microbiomes. 9, 1, 13 s., 45.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Differential responses of the gut microbiome and resistome to antibiotic exposures in infants and adults

    Li, Xuan Ji, Brejnrod, A., Thorsen, J., Zachariasen, Trine, Trivedi, Urvish, Russel, J., Vestergaard, G. A., Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt & Sørensen, Søren Johannes, 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 16 s., 8526.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    A clade of RHH proteins ubiquitous in Sulfolobales and their viruses regulates cell cycle progression

    Li, X., Lozano-Madueno, C., Martinez Alvarez, Laura & Peng, Xu, 2023, I: Nucleic acids symposium series. 51, 4, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Fast and accurate out-of-core PCA framework for large scale biobank data

    Li, Z., Meisner, Jonas & Albrechtsen, Anders, 2023, I: Genome Research. 33, 9, s. 1599-1608 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    The history of Coast Salish “woolly dogs” revealed by ancient genomics and Indigenous Knowledge

    Lin, A. T., Hammond-Kaarremaa, L., Liu, H-L., Stantis, C., McKechnie, I., Pavel, M., Pavel, S. S. M., Wyss, S. S., Sparrow, D. Q., Carr, K., Aninta, S. G., Perri, A., Hartt, J., Bergström, A., Carmagnini, A., Charlton, S., Dalén, L., Feuerborn, T. R., France, C. A. M., Gopalakrishnan, S. & 13 flere, Grimes, V., Harris, A., Kavich, G., Sacks, B. N., Sinding, Mikkel Holger Strander, Skoglund, P., Stanton, D. W. G., Ostrander, E. A., Larson, G., Armstrong, C. G., Frantz, L. A. F., Hawkins, M. T. R. & Kistler, L., 2023, I: Science. 382, 6676, s. 1303-1309 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    A quantitative trait locus conferring flood tolerance to deepwater rice regulates the formation of two distinct types of aquatic adventitious roots

    Lin, C., Peralta Ogorek, Lucas León, Liu, D., Pedersen, Ole & Sauter, M., 2023, I: New Phytologist. 238, 4, 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Molecular basis for inhibition of type III-B CRISPR-Cas by an archaeal viral anti-CRISPR protein

    Lin, Jinzhong, Alfastsen, L., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2023, I: Cell Host and Microbe. 31, 11, s. 1837-1849.e5 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Underestimated Interannual Variability of Terrestrial Vegetation Production by Terrestrial Ecosystem Models

    Lin, S., Hu, Z., Wang, Y., Chen, X., He, B., Song, Z., Sun, S., Wu, C., Zheng, Y., Xia, X., Liu, L., Tang, Jing, Sun, Q., Joos, F. & Yuan, W., 2023, I: Global Biogeochemical Cycles. 37, 4, 15 s., e2023GB007696.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    The genomic landscape of reference genomes of cultivated human gut bacteria

    Lin, X., Hu, T., Chen, J., Liang, H., Zhou, J., Wu, Z., Ye, C., Jin, X., Xu, X., Zhang, W., Jing, X., Yang, T., Wang, J., Yang, H., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 11 s., 1663.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt