- 2022
- Udgivet
The Behaviour of Short Linear Motifs in the DREB2A Transcription Factor and the Effect of Molecular Context
Theisen, Frederik Friis, 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 160 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
αα-hub coregulator structure and flexibility determine transcription factor binding and selection in regulatory interactomes
Theisen, Frederik Friis, Salladini, Edoardo, Davidsen, R., Rasmussen, C. J., Staby, L., Kragelund, Birthe Brandt & Skriver, Karen, 2022, I: Journal of Biological Chemistry. 298, 6, 16 s., 101963.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
PAMP-triggered genetic reprogramming involves widespread alternative transcription initiation and an immediate transcription factor wave
Thieffry, A., López Márquez, Diego, Lange, Jette Bornholdt, Gholami Malekroudi, M., Bressendorff, Simon, Barghetti, A., Sandelin, Albin Gustav & Brodersen, Peter, 2022, I: The Plant Cell. 34, 7, 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conformational ensembles of intrinsically disordered proteins and flexible multidomain proteins
Thomasen, Emil & Lindorff-Larsen, Kresten, 2022, I: Biochemical Society Transactions. 50, 1, s. 541-554 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Improving Martini 3 for Disordered and Multidomain Proteins
Thomasen, Emil, Pesce, Francesco, Roesgaard, M. A., Tesei, Giulio & Lindorff-Larsen, Kresten, 2022, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 18, 4, s. 2033-2041 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effects of Lifetime Exposures to Environmental Contaminants on the Adult Gut Microbiome
Thompson, K. N., Oulhote, Y., Weihe, P., Wilkinson, J. E., Ma, S., Zhong, H., Li, J., Kristiansen, Karsten, Huttenhower, C. & Grandjean, P., 2022, I: Environmental Science & Technology. 56, 23, s. 16985-16995 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Asthma and Wheeze Severity and the Oropharyngeal Microbiota in Children and Adolescents
Thorsen, J., Stokholm, J., Rasmussen, M. A., Roggenbuck-Wedemeyer, M., Vissing, N. H., Mortensen, M. S., Brejnrod, A. D., Fleming, L., Bush, A., Roberts, G., Singer, F., Frey, U., Hedlin, G., Nordlund, B., Murray, C. S., Abdel-Aziz, M. I., Hashimoto, S., van Aalderen, W., Maitland-van der Zee, A. H., Shaw, D. & 13 flere, , 2022, I: Annals of the American Thoracic Society. 19, 12, s. 2031-2043 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Benchmarking freely available HLA typing algorithms across varying genes, coverages and typing resolutions
Thuesen, N. H., Klausen, M. S., Gopalakrishnan, Shyam, Trolle, T. & Renaud, Gabriel, 2022, I: Frontiers in Immunology. 13, 15 s., 987655.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models
Thumuluri, V., Almagro Armenteros, J. J., Johansen, A. R., Nielsen, H. & Winther, Ole, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, W1, s. W228-W234Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Whole-genome sequence of the planarian Dugesia japonica combining Illumina and PacBio data
Tian, Q., Guo, Q., Guo, Y., Luo, L., Kristiansen, Karsten, Han, Z., Fang, H. & Zhang, S., 2022, I: Genomics. 114, 2, 10 s., 110293.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomics resolves ambiguous relationships within Aciculata (Errantia, Annelida)
Tilic, E., Stiller, Josefin, Campos, E., Pleijel, F. & Rouse, G. W., 2022, I: Molecular Phylogenetics and Evolution. 166, 10 s., 107339.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Characterization of Divalent Cation Interactions with AASTY Nanodiscs
Timcenko, Milena, Autzen, A. A. A. & Autzen, Henriette Elisabeth, 2022, I: ACS Applied Polymer Materials. 4, 2, s. 1071-1083Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Successful treatment of psoriasis with adalimumab induced no changes in the gut microbiota
Todberg, T., Egeberg, Alexander, Zachariae, Claus, Sørensen, N., Pedersen, Oluf Borbye & Skov, Lone, 2022, I: Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology. 36, 6, s. e464-e467 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning
- Udgivet
A haplotype-resolved genome assembly of the Nile rat facilitates exploration of the genetic basis of diabetes
Toh, H., Yang, C., Formenti, G., Raja, K., Yan, L., Tracey, A., Chow, W., Howe, K., Bergeron, L. A., Zhang, G., Haase, B., Mountcastle, J., Fedrigo, O., Fogg, J., Kirilenko, B., Munegowda, C., Hiller, M., Jain, A., Kihara, D., Rhie, A. & 9 flere, , 2022, I: BMC Biology. 20, 21 s., 245.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Deciphering bacteria associated with a pre-parasitic stage of the root-knot nematode Meloidogyne hapla in nemato-suppressive and nemato-conducive soils
Topalović, O., Santos, S. S., Heuer, H., Nesme, Joseph, Kanfra, X., Hallmann, J., Sørensen, Søren Johannes & Vestergård, M., 2022, I: Applied Soil Ecology. 172, 9 s., 104344.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Conserved conformational dynamics determine enzyme activity
Torgeson, K. R., Clarkson, M. W., Granata, D., Lindorff-Larsen, Kresten, Page, R. & Peti, W., 2022, I: Science Advances. 8, 31, 10 s., eabo5546.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
On Single-Cell Enzyme Assays in Marine Microbial Ecology and Biogeochemistry
Traving, Sachia Jo, Balmonte, J. P., Seale, D., Arnosti, C., Glud, R. N., Hallam, S. J. & Middelboe, Mathias, 2022, I: Frontiers in Marine Science. 9, 9 s., 846656.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diet and food selection by fish larvae in turbid and clear water shallow temperate lakes
Trochine, C., Risholt, C., Schou, M. O., Lauridsen, T. L., Jacobsen, L., Skov, C., Søndergaard, M., Berg, S., Christoffersen, Kirsten Seestern & Jeppesen, E., 2022, I: Science of the Total Environment. 804, 12 s., 150050.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The role of water coordination in the pH-dependent gating of hAQP10
Truelsen, S. F., Missel, Julie Winkel, Gotfryd, K., Pedersen, Per Amstrup, Gourdon, Pontus Emanuel, Lindorff-Larsen, Kresten & Hélix-Nielsen, C., 2022, I: B B A - Biomembranes. 1864, 1, 13 s., 183809.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Heat waves affect prey and predators differently via developmental plasticity: who may benefit most from global warming?
Tscholl, T., Nachman, Gøsta Støger, Spangl, B. & Walzer, A., 2022, I: Pest Management Science. 78, 3, s. 1099-1108 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The use of paracetamol during pregnancy: A qualitative study and possible strategies for a clinical trial
Vedel, C., Jørgensen, D. S., Kristensen, D. M., Petersen, Olav Bennike Bjørn & Greisen, Gorm, 2022, I: PLoS ONE. 17, e0271537.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nuclear and cytoplasmic RNA exosomes and PELOTA1 prevent miRNA-induced secondary siRNA production in Arabidopsis
Vigh, Maria Louisa, Bressendorff, Simon, Thieffry, A., Arribas Hernandez, Laura & Brodersen, Peter, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 3, s. 1396-1415 20 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Mechanisms Underlying siRNA Amplification in Arabidopsis thaliana
Vigh, Maria Louisa, 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 201 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
The drivers of avian-haemosporidian prevalence in tropical lowland forests of New Guinea in three dimensions
Vinagre-Izquierdo, C., Bodawatta, Kasun Harshana, Chmel, K., Renelies-Hamilton, J., Paul, L., Munclinger, P., Poulsen, Michael & Jønsson, Knud Andreas, 2022, I: Ecology and Evolution. 12, 2, 14 s., e8497.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Production of an Active, Human Membrane Protein in Saccharomyces cerevisiae: Full-Length FICD
Virolainen, M. S., Søltoft, C. L., Pedersen, Per Amstrup & Ellgaard, Lars, 2022, I: International Journal of Molecular Sciences. 23, 5, 17 s., 2458.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Appraisal of a novel fishery of whelks (Buccinum undatum) in Danish waters
Vismann, Bent, Nielsen, J. W. & Ronfeldt, J. L., 2022, I: Regional Studies in Marine Science. 56, 11 s., 102710.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genetics of early-life head circumference and genetic correlations with neurological, psychiatric and cognitive outcomes
Vogelezang, S., Bradfield, J. P., Early Growth Genetics Consortium, Ahluwalia, T. V. S., Liu, X., Schnurr, T. M., Frithioff-Bøjsøe, C., Bønnelykke, K., Lind, M. V., Lauritzen, L., Michaelsen, K. F., Lund, M. A. V., Melbye, M., Morgen, C. S., Pedersen, O. B., Holm, J-C., Grarup, N., Hansen, T., Nohr, E. A., Bisgaard, H. & 3 flere, , 2022, I: BMC Medical Genomics. 15, 16 s., 124.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Trans- and Within-Generational Developmental Plasticity May Benefit the Prey but Not Its Predator during Heat Waves
Walzer, A., Nachman, Gøsta Støger, Spangl, B., Stijak, M. & Tscholl, T., aug. 2022, I: Biology. 11, 8, 20 s., 1123.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
CReSIL: accurate identification of extrachromosomal circular DNA from long-read sequences
Wanchai, V., Jenjaroenpun, P., Leangapichart, T., Arrey Tané, Gerard, Burnham, C. M., Tümmler, M. C., Delgado-Calle, J., Regenberg, Birgitte & Nookaew, I., 2022, I: Briefings in Bioinformatics. 23, 6, 11 s., bbac422.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
In vitro digestion mimicking conditions in young and elderly reveals marked differences between profiles and potential bioactivity of peptides from meat and soy proteins
Wang, Chong, Zhao, Fan, Bai, Y., Li, C., Xu, X., Kristiansen, Karsten & Zhou, G., 2022, I: Food Research International. 157, 11 s., 111215.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effect of gastrointestinal alterations mimicking elderly conditions on in vitro digestion of meat and soy proteins
Wang, Chong, Zhao, Fan, Bai, Y., Li, C., Xu, X., Kristiansen, Karsten & Zhou, G., 2022, I: Food Chemistry. 383, 9 s., 132465.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomic Analysis of the Protective Effect of Eriodictyol on Benzo(a)pyrene-Induced Caco-2 Cytotoxicity
Wang, Chong, Zhao, Fan, Bai, Y., Li, C., Xu, X., Kristiansen, Karsten & Zhou, G., 2022, I: Frontiers in Nutrition. 9, 14 s., 839364.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level
Wang, F., Ding, P., Liang, X., Ding, X., Brandt, C. B., Sjöstedt, E., Zhu, J., Bolund, S., Zhang, L., de Rooij, L. P. M. H., Luo, L., Wei, Y., Zhao, W., Lv, Z., Haskó, J., Li, R., Qin, Q., Jia, Y., Wu, W., Yuan, Y. & 25 flere, , 2022, I: Nature Communications. 13, 18 s., 3620.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A draft genome of the medicinal plant Cremastra appendiculata (D. Don) provides insights into the colchicine biosynthetic pathway
Wang, J., Xie, J., Chen, H., Qiu, X., Cui, H., Liu, Y., Sahu, S. K., Fang, D., Li, T., Wang, M., Chen, Y., Liu, Huan, Zhang, J. & Wang, B., 2022, I: Communications Biology . 5, 12 s., 1294.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An easily modifiable conjugative plasmid for studying horizontal gene transfer
Wang, Q., Olesen, Asmus Kalckar, Maccario, Lorrie & Madsen, Jonas Stenløkke, 2022, I: Plasmid. 123-124, 10 s., 102649.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The maintenance and spread of cooperative antibiotic resistance
Wang, Q., 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 280 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Combined berberine and probiotic treatment as an effective regimen for improving postprandial hyperlipidemia in type 2 diabetes patients: a double blinded placebo controlled randomized study
Wang, S., Ren, H., Zhong, H., Zhao, X., Li, C., Ma, J., Gu, X., Xue, Y., Huang, S., Yang, J., Chen, L., Chen, G., Qu, S., Liang, J., Qin, L., Huang, Q., Peng, Y., Li, Q., Wang, X., Zou, Y. & 10 flere, , 2022, I: Gut Microbes. 14, 1, 18 s., 2003176.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The chromosome-scale genomes of Dipterocarpus turbinatus and Hopea hainanensis (Dipterocarpaceae) provide insights into fragrant oleoresin biosynthesis and hardwood formation
Wang, S., Liang, H., Wang, H., Li, L., Xu, Y., Liu, Y., Liu, M., Wei, J., Ma, T., Le, C., Yang, J., He, C., Liu, J., Zhao, J., Zhao, Y., Lisby, Michael, Sahu, S. K. & Liu, H., 2022, I: Plant Biotechnology Journal. 20, 3, s. 538-553 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Too much of a good thing? Inorganic nitrogen (N) inhibits moss-associated N2 fixation but organic N can promote it
Wang, Y., Lett, Signe & Rousk, Kathrin, 2022, I: Biogeochemistry. 159, 2, s. 179-191 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Understanding Yeast Phenotypes via the Evolution of Synthetic Genome
Wang, Y., 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 222 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Transcriptomic signatures responding to PKM2 activator TEPP-46 in the hyperglycemic human renal proximal epithelial tubular cells
Wang, Z., Yu, J., Hao, Dan, Liu, X. & Wang, X., 2022, I: Frontiers in Endocrinology. 13, 16 s., 965379.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogeny and sex chromosome evolution of palaeognathae
Wang, Z., Zhang, J., Xu, X., Witt, C., Deng, Y., Chen, G., Meng, G., Feng, S., Xu, L., Szekely, T., KU, thw266 & Zhou, Q., 2022, I: Journal of Genetics and Genomics. 49, 2, s. 109-119 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Pseudoreplication in genomics-scale data sets
Waples, R. S., Waples, R. K. & Ward, E. J., 2022, I: Molecular Ecology Resources. 22, 2, s. 503-518 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Impact of intensive lifestyle intervention on gut microbiota composition in type 2 diabetes: a post-hoc analysis of a randomized clinical trial
Wei, S., Brejnrod, A. D., Trivedi, Urvish, Mortensen, M. S., Johansen, M. Y., Karstoft, Kristian, Vaag, A. A., Ried-Larsen, M. & Sørensen, Søren Johannes, 2022, I: Gut Microbes. 14, 1, 15 s., 2005407.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Single-cell Stereo-seq reveals induced progenitor cells involved in axolotl brain regeneration
Wei, X., Fu, S., Li, H., Liu, Y., Wang, S., Feng, W., Yang, Y., Liu, X., Zeng, Y-Y., Cheng, M., Lai, Y., Qiu, X., Wu, L., Zhang, N., Jiang, Y., Xu, J., Su, X., Peng, C., Han, L., Lou, W. P-K. & 16 flere, , 2022, I: Science. 377, 6610, 10 s., eabp9444.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of Potential Peptide Marker(s) for Evaluating Pork Meat Freshness via Mass Spectrometry-Based Peptidomics during Storage under Different Temperatures
Wei, Z., Dai, C., Bassey, A. P., Tang, C., Han, Y., Wang, Chong & Zhou, G., 2022, I: Foods. 11, 8, 14 s., 1144.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Key Knowledge Gaps to Fill at the Cell-To-Ecosystem Level in Marine B-Vitamin Cycling
Wienhausen, G., Bittner, Meriel Jennifer & Paerl, R. W., 2022, I: Frontiers in Marine Science. 9, 9 s., 876726.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Physiological responses of narwhals to anthropogenic noise: A case study with seismic airguns and vessel traffic in the Arctic
Williams, T. M., Blackwell, S. B., Tervo, O., Garde, E., Sinding, Mikkel Holger Strander, Richter, B. & Heide-Jørgensen, M. P., 2022, I: Functional Ecology. 36, 9, s. 2251-2266 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Does childhood exposure to biodiverse greenspace reduce the risk of developing asthma?
Winnicki, M. H., Dunn, R. R., Winther-Jensen, M., Jess, T., Allin, K. H. & Bruun, Hans Henrik, 2022, I: Science of the Total Environment. 850, 11 s., 157853.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
(180-183) Proposals to amend Article 40.1 and Article 44.1 and to add a new Article 44.3 and a Note to facilitate the valid publication of names of "dinoflagellates"
Woelkerling, W. J. & Moestrup, Øjvind, 2022, I: Taxon. 71, 6, s. 1337-1338 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning
- Udgivet
Biosolids for safe land application: does wastewater treatment plant size matters when considering antibiotics, pollutants, microbiome, mobile genetic elements and associated resistance genes?
Wolters, B., Hauschild, K., Blau, K., Mulder, I., Heyde, B. J., Sørensen, Søren Johannes, Siemens, J., Jechalke, S., Smalla, K. & Nesme, Joseph, 2022, I: Environmental Microbiology. 24, 3, s. 1573-1589 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Initiation of the Primate Genome Project
Wu, D., Qi, X., Yu, L., Li, M., Liu, Z., Yoder, A. D., Roos, C., Hayakawa, T., Rogers, J., Marques-Bonet, T., Su, B., Yao, Y., Zhang, Y. & KU, thw266, 2022, I: Zoological research. 43, 2, s. 147-149 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Computational identification of signals predictive for nuclear RNA exosome degradation pathway targeting
Wu, M., Schmid, M., Jensen, T. H. & Sandelin, Albin Gustav, 2022, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 4, 3, 18 s., lqac071.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The sensitivity of ginkgo leaf unfolding to the temperature and photoperiod decreases with increasing elevation
Wu, Z., Lin, C., Wang, S., Gong, Y., Fu, Y. H., Tang, Jing, De Boeck, H. J., Vitasse, Y. & Zhao, Y., 2022, I: Agricultural and Forest Meteorology. 315, 8 s., 108840.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nanopore-based long-read metagenomics uncover the resistome intrusion by antibiotic resistant bacteria from treated wastewater in receiving water body
Wu, Bruce, Che, Y., Dang, C., Zhang, M., Zhang, X., Sun, Y., Li, X., Zhang, T. & Xia, Y., 2022, I: Water Research. 226, 10 s., 119282.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Novel Sequencing Approaches for the High-Throughput Identification of Full-length Poly(A) RNA Transcripts at the Single-cell Level
XIE, Z., 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 88 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Hypoxia in tomato fruit during ripening caused by contrasting tissue-specific diffusion resistance and respiration
Xiao, H., Tong, Shuai, Salagovic, J., Pedersen, Ole, Verboven, P. & Nicolaï, B. M., 2022, s. 48.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Chord: an ensemble machine learning algorithm to identify doublets in single-cell RNA sequencing data
Xiong, K., Zhou, H., Lin, C., Yin, J., Kristiansen, Karsten, Yang, H. & Li, G., 2022, I: Communications Biology . 5, 11 s., 510.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Survival and Genome Diversity of Vibrio parahaemolyticus Isolated from Edible Aquatic Animals
Xu, D., Peng, Xu, Xie, L. & Chen, L., 2022, I: Diversity. 14, 5, 23 s., 350.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Transcriptomic Profile of the Mouse Postnatal Liver Development by Single-Nucleus RNA Sequencing
Xu, J., Hao, S., Shi, Q., Deng, Q., Jiang, Y., Guo, P., Yuan, Y., Shi, X., Shangguan, S., Zheng, H., Lai, G., Huang, Y., Wang, Y., Song, Y., Liu, Y., Wu, L., Wang, Z., Cheng, J., Wei, X., Cheng, M. & 6 flere, , 2022, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 11 s., 833392.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Genomic and microbial factors affect the prognosis of anti-pd-1 immunotherapy in nasopharyngeal carcinoma
Xu, L., Ma, Y., Fang, Chao, Peng, Z., Gao, F., Moll, J. M., Qin, S., Yu, Q., Hou, Y., Kristiansen, Karsten, Fang, W., Brix, S. & Zhang, L., 2022, I: Frontiers in Oncology. 12, 11 s., 953884.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Two novel truncating variants of the ASPM gene identified in a nonconsanguineous Chinese family associated with primary microcephaly
Xu, S., Zhang, W., Zhou, R., Huang, H., Chen, W., Xiang, W., Liu, L. & Song, J., 2022, I: Clinical Dysmorphology. 31, 1, s. 1-5 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Molecular mechanisms that underlie the root cortex expansion in response to low oxygen
Yamauchi, T., Sumi, K., Morishita, H., Pedersen, Ole, Inukai, Y. & Nakazono, M., 2022, s. 22.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Diverse Aquatic Animal Matrices Play a Key Role in Survival and Potential Virulence of Non-O1/O139 Vibrio cholerae Isolates
Yan, L., Jin, Y., Zhang, B., Xu, Y., Peng, Xu, Qin, S. & Chen, L., 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 21 s., 896767.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Contrastive learning enables rapid mapping to multimodal single-cell atlas of multimillion scale
YANG, Meng, Yang, Y., Xie, C., Ni, M., Liu, J., Yang, H., Mu, F. & Wang, J., 2022, I: Nature Machine Intelligence. 4, 8, s. 696-709 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Integrating convolution and self-attention improves language model of human genome for interpreting non-coding regions at base-resolution
YANG, Meng, Huang, L., Huang, H., Tang, H., Zhang, N., Yang, H., Wu, J. & Mu, F., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 14, 19 s., e81.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
TrustGWAS: A full-process workflow for encrypted GWAS using multi-key homomorphic encryption and pseudorandom number perturbation
YANG, Meng, Zhang, C., Wang, X., Liu, X., Li, S., Huang, J., Feng, Z., Sun, X., Chen, F., Yang, S., Ni, M., Li, L., Cao, Y. & Mu, F., 2022, I: Cell Systems. 13, 9, s. 752-767.e6 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative Analyses of 3,654 Plastid Genomes Unravel Insights Into Evolutionary Dynamics and Phylogenetic Discordance of Green Plants
Yang, T., Sahu, S. K., Yang, L., Liu, Y., Mu, W., Liu, X., Strube, M. L., Liu, Huan & Zhong, B., 2022, I: Frontiers in Plant Science. 13, 13 s., 808156.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Living on fire: Deactivating fire coral polyps for larval settlement and symbiosis in the fire coral-associated barnacle Wanella milleporae (Thoracicalcarea: Wanellinae)
Yap, F. C., Høeg, Jens Thorvald & Chan, B. K. K., 2022, I: Ecology and Evolution. 12, 7, 17 s., e9057.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Soil texture is a stronger driver of the maize rhizosphere microbiome and extracellular enzyme activities than soil depth or the presence of root hairs
Yim, B., Ibrahim, Z., Rüger, L., Ganther, M., Maccario, Lorrie, Sørensen, Søren Johannes, Heintz-Buschart, A., Tarkka, M. T., Vetterlein, D., Bonkowski, M., Blagodatskaya, E. & Smalla, K., 2022, I: Plant and Soil. 478, 1-2, s. 229-251 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Comparative phylogeography study reveals introgression and incomplete lineage sorting during rapid diversification of Rhodiola
You, J., Lougheed, S. C., Zhao, Y., KU, thw266, Liu, W., Lu, F., Wang, Y., Zhang, W., Yang, J., Qiong, L. & Song, Z., 2022, I: Annals of Botany. 129, 2, s. 185-200 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The Wastewater Plasmidome and its Derived Resistome: Insight Into Their Dynamics in the Urban Water Systems
Yu, Z., 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 196 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Single-cell transcriptomic landscape of the sheep rumen provides insights into physiological programming development and adaptation of digestive strategies
Yuan, Y., Sun, D., Qin, T., Mao, S., Zhu, W., Yin, Y., Huang, J., Heller, Rasmus, Li, Z., Liu, J. & Qiu, Q., 2022, I: Zoological research. 43, 4, s. 634-647 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Clinical application of high-throughput sequencing technology in prenatal screening and diagnosis of birth defects
ZENG, F., 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 118 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Exudates from Miscanthus x giganteus change the response of a root-associated Pseudomonas putida strain towards heavy metals
Zadel, U., Cruzeiro, C., Raj Durai, A. C., Nesme, Joseph, May, R., Balázs, H., Michalke, B., Płaza, G., Schröder, P., Schloter, M. & Radl, V., 2022, I: Environmental Pollution. 313, 13 s., 119989.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Morphometrics, Distribution, and DNA Barcoding: An Integrative Identification Approach to the Genus Odontotermes (Termitidae: Blattodea) of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan
Zaman, M., Khan, I. A., Schmidt, Suzanne, Murphy, Rob & Poulsen, Michael, 2022, I: Forests. 13, 5, 17 s., 674.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Current challenges in understanding the role of enhancers in disease
Zaugg, J. B., Sahlén, P., Andersson, Robin, Alberich-Jorda, M., de Laat, W., Deplancke, B., Ferrer, J., Mandrup, S., Natoli, G., Plewczynski, D., Rada-Iglesias, A. & Spicuglia, S., 2022, I: Nature Structural and Molecular Biology. 29, 12, s. 1148-1158 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Oxygen-sensitive nanoparticles reveal the spatiotemporal dynamics of oxygen reduction during magnesium implant biodegradation
Zeller-Plumhoff, B., Akkineni, A. R., Helmholz, H., Orlov, D., Moßhammer, Maria, Kühl, Michael, Willumeit-Roemer, R. & Gelinsky, M., 2022, I: npj Materials Degradation. 6, 8 s., 95.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A short prokaryotic Argonaute activates membrane effector to confer antiviral defense
Zeng, Z., Chen, Y., Pinilla Redondo, Rafael, Shah, S. A., Zhao, F., Wang, C., Hu, Z., Wu, C., Zhang, C., Whitaker, R. J., She, Q. & Han, W., 2022, I: Cell Host and Microbe. 30, 7, s. 930-943.e6 21 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A novel approach for the non-invasive diagnosis of pulmonary nodules using low-depth whole-genome sequencing of cell-free DNA
Zhang, B., Liang, H., Liu, W., Zhou, X., Qiao, S., Li, F., Tian, P., Li, C., Ma, Y., Zhang, H., Zhang, Z., Nanjo, S., Russo, A., Puig-Butillé, J. A., Wu, K., Wang, C., Zhao, X. & Yue, D., 2022, I: Translational Lung Cancer Research. 11, 10, s. 2094-2110 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Isolation and Crystallization of the D156C Form of Optogenetic ChR2
Zhang, L., Wang, Kaituo, Ning, S., Pedersen, Per Amstrup, Duelli, A. S. & Gourdon, Pontus Emanuel, 2022, I: Cells. 11, 5, 11 s., 895.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effects of Epiphytic Biofilm Activity on the Photosynthetic Activity, pH and Inorganic Carbon Microenvironment of Seagrass Leaves (Zostera marina L.)
Zhang, Q., Kühl, Michael & Brodersen, Kasper Elgetti, 2022, I: Frontiers in Marine Science. 9, 11 s., 835381.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Iron oxide coated sand (IOS): Scale-up analysis and full-scale application for phosphorus removal from goat farm wastewater
Zhang, R., Wang, L., Lakho, F. H., Yang, X., Depuydt, V., Igodt, W., Le, H. Q., Rousseau, D. P. L. & Van Hulle, S., 2022, I: Separation and Purification Technology. 284, 10 s., 120213.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Metagenomic analysis reveals crosstalk between gut microbiota and glucose-lowering drugs targeting the gastrointestinal tract in Chinese patients with type 2 diabetes: a 6 month, two-arm randomised trial
Zhang, X., Ren, H., Zhao, C., Shi, Z., Qiu, L., Yang, F., Zhou, X., Han, X., Wu, K., Zhong, H., Li, Y., Li, J. & Ji, L., 2022, I: Diabetologia. 65, 11, s. 1613-1626 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Inactivation of Target RNA Cleavage of a III-B CRISPR-Cas System Induces Robust Autoimmunity in Saccharolobus islandicus
Zhang, Y., Lin, Jinzhong, Tian, X., Wang, Y., Zhao, R., Wu, C., Wang, X., Zhao, P., Bi, X., Yu, Z., Han, W., Peng, N., Liang, Y. X. & She, Q., 2022, I: International Journal of Molecular Sciences . 23, 15, 16 s., 8515.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Casein and red meat proteins differentially affect the composition of the gut microbiota in weaning rats
Zhao, Fan, Wang, Chong, Song, S., Fang, C., Zhou, G., Li, C. & Kristiansen, Karsten, 2022, I: Food Chemistry. 397, 11 s., 133769.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Effects of Different Storage Temperatures on Bacterial Communities and Functional Potential in Pork Meat
Zhao, Fan, Wei, Z., Zhou, G., Kristiansen, Karsten & Wang, Chong, 2022, I: Foods. 11, 15, 12 s., 2307.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Intake of a Chicken Protein-Based or Soy Protein-Based Diet Differentially Affects Growth Performance, Absorptive Capacity, and Gut Microbiota in Young Rats
Zhao, Fan, Wang, Chong, Song, S., Fang, C., Kristiansen, Karsten & Li, C., 2022, I: Molecular Nutrition and Food Research. 66, 13, 14 s., 2101124.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Proteomics and Metabolomics Profiling of Pork Exudate Reveals Meat Spoilage during Storage
Zhao, Fan, Wei, Z., Bai, Y., Li, C., Zhou, G., Kristiansen, Karsten & Wang, Chong, 2022, I: Metabolites. 12, 7, 15 s., 570.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exploration of Intratumor Heterogeneity and Tumoral Microenvironment in Non-small Cell Lung Cancer
Zhao, X., 2022, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 137 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning
- Udgivet
Three novel structural variations at the major histocompatibility complex and IL12B predispose to psoriasis
Zhen, Q., Zhang, Y., Yu, Y., Yang, H., Zhang, T., Li, X., Mo, X., Li, B., Wu, J., Liang, Y., Ge, H., Xu, Q., Chen, W., Qian, W., Xu, H., Chen, G., Bai, B., Zhang, J., Lu, Y., Chen, S. & 31 flere, , 2022, I: British Journal of Dermatology. 186, 2, s. 307-317 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Performance characterization of PCR-free whole genome sequencing for clinical diagnosis
Zhou, G., Zhou, M., Zeng, F., Zhang, N., Sun, Y., Qiao, Z., Guo, X., Zhou, S., Yun, G., Xie, J., Wang, X., Liu, F., Fan, C., Wang, Y., Fang, Z., Tian, Z., Dai, W., Sun, J., Peng, Z. & Song, L., 2022, I: Medicine. 101, 10, 8 s., e28972.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Over 50,000 Metagenomically Assembled Draft Genomes for the Human Oral Microbiome Reveal New Taxa
Zhu, J., Tian, L., Chen, P., Han, M., Song, L., Tong, X., Sun, X., Yang, F., Lin, Z., Liu, X., Liu, C., Wang, X., Lin, Y., Cai, K., Hou, Y., Xu, X., Yang, H., Wang, J., Kristiansen, K., Xiao, L. & 3 flere, , 2022, I: Genomics, Proteomics and Bioinformatics. 20, 2, s. 246-259Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Unparalleled details of soft tissues in a Cretaceous ant
Zhuang, Y., Xu, W., KU, thw266, Mai, H., Li, X., He, H., Ran, H. & Liu, Y., 2022, I: BMC Ecology and Evolution. 22, 1, 10 s., 146.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phylogenomic analysis and metabolic role reconstruction of mutualistic Rhizobiales hindgut symbionts of Acromyrmex leaf-cutting ants
Zhukova, M., Sapountzis, P., Schiott, M. & Boomsma, Jacobus J., 2022, I: FEMS Microbiology Ecology. 98, 9, 13 s., fiac084.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
mRNA Decapping Factors LSM1 and PAT Paralogs Are Involved in Turnip Mosaic Virus Viral Infection
Zuo, Zhangli Thomsen, Roux, M., Rodriguez, Eleazar & Petersen, Morten, 2022, I: Molecular plant-microbe interactions : MPMI. 35, 2, s. 125-130 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The rice wax synthesis-related gene Leaf Gas Film-1 (LGF1) is involved in the formation of the radial oxygen loss barrier
de la Cruz Jiménez, J., Noorrohmah, S., Zeisler, V., Schreiber, L., Peralta Ogorek, Lucas León, Pellegrini, Elisa, Pedersen, Ole, Nagai, K., Ashikari, M., Takahashi, H. & Nakazono, M., 2022, s. 67.Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimation of the covariance structure from SNP allele frequencies
van Waaij, J., Li, Z. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 21, 1, 20 s., 20220005.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Four new genera and six new species of lyophylloid agarics (Agaricales, Basidiomycota) from three different continents
van de Peppel, L. J. J., Aime, M. C., Læssøe, Thomas, Pedersen, O. S., Coimbra, V. R. M., Kuyper, T. W., Stubbe, D., Aanen, D. K. & Baroni, T. J., 2022, I: Mycological Progress. 21, 10, 14 s., 85.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Reduced chromatin accessibility correlates with resistance to Notch activation
van den Ameele, J., Krautz, Robert, Cheetham, S. W., Donovan, A. P. A., Llorà-Batlle, O., Yakob, R. & Brand, A. H., 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 10 s., 2210.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Flest downloads
-
32536
downloads
Genetic diversity within lichen photobionts of the Lecanora varia group (Lichenes, Ascomycota)
Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
Udgivet -
9026
downloads
Long-term survival of dinoflagellate cysts in anoxic marine sediments.
Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning
Udgivet -
7538
downloads
Danmarks biodiversitets fremtid: de væsentligste udfordringer og højest prioriterede virkemidler
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til rapport › Forskning
Udgivet
Seneste publikationer
Recommendations for the Organisational Framework for Excellence at UCPH
Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Rapport › Rådgivning › fagfællebedømt
Fremme af spontan vegetation efter gran
Publikation: Andet › Udgivelser på nettet - Net-publikation › Formidling
A region of suppressed recombination misleads neoavian phylogenomics
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt