Biologisk Institut

Site-specific responses of fungal and bacterial abundances to experimental warming in litter and soil across Arctic and alpine tundra

Jeanbille, M., Clemmensen, K., Juhanson, J., Michelsen, Anders, Cooper, E. J., Henry, G. H. R., Hofgaard, A., Hollister, R. D., Jónsdóttir, I. S., Klanderud, K., Tolvanen, A. & Hallin, S., 2022, I: Arctic Science. 8, 3, s. 992-1005 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biochar application differentially affects soil micro-, meso-macro-fauna and plant productivity within a nature restoration grassland

Jeffery, S., van de Voorde, T. F. J., Harris, W. E., Mommer, L., Van Groenigen, J. W., De Deyn, G. B., Ekelund, Flemming, Briones, M. J. I. & Bezemer, T. M., 2022, I: Soil Biology and Biochemistry. 174, 11 s., 108789.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ancient and historical DNA in conservation policy

Jensen, E. L., Díez-del-Molino, D., Gilbert, M Thomas P, Bertola, Laura, Borges, F., Cubric-Curik, V., de Navascués, M., Frandsen, P., Heuertz, M., Hvilsom, C., Jiménez-Mena, B., Miettinen, A., Moest, M., Chrzanová Pecnerová, Patrícia, Barnes, I. & Vernesi, C., 2022, I: Trends in Ecology and Evolution. 37, 5, s. 420-429 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Kleptoplast distribution, photosynthetic efficiency and sequestration mechanisms in intertidal benthic foraminifera

Jesus, B., Jauffrais, T., Trampe, Erik, Goessling, J. W., Lekieffre, C., Meibom, A., Kühl, Michael & Geslin, E., 2022, I: ISME Journal. 16, 3, s. 822-832 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Orthologous microsatellites, transposable elements, and DNA deletions correlate with generation time and body mass in neoavian birds

Ji, Y., Feng, S., Wu, L., Fang, Q., Brüniche-Olsen, Anna, DeWoody, J. A., Cheng, Y., Zhang, D., Hao, Y., Song, G., Qu, Y., Suh, A., KU, thw266, Hackett, S. J. & Lei, F., 2022, I: Science Advances. 8, 35, 11 s., eabo0099.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Sequencing introduced false positive rare taxa lead to biased microbial community diversity, assembly, and interaction interpretation in amplicon studies

Jia, Y., Zhao, S., Guo, W., Peng, L., Zhao, F., Wang, L., Fan, G., Zhu, Y., Xu, D., Liu, G., Wang, R., Fang, X., Zhang, H., Kristiansen, Karsten, Zhang, W. & Chen, J., 2022, I: Environmental Microbiomes. 17, 18 s., 43.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A pilot study of assessing whole genome sequencing in newborn screening in unselected children in China

Jian, M., Wang, X., Sui, Y., Fang, M., Feng, C., Huang, Y., Liu, C., Guo, R., Guan, Y., Gao, Y., Wang, Z., Li, S., Cheng, B., Sun, L., Cui, F., Guo, J., Zhan, Y., Zhang, G., Zheng, L., Su, F. & 14 flere, Xue, W., Qian, P., Gao, S., Chen, J., Guan, L., Lu, H., Kristiansen, Karsten, Jin, X., Chen, F., Zhao, Y., Hammarström, L., Jiang, X., Liu, J. & Gao, Y., 2022, I: Clinical and Translational Medicine. 12, 6, 12 s., e843.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

Life History Recorded in the Vagino-cervical Microbiome Along with Multi-omes

Jie, Z., Chen, C., Hao, L., Li, F., Song, L., Zhang, X., Zhu, J., Tian, L., Tong, X., Cai, K., Zhang, Z., Ju, Y., Yu, X., Li, Y., Zhou, H., Lu, H., Qiu, X., Li, Q., Liao, Y., Zhou, D. & 21 flere, Lian, H., Zuo, Y., Chen, X., Rao, W., Ren, Y., Wang, Y., Zi, J., Wang, R., Liu, N., Wu, J., Zhang, W., Liu, X., Zong, Y., Liu, W., Xiao, L., Hou, Y., Xu, X., Yang, H., Wang, J., Kristiansen, Karsten & Jia, H., 2022, I: Genomics, Proteomics and Bioinformatics. 20, 2, s. 304-321 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genome binning of viral entities from bulk metagenomics data

Johansen, Joachim, Plichta, D. R., Nissen, J. N., Jespersen, Marie Louise, Shah, S. A., Deng, Ling, Stokholm, Jakob, Bisgaard, H., Nielsen, Dennis Sandris, Sørensen, Søren Johannes & Rasmussen, Simon, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 965.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mg²⁺-dependent conformational equilibria in CorA and an integrated view on transport regulation

Johansen, Nicolai Tidemand, Bonaccorsi, M., Bengtsen, T., Nørgrd Larsen, Andreas, Tidemand, Frederik Grønbæk, Pedersen, Martin Cramer, Huda, P., Berndtsson, J., Darwish, T., Yepuri, N. R., Martel, A., Pomorski, Thomas Guenther, Bertarello, A., Sansom, M., Rapp, M., Crehuet, R., Schubeis, T., Lindorff-Larsen, Kresten, Pintacuda, G. & Arleth, Lise, 2022, I: eLife. 11, 35 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Single-cell RNA sequencing technologies and applications: A brief overview

Jovic, D., Liang, Xue, Zeng, H., Lin, L., Xu, F. & Luo, Y., 2022, I: Clinical and Translational Medicine. 12, 3, 20 s., e694.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Reversible mutations in gliding motility and virulence genes: A flexible and efficient phage defence mechanism in Flavobacterium psychrophilum

Jørgensen, J., Sundell, K., Castillo, D., Dramshøj, L. S., Jørgensen, N. B., Madsen, S. B., Landor, L., Wiklund, T., Donati, V. L., Madsen, L., Dalsgaard, I. & Middelboe, Mathias, 2022, I: Environmental Microbiology. 24, 10, s. 4915-4930

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

An LDLR missense variant poses high risk of familial hypercholesterolemia in 30% of Greenlanders and offers potential of early cardiovascular disease intervention

Jørsboe, E., Andersen, M. K., Skotte, L., Stæger, F. F., Færgeman, N. J., Hanghøj, K., Santander, C. G., Senftleber, N. K., Diaz, L. J., Overvad, M., Waples, R. K., Geller, F., Bjerregaard, P., Melbye, M., Larsen, C. V. L., Feenstra, B., Anders Koch, K., Jørgensen, M. E., Grarup, N., Moltke, I. & 2 flere, Albrechtsen, Anders & Hansen, Torben, 2022, I: Human Genetics and Genomics Advances. 3, 4, 10 s., 100118.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Efficient approaches for large-scale GWAS with genotype uncertainty

Jørsboe, E. & Albrechtsen, Anders, 2022, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 12, 1, 9 s., jkab385.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biodiversity patterns of Arctic diatom assemblages in lakes and streams: Current reference conditions and historical context for biomonitoring

Kahlert, M., Rühland, K. M., Lavoie, I., Keck, F., Saulnier-Talbot, E., Bogan, D., Brua, R. B., Campeau, S., Christoffersen, Kirsten Seestern, Culp, J. M., Karjalainen, S. M., Lento, J., Schneider, S. C., Shaftel, R. & Smol, J. P., 2022, I: Freshwater Biology. 67, 1, s. 116-140 25 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Variations in life cycle and seasonal sex ratio in the rhizocephalan Peltogasterella gracilis (Boschma, 1927) (Cirripedia: Rhizocephala: Peltogasterellidae)

Kajimoto, A., Høeg, Jens Thorvald, Kato, K. & Yusa, Y., 2022, I: Journal of Crustacean Biology. 42, 4, 8 s., ruac057.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Anthropogenically impacted lake catchments in Denmark reveal low microplastic pollution

Kallenbach, E. M. F., Friberg, N., Lusher, A., Jacobsen, Dean & Hurley, R. R., 2022, I: Environmental Science and Pollution Research. 29, 31, s. 47726-47739 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Plastic recycling plant as a point source of microplastics to sediment and macroinvertebrates in a remote stream

Kallenbach, E. M. F., Eriksen, T. E., Hurley, R. R., Jacobsen, Dean, Singdahl-Larsen, C. & Friberg, N., 2022, I: Microplastics and Nanoplastics. 2, 15 s., 26.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

MDsrv: visual sharing and analysis of molecular dynamics simulations

Kampfrath, M., Staritzbichler, R., Hernández, G. P., Rose, A. S., Tiemann, Johanna Katarina Sofie, Scheuermann, G., Wiegreffe, D. & Hildebrand, P. W., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W483-W489 7 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Disease-linked mutations cause exposure of a protein quality control degron

Kampmeyer, Caroline, Larsen-Ledet, Sven, Wagnkilde, M. R., Michelsen, M., Iversen, Henriette Kring Mangor, Nielsen, S. V., Lindemose, Søren, Caregnato, A., Ravid, T., Stein, Amelie, Teilum, Kaare, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2022, I: Structure. 30, 9, s. 1245-1253.e5

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Overexpression of ATG8/LC3 enhances wound-induced somatic reprogramming in Physcomitrium patens

Kanne, J. V., Ishikawa, M., Bressendorff, Simon, Ansbøl, Jeppe, Hasebe, M., Rodriguez, Eleazar & Petersen, Morten, 2022, I: Autophagy. 18, 6, s. 1463-1466 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

Implicating genes, pleiotropy, and sexual dimorphism at blood lipid loci through multi-ancestry meta-analysis

Kanoni, S., Graham, S. E., Wang, Y., Surakka, I., Ramdas, S., Zhu, X., Clarke, S. L., Bhatti, K. F., Vedantam, S., Winkler, T. W., Locke, A. E., Marouli, E., Zajac, G. J. M., Wu, K. H. H., Ntalla, I., Hui, Q., Klarin, D., Hilliard, A. T., Wang, Z., Xue, C. & 519 flere, Thorleifsson, G., Helgadottir, A., Gudbjartsson, D. F., Holm, H., Olafsson, I., Hwang, M. Y., Han, S., Akiyama, M., Sakaue, S., Terao, C., Kanai, M., Zhou, W., Brumpton, B. M., Rasheed, H., Havulinna, A. S., Veturi, Y., Pacheco, J. A., Rosenthal, E. A., Lingren, T., Feng, Q. P., Kullo, I. J., Narita, A., Takayama, J., Martin, H. C., Hunt, K. A., Trivedi, B., Haessler, J., Giulianini, F., Bradford, Y., Miller, J. E., Campbell, A., Lin, K., Millwood, I. Y., Rasheed, A., Hindy, G., Faul, J. D., Zhao, W., Weir, D. R., Turman, C., Huang, H., Graff, M., Choudhury, A., Sengupta, D., Mahajan, A., Brown, M. R., Zhang, W., Yu, K., Schmidt, E. M., Pandit, A., Gustafsson, S., Yin, X., Luan, J., Zhao, J. H., Matsuda, F., Jang, H. M., Yoon, K., Medina-Gomez, C., Pitsillides, A., Hottenga, J. J., Wood, A. R., Ji, Y., Gao, Z., Haworth, S., Yousri, N. A., Mitchell, R. E., Chai, J. F., Aadahl, Mette, Bjerregaard, A. A., Yao, J., Manichaikul, A., Hwu, C. M., Hung, Y. J., Warren, H. R., Ramirez, J., Bork-Jensen, J., Kårhus, L. L., Goel, A., Sabater-Lleal, M., Noordam, R., Mauro, P., Matteo, F., McDaid, A. F., Marques-Vidal, P., Wielscher, M., Trompet, S., Sattar, N., Møllehave, L. T., Munz, M., Zeng, L., Huang, J., Yang, B., Poveda, A., Kurbasic, A., Lamina, C., Forer, L., Scholz, M., Galesloot, T. E., Bradfield, J. P., Ruotsalainen, S. E., Daw, E., Zmuda, J. M., Mitchell, J. S., Fuchsberger, C., Christensen, H., Brody, J. A., Vazquez-Moreno, M., Feitosa, M. F., Wojczynski, M. K., Wang, Z., Preuss, M. H., Mangino, M., Christofidou, P., Verweij, N., Benjamins, J. W., Engmann, J., Tsao, N. L., Verma, A., Slieker, R. C., Lo, K. S., Zilhao, N. R., Le, P., Kleber, M. E., Delgado, G. E., Huo, S., Ikeda, D. D., Iha, H., Yang, J., Liu, J., Demirkan, A., Leonard, H. L., Marten, J., Frank, M., Schmidt, B., Smyth, L. J., Cañadas-Garre, M., Wang, C., Nakatochi, M., Wong, A., Hutri-Kähönen, N., Sim, X., Xia, R., Huerta-Chagoya, A., Fernandez-Lopez, J. C., Lyssenko, V., Nongmaithem, S. S., Bayyana, S., Stringham, H. M., Irvin, M. R., Oldmeadow, C., Kim, H. N., Ryu, S., Timmers, P. R. H. J., Arbeeva, L., Dorajoo, R., Lange, L. A., Prasad, G., Lorés-Motta, L., Pauper, M., Long, J., Li, X., Theusch, E., Takeuchi, F., Spracklen, C. N., Loukola, A., Bollepalli, S., Warner, S. C., Wang, Y. X., Wei, W. B., Nutile, T., Ruggiero, D., Sung, Y. J., Chen, S., Liu, F., Yang, J., Kentistou, K. A., Banas, B., Nardone, G. G., Meidtner, K., Bielak, L. F., Smith, J. A., Hebbar, P., Farmaki, A. E., Hofer, E., Lin, M., Concas, M. P., Vaccargiu, S., van der Most, P. J., Pitkänen, N., Cade, B. E., van der Laan, S. W., Chitrala, K. N., Weiss, S., Bentley, A. R., Doumatey, A. P., Adeyemo, A. A., Lee, J. Y., Petersen, E. R. B., Nielsen, A. A., Choi, H. S., Nethander, M., Freitag-Wolf, S., Southam, L., Rayner, N. W., Wang, C. A., Lin, S. Y., Wang, J. S., Couture, C., Lyytikäinen, L. P., Nikus, K., Cuellar-Partida, G., Vestergaard, H., Hidalgo, B., Giannakopoulou, O., Cai, Q., Obura, M. O., van Setten, J., Li, X., Liang, J., Tang, H., Terzikhan, N., Shin, J. H., Jackson, R. D., Reiner, A. P., Martin, L. W., Chen, Z., Li, L., Kawaguchi, T., Thiery, J., Bis, J. C., Launer, L. J., Li, H., Nalls, M. A., Raitakari, O. T., Ichihara, S., Wild, S. H., Nelson, C. P., Campbell, H., Jäger, S., Nabika, T., Al-Mulla, F., Niinikoski, H., Braund, P. S., Kolcic, I., Kovacs, P., Giardoglou, T., Katsuya, T., de Kleijn, D., de Borst, G. J., Kim, E. K., Adams, H. H. H., Ikram, M. A., Zhu, X., Asselbergs, F. W., Kraaijeveld, A. O., Beulens, J. W. J., Shu, X. O., Rallidis, L. S., Pedersen, Oluf Borbye, Hansen, Torben, Mitchell, P., Hewitt, A. W., Kähönen, M., Pérusse, L., Bouchard, C., Tönjes, A., Chen, Y. D. I., Pennell, C. E., Mori, T. A., Lieb, W., Franke, A., Ohlsson, C., Mellström, D., Cho, Y. S., Lee, H., Yuan, J. M., Koh, W. P., Rhee, S. Y., Woo, J. T., Heid, I. M., Stark, K. J., Zimmermann, M. E., Völzke, H., Homuth, G., Evans, M. K., Zonderman, A. B., Polasek, O., Pasterkamp, G., Hoefer, I. E., Redline, S., Pahkala, K., Oldehinkel, A. J., Snieder, H., Biino, G., Schmidt, R., Schmidt, H., Bandinelli, S., Dedoussis, G., Thanaraj, T. A., Kardia, S. L. R., Peyser, P. A., Kato, N., Schulze, M. B., Girotto, G., Böger, C. A., Jung, B., Joshi, P. K., Bennett, D. A., De Jager, P. L., Lu, X., Mamakou, V., Brown, M., Caulfield, M. J., Munroe, P. B., Guo, X., Ciullo, M., Jonas, J. B., Samani, N. J., Kaprio, J., Pajukanta, P., Tusié-Luna, T., Aguilar-Salinas, C. A., Adair, L. S., Bechayda, S. A., de Silva, H. J., Wickremasinghe, A. R., Krauss, R. M., Wu, J. Y., Zheng, W., Hollander, A. I., Bharadwaj, D., Correa, A., Wilson, J. G., Lind, L., Heng, C. K., Nelson, A. E., Golightly, Y. M., Wilson, J. F., Penninx, B., Kim, H. L., Attia, J., Scott, R. J., Rao, D. C., Arnett, D. K., Hunt, S. C., Walker, M., Koistinen, H. A., Chandak, G. R., Mercader, J. M., Costanzo, M. C., Jang, D., Burtt, N. P., Villalpando, C. G., Orozco, L., Fornage, M., Tai, E., van Dam, R. M., Lehtimäki, T., Chaturvedi, N., Yokota, M., Liu, J., Reilly, D. F., McKnight, A. J., Kee, F., Jöckel, K. H., McCarthy, M. I., Palmer, C. N. A., Vitart, V., Hayward, C., Simonsick, E., van Duijn, C. M., Jin, Z. B., Qu, J., Hishigaki, H., Lin, X., März, W., Gudnason, V., Tardif, J. C., Lettre, G., Hart, L. M. T., Elders, P. J. M., Damrauer, S. M., Kumari, M., Kivimaki, M., van der Harst, P., Spector, T. D., Loos, Ruth, Province, M. A., Parra, E. J., Cruz, M., Psaty, B. M., Brandslund, I., Pramstaller, P. P., Rotimi, C. N., Christensen, K., Ripatti, S., Widén, E., Hakonarson, H., Grant, S. F. A., Kiemeney, L. A. L. M., de Graaf, J., Loeffler, M., Kronenberg, F., Gu, D., Erdmann, J., Schunkert, H., Franks, P. W., Linneberg, Allan René, Jukema, J. W., Khera, A. V., Männikkö, M., Jarvelin, M. R., Kutalik, Z., Francesco, C., Mook-Kanamori, D. O., van Dijk, K. W., Watkins, H., Strachan, D. P., Grarup, Niels, Sever, P., Poulter, N., Chuang, L. M., Rotter, J. I., Dantoft, T. M., Karpe, F., Neville, M. J., Timpson, N. J., Cheng, C. Y., Wong, T. Y., Khor, C. C., Li, H., Sabanayagam, C., Peters, A., Gieger, C., Hattersley, A. T., Pedersen, N. L., Magnusson, P. K. E., Boomsma, D. I., Willemsen, A. H. M., Cupples, L., van Meurs, J. B. J., Ghanbari, M., Gordon-Larsen, P., Huang, W., Kim, Y. J., Tabara, Y., Wareham, N. J., Langenberg, C., Zeggini, E., Kuusisto, J., Laakso, M., Ingelsson, E., Abecasis, G., Chambers, J. C., Kooner, J. S., de Vries, P. S., Morrison, A. C., Hazelhurst, S., Ramsay, M., North, K. E., Daviglus, M., Kraft, P., Martin, N. G., Whitfield, J. B., Abbas, S., Saleheen, D., Walters, R. G., Holmes, M. V., Black, C., Smith, B. H., Baras, A., Justice, A. E., Buring, J. E., Ridker, P. M., Chasman, D. I., Kooperberg, C., Tamiya, G., Yamamoto, M., van Heel, D. A., Trembath, R. C., Wei, W. Q., Jarvik, G. P., Namjou, B., Hayes, M. G., Ritchie, M. D., Jousilahti, P., Salomaa, V., Hveem, K., Åsvold, B. O., Kubo, M., Kamatani, Y., Okada, Y., Murakami, Y., Kim, B. J., Thorsteinsdottir, U., Stefansson, K., Zhang, J., Chen, Y., Ho, Y. L., Lynch, J. A., Rader, D. J., Tsao, P. S., Chang, K. M., Cho, K., O'Donnell, C. J., Gaziano, J. M., Wilson, P. W. F., Frayling, T. M., Hirschhorn, J. N., Kathiresan, S., Mohlke, K. L., Sun, Y. V., Morris, A. P., Boehnke, M., Brown, C. D., Natarajan, P., Deloukas, P., Willer, C. J., Assimes, T. L. & Peloso, G. M., 2022, I: Genome Biology. 23, 1, 42 s., 268.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Rdh54 stabilizes Rad51 at displacement loop intermediates to regulate genetic exchange between chromosomes

Keymakh, M., Dau, J., Hu, J., Ferlez, B., Lisby, Michael & Brooks Crickard, J., 2022, I: PLOS Genetics. 18, 9, 26 s., e1010412.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Sialylation of N-glycans affects the lipid secretion governed by specialized secretory lysosomal organelles through an effect on the V-ATPase

Khoder-Agha, F., Song, Ming, Borre, M. T., Marinova, I. N., Ye, Z., Pedersen, Stine Helene Falsig, Dabelsteen, Sally & Wandall, Hans H., 2022, I: Glycobiology. 32, 11, s. 1012-1013 2 s., P103.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

Effect of gluten-free diet and antibiotics on murine gut microbiota and immune response to tetanus vaccination

Kihl, Pernille, Krych, Lukasz, Deng, Ling, Hansen, Lars Hestbjerg, Buschard, K., Skov, Søren, Nielsen, Dennis Sandris & Hansen, Axel Kornerup, 2022, I: Plos One. 17, 4, 21 s., e0266719.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

False gene and chromosome losses in genome assemblies caused by GC content variation and repeats

Kim, J., Lee, C., Ko, B. J., Yoo, D. A., Won, S., Phillippy, A. M., Fedrigo, O., KU, thw266, Howe, K., Wood, J., Durbin, R., Formenti, G., Brown, S., Cantin, L., Mello, C. V., Cho, S., Rhie, A., Kim, H. & Jarvis, E. D., 2022, I: Genome Biology. 23, 29 s., 204.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Escaping from multiple visual threats: modulation of escape responses in Pacific staghorn sculpin (Leptocottus armatus)

Kimura, H., Pfalzgraff, T., Levet, M., Kawabata, Y., Steffensen, John Fleng, Johansen, J. L. & Domenici, P., 2022, I: The Journal of Experimental Biology. 225, 9, 9 s., jeb243328.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Hypersalinity effects on O₂ flux across the diffusive boundary layer of leaves in the tropical seagrass Thalassia testudinum

Koch, M. S., Johnson, C. R., Travis, L., Pedersen, Ole & Madden, C. J., 2022, I: Journal of Experimental Marine Biology and Ecology. 555, 8 s., 151780.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Irradiance, Water Column O₂, and Tide Drive Internal O₂ Dynamics and Meristem H₂S Detection in the Dominant Caribbean-Tropical Atlantic Seagrass, Thalassia testudinum

Koch, M. S., Johnson, C. R., Madden, C. J. & Pedersen, Ole, 2022, I: Estuaries and Coasts. 45, 8, s. 2543-2559 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Low irradiance disrupts the internal O₂ dynamics of seagrass (Thalassia testudinum) leading to shoot meristem H₂S intrusion

Koch, M. S., Johnson, C. R., Madden, C. J. & Pedersen, Ole, 2022, I: Aquatic Botany. 181, 11 s., 103532.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Reconstructing the Origins of the Somatostatin and Allatostatin-C Signaling Systems Using the Accelerated Evolution of Biodiverse Cone Snail Toxins

Koch, Thomas Lund, Ramiro, Iris Bea L. , Flórez Salcedo, P., Engholm, E., Jensen, Knud Jørgen, Chase, K., Olivera, B. M., Bjørn-Yoshimoto, Walden, Safavi-hemami, H. & True, J. (red.), 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 4, 20 s., msac075.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Ductal keratin 15⁺ luminal progenitors in normal breast exhibit a basal-like breast cancer transcriptomic signature

Kohler, Katharina Theresa, Goldhammer, N., Demharter, S., Pfisterer, U., Khodosevich, Konstantin, Rønnov-Jessen, Lone, Petersen, Ole William, Villadsen, René & Kim, Jiyoung, 2022, I: npj Breast Cancer. 8, 1, 12 s., 81.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Co-evolution of drug resistance and broadened substrate recognition in HIV protease variants isolated from an Escherichia coli genetic selection system

Koivisto, J. M., Poulsen, N. R., Larsen, B. S., Weibull, M. G. M., Stein, Amelie, Doro, F., Winther, Jakob R., Lindorff-Larsen, Kresten & Willemoës, Martin, 2022, I: The Biochemical journal. 479, 4, s. 479-501

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A synthesis of the external morphology of cypridiform larvae of Facetotecta (crustacea: Thecostraca) and the limits of the genus Hansenocaris

Kolbasov, G. A., Savchenko, A. S., Dreyer, N., Chan, B. K. K. & Høeg, Jens Thorvald, 2022, I: Ecology and Evolution. 12, 11, 21 s., e9488.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

External Phosphorus Loading in New Lakes

Kragh, T., Kolath, T., Kolath, A. S., Reitzel, K., Martinsen, K. T., Søndergaard, M., Hoffmann, C. C., Båstrup-Spohr, Lars & Egemose, S., 2022, I: Water. 14, 7, 21 s., 1008.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Removal of chromophoric dissolved organic matter under combined photochemical and microbial degradation as a response to different irradiation intensities

Kragh, T., Sand-Jensen, Kaj, Kristensen, E., Pedersen, Ole & Madsen-Østerbye, M., 2022, I: Journal of Environmental Sciences. 118, s. 76-86

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Comparative Genomic and Metabolomic Analysis of Termitomyces Species Provides Insights into the Terpenome of the Fungal Cultivar and the Characteristic Odor of the Fungus Garden of Macrotermes natalensis Termites

Kreuzenbeck, N. B., Seibel, E., Schwitalla, J. W., Fricke, J., Conlon, B. H., Schmidt, Suzanne, Hammerbacher, A., Köllner, T. G., Poulsen, Michael, Hoffmeister, D., Beemelmanns, C. & Pupo, M. T. (red.), 2022, I: mSystems. 7, 1, 16 s., e01214-21.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Think outside the box: 3D bioprinting concepts for biotechnological applications – recent developments and future perspectives

Krujatz, F., Dani, S., Windisch, J., Emmermacher, J., Hahn, F., Moßhammer, Maria, Murthy, Swathi, Steingröwer, J., Walther, T., Kühl, Michael, Gelinsky, M. & Lode, A., 2022, I: Biotechnology Advances. 58, 20 s., 107930.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The gut hormone Allatostatin C/Somatostatin regulates food intake and metabolic homeostasis under nutrient stress

Kubrak, Olga, Koyama, Takashi, Ahrentløv, Nadja, Jensen, L., Malita, Alina, Naseem, Muhammad Tayyib, Lassen, Mette, Nagy, S., Texada, Michael James, Halberg, Kenneth Veland & Rewitz, Kim, 2022, I: Nature Communications. 13, 17 s., 692.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genomic surveillance of SARS-COV-2 reveals diverse circulating variant lineages in Nairobi and Kiambu Counties, Kenya

Kuja, J. O., Kanoi, B. N., Balboa, Renzo Fidel Ferdinando, Shiluli, C., Maina, M., Waweru, H., Gathii, K., Mungai, M., Masika, M., Anzala, O., Mwau, M., Clark, T. G., Waitumbi, J. & Gitaka, J., 2022, I: BMC Genomics. 23, 1, 8 s., 627.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Characterization of erenumab and rimegepant on calcitonin gene-related peptide induced responses in Xenopus Laevis oocytes expressing the calcitonin gene-related peptide receptor and the amylin-1 receptor

La Cour, S. H., Juhler, K., Kogelman, L. J. A., Olesen, Jes, Klærke, Dan Arne, Kristensen, D. M. & Jansen-Olesen, I., 2022, I: Journal of Headache and Pain. 23, 12 s., 59.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Transcriptional reprogramming during floral fate acquisition

Larrieu, A., Brunoud, G., Guerault, A., Laine, S., Hennet, L., Stigliani, Arnaud, Gildea, I., Just, J., Soubigou-Taconnat, L., Balzergue, S., Davies, B., Scarpella, E., Helariutta, Y., Parcy, F. & Vernoux, T., 2022, I: iScience. 25, 7, 17 s., 104683.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Circumpolar patterns of Arctic freshwater fish biodiversity: A baseline for monitoring

Laske, S. M., Amundsen, P., Christoffersen, Kirsten Seestern, Erkinaro, J., Guðbergsson, G., Hayden, B., Heino, J., Holmgren, K., Kahilainen, K. K., Lento, J., Orell, P., Östergren, J., Power, M., Rafikov, R., Romakkaniemi, A., Svenning, M., Swanson, H., Whitman, M. & Zimmerman, C. E., 2022, I: Freshwater Biology. 67, 1, s. 176-193 18 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Multitrophic biodiversity patterns and environmental descriptors of sub‐Arctic lakes in northern Europe

Lau, D. C. P., Christoffersen, Kirsten Seestern, Erkinaro, J., Hayden, B., Heino, J., Hellsten, S., Holmgren, K., Kahilainen, K. K., Kahlert, M., Karjalainen, S. M., Karlsson, J., Forsström, L., Lento, J., Mjelde, M., Ruuhijärvi, J., Sandøy, S., Schartau, A. K., Svenning, M., Vrede, T. & Goedkoop, W., 2022, I: Freshwater Biology. 67, 1, s. 30-48 19 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Standards recommendations for the Earth BioGenome Project

Lawniczak, M. K. N., Durbin, R., Flicek, P., Lindblad-Toh, K., Wei, X., Archibald, J. M., Baker, W. J., Belov, K., Blaxter, M. L., Bonet, T. M., Childers, A. K., Coddington, J. A., Crandall, K. A., Crawford, A. J., Davey, R. P., Palma, F. D., Fang, Q., Haerty, W., Hall, N., Hoff, K. J. & 25 flere, Howe, K., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Johnson, R. N., Kersey, P. J., Liu, X., Lopez, J. V., Myers, E. W., Pettersson, O. V., Phillippy, A. M., Poelchau, M. F., Pruitt, K. D., Rhie, A., Castilla-Rubio, J. C., Sahu, S. K., Salmon, N. A., Soltis, P. S., Swarbreck, D., Thibaud-Nissen, F., Wang, S., Wegrzyn, J. L., KU, thw266, Zhang, H., Lewin, H. A. & Richards, S., 2022, I: PNAS. 119, 4, 8 s., e2115639118.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Entanglement in a qubit-qubit-tardigrade system

Lee, K. S., Tan, Y. P., Nguyen, L. H., Budoyo, R. P., Park, K. H., Hufnagel, C., Yap, Y. S., Møbjerg, Nadja, Vedral, V., Paterek, T. & Dumke, R., 2022, I: New Journal of Physics. 24, 13 s., 123024.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Temperature and spatial connectivity drive patterns in freshwater macroinvertebrate diversity across the Arctic

Lento, J., Culp, J. M., Levenstein, B., Aroviita, J., Baturina, M. A., Bogan, D., Brittain, J. E., Chin, K., Christoffersen, K. S., Docherty, C., Friberg, N., Ingimarsson, F., Jacobsen, D., Lau, D. C. P., Loskutova, O. A., Milner, A., Mykrä, H., Novichkova, A. A., Ólafsson, J. S., Schartau, A. K. & 2 flere, Shaftel, R. & Goedkoop, W., 2022, I: Freshwater Biology. 67, 1, s. 159-175 17 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Can bryophyte groups increase functional resolution in tundra ecosystems?

Lett, S., Jónsdóttir, I. S., Becker-Scarpitta, A., Christiansen, C. T., During, H., Ekelund, F., Henry, G. H. R., Lang, S. I., Michelsen, A., Rousk, K., Alatalo, J. M., Betway, K. R., Rui, S. B., Callaghan, T., Carbognani, M., Cooper, E. J., Cornelissen, J. H. C., Dorrepaal, E., Egelkraut, D., Elumeeva, T. G. & 20 flere, Haugum, S. V., Hollister, R. D., Jägerbrand, A. K., Keuper, F., Klanderud, K., Lévesque, E., Liu, X., May, J., Michel, P., Mörsdorf, M., Petraglia, A., Rixen, C., Robroek, B. J. M., Rzepczynska, A. M., Soudzilovskaia, N. A., Tolvanen, A., Vandvik, V., Volkov, I., Volkova, I. & Zuijlen, K. V., 2022, I: Arctic Science. 8, 3, 29 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

The Earth BioGenome Project 2020: Starting the clock

Lewin, H. A., Richards, S., Aiden, E. L., Allende, M. L., Archibald, J. M., Bálint, M., Barker, K. B., Baumgartner, B., Belov, K., Bertorelle, G., Blaxter, M. L., Cai, J., Caperello, N. D., Carlson, K., Castilla-Rubio, J. C., Chaw, S. M., Chen, L., Childers, A. K., Coddington, J. A., Conde, D. A. & 65 flere, Corominas, M., Crandall, K. A., Crawford, A. J., DiPalma, F., Durbin, R., Ebenezer, T. E., Edwards, S. V., Fedrigo, O., Flicek, P., Formenti, G., Gibbs, R. A., Gilbert, M Thomas P, Goldstein, M. M., Graves, J. M., Greely, H. T., Grigoriev, I. V., Hackett, K. J., Hall, N., Haussler, D., Helgen, K. M., Hogg, C. J., Isobe, S., Jakobsen, K. S., Janke, A., Jarvis, E. D., Johnson, W. E., Jones, S. J. M., Karlsson, E. K., Kersey, P. J., Kim, J. H., Kress, W. J., Kuraku, S., Lawniczak, M. K. N., Leebens-Mack, J. H., Li, X., Lindblad-Toh, K., Liu, X., Lopez, J. V., Marques-Bonet, T., Mazard, S., Mazet, J. A. K., Mazzoni, C. J., Myers, E. W., O’Neill, R. J., Paez, S., Park, H., Robinson, G. E., Roquet, C., Ryder, O. A., Sabir, J. S. M., Shaffer, H. B., Shank, T. M., Sherkow, J. S., Soltis, P. S., Tang, B., Tedersoo, L., Uliano-Silva, M., Wang, K., Wei, X., Wetzer, R., Wilson, J. L., Xu, X., Yang, H., Yoder, A. D. & KU, thw266, 2022, I: PNAS. 119, 4, 7 s., e2115635118.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Phylogenomic analyses of the genus Drosophila reveals genomic signals of climate adaptation

Li, F., Rane, R. V., Luria, V., Xiong, Z., Chen, J., Li, Z., Catullo, R. A., Griffin, P. C., Schiffer, M., Pearce, S., Lee, S. F., McElroy, K., Stocker, A., Shirriffs, J., Cockerell, F., Coppin, C., Sgrò, C. M., Karger, A., Cain, J. W., Weber, J. A. & 5 flere, Santpere, G., Kirschner, M. W., Hoffmann, A. A., Oakeshott, J. G. & KU, thw266, 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 4, s. 1559-1581 23 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Genomes shed light on the evolution of Begonia, a mega-diverse genus

Li, L., Chen, X., Fang, D., Dong, S., Guo, X., Li, N., Campos-Dominguez, L., Wang, W., Liu, Y., Lang, X., Peng, Y., Tian, D., Thomas, D. C., Mu, W., Liu, M., Wu, C., Yang, T., Zhang, S., Yang, L., Yang, J. & 23 flere, Liu, Z., Zhang, L., Zhang, X., Chen, F., Jiao, Y., Guo, Y., Hughes, M., Wang, W., Liu, X., Zhong, C., Li, A., Sahu, S. K., Yang, H., Wu, E., Sharbrough, J., Lisby, Michael, Liu, X., Xu, X., Soltis, D. E., Van de Peer, Y., Kidner, C., Zhang, S. & Liu, Huan, 2022, I: New Phytologist. 234, 1, s. 295-310 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

De Novo Assembly of 20 Chicken Genomes Reveals the Undetectable Phenomenon for Thousands of Core Genes on Microchromosomes and Subtelomeric Regions

Li, M., Sun, C., Xu, N., Bian, P., Tian, X., Wang, X., Wang, Y., Jia, X., Heller, R., Wang, M., Wang, F., Dai, X., Luo, R., Guo, Y., Wang, X., Yang, P., Hu, D., Liu, Z., Fu, W., Zhang, S. & 10 flere, Li, X., Wen, C., Lan, F., Siddiki, A. Z., Suwannapoom, C., Zhao, X., Nie, Q., Hu, X., Jiang, Y. & Yang, N., 2022, I: Molecular Biology and Evolution. 39, 4, 16 s., msac066.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Functional genomics analysis reveals the evolutionary adaptation and demographic history of pygmy lorises

Li, M. L., Wang, S., Xu, P., Tian, H. Y., Bai, M., Zhang, Y. P., Shao, Y., Xiong, Z. J., Qi, X. G., Cooper, D. N., KU, thw266, Zhu, H. H. & Wu, D. D., 2022, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 119, 40, 10 s., e2123030119.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Re-visiting soil carbon and nitrogen stocks in a temperate heathland seven years after the termination of free air CO₂ enrichment (FACE)

Li, Qiaoyan, Ambus, Per Lennart, Michelsen, Anders, Schmidt, Inger Kappel, Beier, Claus, Dietzen, Christiana Amalie, Reinsch, S., Arndal, M. F. & Larsen, Klaus Steenberg, 2022, I: Geoderma. 428, 7 s., 116185.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A single-cell transcriptomic atlas tracking the neural basis of division of labour in an ant superorganism

Li, Q., Wang, M., Zhang, P., Liu, Y., Guo, Q., Zhu, Y., Wen, T., Dai, X., Zhang, X., Nagel, M., Dethlefsen, B. H., Xie, N., Zhao, J., Jiang, W., Han, L., Wu, L., Zhong, W., Wang, Z., Wei, X., Dai, W. & 9 flere, Liu, L., Xu, X., Lu, H., Yang, H., Wang, J., Boomsma, Jacobus J., Liu, C., KU, thw266 & Liu, W., 2022, I: Nature Ecology & Evolution. 6, 8, s. 1191-1204

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A catalog of 48,425 nonredundant viruses from oral metagenomes expands the horizon of the human oral virome

Li, S., Guo, R., Zhang, Y., Li, P., Chen, F., Wang, X., Li, J., Jie, Zhuye, Lv, Q., Jin, H., Wang, G. & Yan, Q., 2022, I: iScience. 25, 6, 18 s., 104418.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A simple, rapid, and practical method for single-cell proteomics based on mass-adaptive coating of synthetic peptides

Li, S., Su, K., Zhuang, Z., Qin, Q., Gao, L., Deng, Y., Liu, X., Hou, G., Wang, L., Hao, P., Yang, H., Liu, S., Zhu, H. & Ren, Y., 2022, I: Science Bulletin. 67, 6, s. 581-584 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Metagenomic evidence for co-occurrence of antibiotic, biocide and metal resistance genes in pigs

Li, Xuan Ji, Rensing, C., Vestergaard, G., Arumugam, Mani, Nesme, Joseph, Gupta, S., Brejnrod, A. D. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Environment International. 158, 10 s., 106899.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Draft genome assemblies of four manakins

Li, X., Gao, R., Chen, G., Price, A. L., Øksnebjerg, Daniel Bilyeli, Hosner, Peter Andrew, Zhou, Y., KU, thw266 & Feng, S., 2022, I: Scientific Data. 9, 11 s., 564.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Origin and Deep Evolution of Human Endogenous Retroviruses in Pan-Primates

Li, Y., KU, thw266 & Cui, J., 2022, I: Viruses. 14, 7, 14 s., 1370.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Multi-omics analyses of serum metabolome, gut microbiome and brain function reveal dysregulated microbiota-gut-brain axis in bipolar depression

Li, Z., Lai, J., Zhang, P., Ding, J., Jiang, J., Liu, C., Huang, H., Zhen, H., Xi, C., Sun, Y., Wu, L., Wang, L., Gao, X., Li, Y., Fu, Y., Jie, Z., Li, S., Zhang, D., Chen, Y., Zhu, Y. & 15 flere, Lu, S., Lu, J., Wang, D., Zhou, H., Yuan, X., Li, X., Pang, L., Huang, M., Yang, H., Zhang, W., Brix, S., Kristiansen, Karsten, Song, X., Nie, C. & Hu, S., 2022, I: Molecular Psychiatry. 27, 1, 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Context dependency of nucleotide probabilities and variants in human DNA

Liang, Yuhu, Grønbæk, Christian, Fariselli, P. & Krogh, Anders, 2022, I: BMC Genomics. 23, 1, 15 s., 87.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Transcription of the Alginate Operon in Pseudomonas aeruginosa Is Regulated by c-di-GMP

Liang, Z., Rybtke, Morten Levin, Kragh, K. N., Johnson, O., Schicketanz, Muriel Leandra, Zhang, Yong, Andersen, Jens Bo & Tolker-Nielsen, Tim, 2022, I: Microbiology Spectrum. 10, 4, 13 s., e00675-22.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The structure-function relationship of Pseudomonas aeruginosa in infections and its influence on the microenvironment

Lichtenberg, Mads, Jakobsen, Tim Holm, Kühl, Michael, Kolpen, Mette, Jensen, Peter Østrup & Bjarnsholt, Thomas, 2022, I: FEMS Microbiology Reviews. 46, 5, 13 s., fuac018.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Nitrogen-fixing sulfate reducing bacteria in shallow coastal sediments under simulated resuspension

Liesirova, T., Aarenstrup-Launbjerg, T., Hallstrøm, S., Bittner, Meriel Jennifer, Riemann, Lasse & Voss, M., 2022, I: Estuarine, Coastal and Shelf Science. 280, 11 s., 108165.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Biosynthesis of Guanitoxin Enables Global Environmental Detection in Freshwater Cyanobacteria

Lima, S. T., Fallon, T. R., Cordoza, J. L., Chekan, J. R., Delbaje, E., Hopiavuori, A. R., Alvarenga, Danillo Oliveira, Wood, S. M., Luhavaya, H., Baumgartner, J. T., Dörr, F. A., Etchegaray, A., Pinto, E., McKinnie, S. M. K., Fiore, M. F. & Moore, B. S., 2022, I: Journal of the American Chemical Society. 144, 21, s. 9372-9379

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Urinary Proteomics Identifies Cathepsin D as a Biomarker of Rapid eGFR Decline in Type 1 Diabetes

Limonte, C. P., Valo, E., Drel, V., Natarajan, L., Darshi, M., Forsblom, C., Henderson, C. M., Hoofnagle, A. N., Ju, W., Kretzler, M., Montemayor, D., Nair, V., Nelson, R. G., O’toole, J. F., Toto, R. D., Rosas, S. E., Ruzinski, J., Sandholm, N., Schmidt, I. M., Vaisar, T. & 12 flere, Waikar, S. S., Zhang, J., Rossing, Peter, Ahluwalia, Tarun Veer Singh, Groop, P. H., Pennathur, S., Snell-Bergeon, J. K., Costacou, T., Orchard, T. J., Sharma, K., de Boer, I. H. & Kidney Precision Medicine Project, K. P. M. P., 2022, I: Diabetes Care. 45, 6, s. 1416-1427 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Probing the genomic limits of de-extinction in the Christmas Island rat

Lin, J., Duchene, David, Carøe, C., Smith, O., Ciucani, M. M., Niemann, Jonas, Richmond, D., Greenwood, A. D., MacPhee, R., KU, thw266, Gopalakrishnan, Shyam & Gilbert, M Thomas P, 2022, I: Current Biology. 32, 7, s. 1650-1656.e3

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Synergy between Mecillinam and Ceftazidime/Avibactam or Avibactam against Multi-Drug-Resistant Carbapenemase-Producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae

List, K. K., Kolpen, Mette, Kragh, K. N., Charbon, Godefroid, Radmer, S., Hansen, F., Løbner-Olesen, Anders, Frimodt-Møller, N. & Hertz, F. B., 2022, I: Antibiotics. 11, 10, 13 s., 1280.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafish embryogenesis

Liu, C., Li, R., Li, Y., Lin, X., Zhao, K., Liu, Q., Wang, S., Yang, X., Shi, X., Ma, Y., Pei, C., Wang, H., Bao, W., Hui, J., Yang, T., Xu, Z., Lai, T., Berberoglu, M. A., Sahu, S. K., Esteban, M. A. & 8 flere, Ma, K., Fan, G., Li, Y., Liu, S., CHEN, Ao, Xu, X., Dong, Z. & Liu, L., 2022, I: Developmental Cell. 57, 10, s. 1284-1298.e5

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Conserved signalling components coordinate epidermal patterning and cuticle deposition in barley

Liu, L., Jose, S. B., Campoli, C., Bayer, M. M., Sánchez-Diaz, M. A., McAllister, T., Zhou, Y., Eskan, M., Milne, L., Schreiber, M., Batstone, T., Bull, I. D., Ramsay, L., von Wettstein, Penny, Waugh, R., Hetherington, A. M. & McKim, S. M., 2022, I: Nature Communications. 13, 18 s., 6050.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

One Health Analysis of mcr-Carrying Plasmids and Emergence of mcr-10.1 in Three Species of Klebsiella Recovered from Humans in China

Liu, M. C., Jian, Z., Liu, W., Li, J. & Pei, N., 2022, I: Microbiology Spectrum. 10, 6, 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

DNA Motifs and an Accessory CRISPR Factor Determine Cas1 Binding and Integration Activity in Sulfolobus islandicus

Liu, T., Xu, Y., Wang, X., Ye, Q., Liu, Z., Zhang, Z., Liu, J., Yang, Y., Peng, Xu & Peng, N., 2022, I: International Journal of Molecular Sciences . 23, 17, 15 s., 10178.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Origin and expansion of the world’s most widespread pinniped: Range-wide population genomics of the harbour seal (Phoca vitulina)

Liu, X., Schjøtt, S. R., Granquist, S. M., Rosing-Asvid, A., Dietz, R., Teilmann, J., Galatius, A., Cammen, K., O’Corry-Crowe, G., Harding, K., Härkönen, T., Hall, A., Carroll, E. L., Kobayashi, Y., Hammill, M., Stenson, G., Kirstine Frie, A., Lydersen, C., Kovacs, K. M., Andersen, L. W. & 6 flere, Hoffman, J. I., Goodman, S. J., Vieira, Filipe Garrett, Heller, Rasmus, Moltke, Ida & Olsen, Morten Tange, 2022, I: Molecular Ecology. 31, 6, s. 1682-1699

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Dissection of Functional Domains of Orc1-2, the Archaeal Global DNA Damage-Responsive Regulator

Liu, X., Sun, M., Xu, R., Shen, Y., Huang, Q., Feng, X. & She, Q., 2022, I: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 16 s., 14609.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The moss traits that rule cyanobacterial colonization

Liu, X. & Rousk, Kathrin, 2022, I: Annals of Botany. 129, 2, s. 147-160 14 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

The Cycas genome and the early evolution of seed plants

Liu, Y., Wang, S., Li, L., Yang, T., Dong, S., Wei, T., Wu, S., Liu, Y., Gong, Y., Feng, X., Ma, J., Chang, G., Huang, J., Yang, Y., Wang, H., Liu, M., Xu, Y., Liang, H., Yu, J., Cai, Y. & 45 flere, Zhang, Z., Fan, Y., Mu, W., Sahu, S. K., Liu, S., Lang, X., Yang, L., Li, N., Habib, S., Yang, Y., Lindstrom, A. J., Liang, P., Goffinet, B., Zaman, S., Wegrzyn, J. L., Li, D., Liu, J., Cui, J., Sonnenschein, E. C., Wang, X., Ruan, J., Xue, J., Shao, Z., Song, C., Fan, G., Li, Z., Zhang, L., Liu, J., Liu, Z., Jiao, Y., Wang, X., Wu, H., Wang, E., Lisby, Michael, Yang, H., Wang, J., Liu, X., Xu, X., Li, N., Soltis, P. S., Van de Peer, Y., Soltis, D. E., Gong, X., Liu, H. & Zhang, S., 2022, I: Nature Plants. 8, 4, s. 389-401 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Circle-Seq reveals genomic and disease-specific hallmarks in urinary cell-free extrachromosomal circular DNAs

Lv, W., Pan, X., Han, P., Wang, Z., Feng, W., Xing, X., Wang, Q., Qu, K., Zeng, Y., Zhang, C., Xu, Z., Li, Y., Zheng, T., Lin, L., Liu, C., Liu, X., Li, H., Henriksen, R. A., Bolund, L., Lin, L. & 7 flere, Jin, X., Yang, H., Zhang, X., Yin, T., Regenberg, Birgitte, He, F. & Luo, Y., 2022, I: Clinical and Translational Medicine. 12, 4, 16 s., e817.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Horizontal Gene Transfer of an IncP1 Plasmid to Soil Bacterial Community Introduced by Escherichia coli through Manure Amendment in Soil Microcosms

Macedo, G., Olesen, Asmus Kalckar, Maccario, Lorrie, Leal, L. H., v. d. Maas, P., Heederik, D., Mevius, D., Sørensen, Søren Johannes & Schmitt, H., 2022, I: Environmental Science & Technology. 56, 16, s. 11398-11408 11 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Nutrient Availability Does Not Affect Community Assembly in Root-Associated Fungi but Determines Fungal Effects on Plant Growth

Maciá-Vicente, J. G., Bai, B., Qi, R., Ploch, S., Breider, F. & Thines, M., 2022, I: mSystems. 7, 3, 14 s., e00304-22.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

PPARγ lipodystrophy mutants reveal intermolecular interactions required for enhancer activation

Madsen, M. S., Broekema, M. F., Madsen, M. R., Koppen, A., Borgman, A., Grawe, C., Thomsen, E. G. K., Westland, D., Kranendonk, M. E. G., Koerkamp, M. G., Hamers, N., Bonvin, A. M. J. J., Pittol, J. M. R., Natarajan, K. N., Kersten, S., Holstege, F. C. P., Monajemi, H., van Mil, S. W. C., Vermeulen, M., Kragelund, B. B. & 3 flere, Cassiman, D., Mandrup, S. & Kalkhoven, E., 2022, I: Nature Communications. 13, 19 s., 7090.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

ATP signaling in pancreatic cancer: the P2X7 receptor

Magni, Lara, Bouazzi, R., Christensen, Nynne, Tozzi, M., Poulsen, M., Johansen, J., Pless, Stephan & Novak, Ivana, 2022, I: Acta Physiologica. 236, S725, s. 661-661

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

Cross-species discrimination of vocal expression of emotional valence by Equidae and Suidae

Maigrot, A., Hillmann, E. & Briefer, Elodie, 2022, I: BMC Biology. 20, 14 s., 106.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Mesenchymal-epithelial crosstalk shapes intestinal regionalisation via Wnt and Shh signalling

Maimets, Martti, Pedersen, M. T., Guiu, J., Dreier, J., Thodberg, Malte, Antoku, Yasuko, Schweiger, P. J., Rib, Leonor, Bardini Bressan, Raul, Miao, Y., Garcia, K. C., Sandelin, Albin Gustav, Serup, Palle & Jensen, Kim Bak, 2022, I: Nature Communications. 13, 12 s., 715.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Influence of sewage sludge stabilization method on microbial community and the abundance of antibiotic resistance genes

Major, N., Jechalke, S., Nesme, Joseph, Goreta Ban, S., Černe, M., Sørensen, Søren Johannes, Ban, D., Grosch, R., Schikora, A. & Schierstaedt, J., 2022, I: Waste Management. 154, s. 126-135 10 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A gut-derived hormone suppresses sugar appetite and regulates food choice in Drosophila

Malita, Alina, Kubrak, Olga, Koyama, Takashi, Ahrentløv, Nadja, Texada, Michael James, Nagy, S., Halberg, Kenneth Veland & Rewitz, Kim, 2022, I: Nature Metabolism. 4, 11, s. 1532-1550 19 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

A complete, telomere-to-telomere human genome sequence presents new opportunities for evolutionary genomics

Mao, Y. & KU, thw266, 2022, I: Nature Methods. 19, 6, s. 635-638 4 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt

CRISPR-Cas12a targeting of ssDNA plays no detectable role in immunity

Marino, N. D., Pinilla Redondo, Rafael & Bondy-Denomy, J., 2022, I: Nucleic acids symposium series. 50, 11, s. 6414-6422 9 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Lipolysis regulates major transcriptional programs in brown adipocytes

Markussen, L. K., Rondini, E. A., Johansen, O. S., Madsen, J. G. S., Sustarsic, E. G., Marcher, A. B., Hansen, Jacob B., Gerhart-Hines, Zach, Granneman, J. G. & Mandrup, S., 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 16 s., 3956.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Structure, dynamics, and stability of the globular domain of human linker histone H1.0 and the role of positive charges

Martinsen, J. H., Saar, Daniel, Fernandes, Catarina, Schuler, B., Bugge, K. & Kragelund, Birthe Brandt, 2022, I: Protein Science. 31, 4, s. 918-932 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt