Biologisk Institut

 

 
  1. 2020
  2. Udgivet

    A draft genome sequence of the elusive giant squid, Architeuthis dux

    da Fonseca, R. R., Couto, A., Machado, A. M., Brejova, B., Albertin, C. B., Silva, F., Gardner, P., Baril, T., Hayward, A., Campos, A., Ribeiro, Â. M., Barrio-Hernandez, I., Hoving, H-J., Tafur-Jimenez, R., Chu, C., Frazão, B., Petersen, B., Peñaloza, F., Musacchia, F., Alexander, G. C. & 24 flere, Osório, H., Winkelmann, I., Simakov, O., Rasmussen, Simon, Rahman, M. Z., Pisani, D., Vinther, J., Jarvis, E., KU, thw266, Strugnell, J. M., Castro, L. F. C., Fedrigo, O., Patricio, M., Li, Q., Rocha, S., Antunes, A., Wu, Y., Ma, B., Sanges, R., Vinar, T., Blagoev, B., Sicheritz-Pontén, Thomas, Nielsen, Rasmus & Gilbert, M Thomas P, 2020, I: GigaScience. 9, 1, 12 s., giz152.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    A high-affinity, bivalent PDZ domain inhibitor complexes PICK1 to alleviate neuropathic pain

    Christensen, N. R., De Luca, M., Lever, M. B., Richner, M., Hansen, A. B., Noes-Holt, G., Jensen, K. L., Rathje, M., Jensen, D. B., Erlendsson, S., Bartling, C. R. O., Ammendrup-Johnsen, I., Pedersen, S. E., Schönauer, M., Nissen, K. B., Midtgaard, S. R., Teilum, K., Arleth, L., Sørensen, A. T., Bach, A. & 5 flere, Strømgaard, Kristian, Meehan, Claire Francesca, Vægter, C. B., Gether, Ulrik & Madsen, Kenneth Lindegaard, 2020, I: EMBO Molecular Medicine. 12, 6, 25 s., e11248.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    A likelihood method for estimating present-day human contamination in ancient male samples using low-depth X-chromosome data

    Moreno-Mayar, J. V., Korneliussen, Thorfinn Sand, Dalal, J., Renaud, Gabriel, Albrechtsen, Anders, Nielsen, Rasmus & Malaspinas, A., 2020, I: Bioinformatics. 36, 3, s. 828-841 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    A massively parallel platform for engineering leave-one-out split fluorescent proteins

    ANTONESCU, O., 2020, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 90 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  6. Udgivet

    A new molecular phylogeny-based taxonomy of parasitic barnacles (Crustacea: Cirripedia: Rhizocephala)

    Høeg, Jens Thorvald, Noever, C., Rees, D. J., Crandall, K. A. & Glenner, H., 2020, I: Zoological Journal of the Linnean Society. 190, 2, s. 632-653 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    A non-lethal method for detection of Bonamia ostreae in flat oyster (Ostrea edulis) using environmental DNA

    Jørgensen, Louise von Gersdorff, Nielsen, J. W., Villadsen, M. K., Vismann, Bent, Dalvin, S., Mathiessen, Heidi, Madsen, L., Kania, Per & Buchmann, Kurt, 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 9 s., 16143.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    A novel method for using RNA-seq data to identify imprinted genes in social Hymenoptera with multiply mated queens

    Howe, Jack, Schiøtt, M., Li, Q., Wang, Z., KU, thw266 & Boomsma, Jacobus J., 2020, I: Journal of Evolutionary Biology. 33, 12, s. 1770-1782 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    AgNO3 sterilizes grains of barley (Hordeum vulgare) without inhibiting germination - a necessary tool for plant–microbiome research

    Munkager, V., Vestergård, M., Priemé, Anders, Altenburger, A., de Visser, E., Johansen, Jesper Liengaard & Ekelund, Flemming, 2020, I: Plants. 9, 3, 16 s., 372.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Amoebocytes facilitate efficient carbon and nitrogen assimilation in the Cassiopea-Symbiodiniaceae symbiosis

    Lyndby, N. H., Rädecker, N., Bessette, S., Søgaard Jensen, L. H., Escrig, S., Trampe, Erik, Kühl, Michael & Meibom, A., 2020, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 287, 1941, 10 s., 20202393.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    An Expert Analysis System for Metabolomics Data Analysis

    Mei, Z., 2020, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  12. Udgivet

    An Indo-Pacific Humpback Dolphin Genome Reveals Insights into Chromosome Evolution and the Demography of a Vulnerable Species

    Zhang, P., Zhao, Y., Li, C., Lin, M., Dong, L., Zhang, R., Liu, M., Li, K., Zhang, H., Liu, X., Zhang, Y., Yuan, Y., Liu, H., Seim, I., Sun, S., Du, X., Chang, Y., Li, F., Liu, S., Lee, S. M. Y. & 13 flere, Wang, K., Wang, D., Wang, X., McGowen, M. R., Jefferson, T. A., Olsen, Morten Tange, Stiller, Josefin, KU, thw266, Xu, X., Yang, H., Fan, G., Liu, X. & Li, S., 2020, I: iScience. 23, 10, 52 s., 101640.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    An RNAi independent antiviral activity of the Arabidopsis thaliana DCL2

    Nielsen, C. P. S., 2020, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 104 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  14. Udgivet

    An atlas of the protein-coding genes in the human, pig, and mouse brain

    Sjöstedt, E., Zhong, W., Fagerberg, L., Karlsson, M., Mitsios, N., Adori, C., Oksvold, P., Edfors, F., Limiszewska, A., Hikmet, F., Huang, J., Du, Y., Lin, L., Dong, Z., Yang, L., Liu, X., Jiang, H., Xu, X., Wang, J., Yang, H. & 10 flere, Bolund, L., Mardinoglu, A., Zhang, C., von Feilitzen, K., Lindskog, C., Pontén, F., Luo, Y., Hökfelt, T., Uhlén, M. & Mulder, J., 2020, I: Science. 367, 6482, s. 1090-+ 16 s., eaay5947.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Analogues of a Cyclic Antimicrobial Peptide with a Flexible Linker Show Promising Activity Against Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus

    Thomsen, T. T., Mendel, H. C., Al-Mansour, W., Oddo, A., Løbner-Olesen, Anders & Hansen, Paul Robert, 2020, I: Antibiotics. 9, 7, 13 s., 366.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Analysis of caveolin in primary cilia

    Morthorst, Stine Kjær, Mogensen, J. B., Christensen, Søren Tvorup & Pedersen, Lotte Bang, 2020, Caveolae: Methods and Protocols. Blouin, C. M. (red.). Humana Press, s. 27-41 (Methods in Molecular Biology, Bind 2169).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  17. Udgivet

    Analysis of genes within the schizophrenia-linked 22q11.2 deletion identifies interaction of night owl/LZTR1 and NF1 in GABAergic sleep control

    Maurer, G. W., Malita, Alina, Nagy, S., Koyama, Takashi, Werge, Thomas, Halberg, Kenneth Veland, Texada, Michael James & Rewitz, Kim, 2020, I: PLOS Genetics. 16, 4, 31 s., e1008727.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Anchialine biodiversity in the Turks and Caicos islands: new discoveries and current faunal composition

    Gonzalez, B. C., Martínez, A., Olesen, Jørgen, Truskey, S. B., Ballou, L., Allentoft-Larsen, M., Daniels, J., Heinerth, P., Parrish, M., Manco, N., Ward, J., Iliffe, T. M., Osborn, K. J. & Worsaae, Katrine, 2020, I: International Journal of Speleology. 49, 2, s. 71-86 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Ancient Genomes Reveal the Evolutionary History and Origin of Cashmere-Producing Goats in China

    Cai, Y., Fu, W., Cai, D., Heller, R., Zheng, Z., Wen, J., Li, H., Wang, X., Alshawi, A., Sun, Z., Zhu, S., Wang, J., Yang, M., Hu, S., Li, Y., Yang, Z., Gong, M., Hou, Y., Lan, T., Wu, K. & 3 flere, Chen, Y., Jiang, Y. & Wang, X., 2020, I: Molecular Biology and Evolution. 37, 7, s. 2099-2109 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Annelida (excluding Clitellata and Oligochaeta)

    Worsaae, Katrine, 2020, Guide to the Identification of Marine Meiofauna. Schmidt-Rhaesa, A. (red.). Verlag Dr. Friedrich Pfeil, s. 239-270

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Ant cuticular hydrocarbons are heritable and associated with variation in colony productivity

    Walsh, J., Pontieri, L., d'Ettorre, P. & Linksvayer, T. A., 2020, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 287, 1928, 10 s., 20201029.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Anthropogenic transformation of Yangtze Plain freshwater lakes: patterns, drivers and impacts

    Hou, X., Feng, L., Tang, Jing, Song, X., Liu, J., Zhang, Y., Wang, J., Xu, Y., Dai, Y., Zheng, Y., Zheng, C. & Bryan, B. A., 2020, I: Remote Sensing of Environment. 248, 14 s., 111998.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Anti-CRISPR Proteins in Archaea

    Peng, Xu, Mayo-Muñoz, D., Bhoobalan, Yuvaraj & Martinez Alvarez, Laura, 2020, I: Trends in Microbiology. 28, 11, s. 913-921 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Anti-CRISPR protein applications: natural brakes for CRISPR-Cas technologies

    Marino, N. D., Pinilla Redondo, Rafael, Csörgő, B. & Bondy-Denomy, J., 2020, I: Nature Methods. 17, 5, s. 471-479 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Anti-sea lice agents in Norwegian aquaculture: surveillance, treatment trends and possible implications for food safety

    Hannisdal, R., Nøstbakken, O. J., Hove, H., Madsen, L., Horsberg, T. E. & Lunestad, B. T., 2020, I: Aquaculture. 521, 7 s., 735044.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Antibiotic susceptibility of cystic fibrosis lung microbiome members in a multispecies biofilm

    Vandeplassche, E., Sass, A., Ostyn, L., Burmølle, Mette, Kragh, K. N., Bjarnsholt, Thomas, Coenye, T. & Crabbé, A., 2020, I: Biofilm. 2, 9 s., 100031.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Antimicrobial and Antivirulence Action of Eugenia brejoensis Essential Oil in vitro and in vivo Invertebrate Models

    Filho, C. M. B., da Silva, L. C. N., da Silva, M. V., Løbner-Olesen, Anders, Struve, C., Krogfelt, K. A., Correia, M. T. D. S. & Oliva, M. L. V., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 11 s., 424.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Aquatic plants are influenced by the surrounding landscape

    Pedersen, Ole, 2020, I: TheScienceBreaker. 6, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskning

  29. Udgivet

    Archaeal Viruses and Their Interactions with CRISPR-Cas Systems

    Garrett, Roger Antony, Shah, S. A., Martinez Alvarez, Laura & Peng, Xu, 2020, Biocommunication of Phages. 1 udg. Springer, s. 199-220 22 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Arctic soil carbon turnover controlled by experimental snow addition, summer warming and shrub removal

    Ravn, N. R., Elberling, Bo & Michelsen, Anders, 2020, I: Soil Biology and Biochemistry. 142, 12 s., 107698.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Arctic soil water chemistry in dry and wet tundra subject to snow addition, summer warming and herbivory simulation

    Rasmussen, Laura Helene, Michelsen, Anders, Ladegaard-Pedersen, P., Nielsen, C. S. & Elberling, Bo, 2020, I: Soil Biology and Biochemistry. 141, 13 s., 107676.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Asexual and sexual reproduction are two separate developmental pathways in a Termitomyces species

    Vreeburg, S. M. E., de Ruijter, N. C. A., Zwaan, B. J., da Costa, R. R., Poulsen, Michael & Aanen, D. K., 2020, I: Biology Letters. 16, 8, 5 s., 20200394.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Assessing the reproductive biology of the Greenland shark (Somniosus microcephalus)

    Nielsen, J., Hedeholm, R. B., Lynghammar, A., McClusky, L. M., Berland, B., Steffensen, John Fleng & Christiansen, J. S., 2020, I: PLoS ONE. 15, 10, 22 s., e0238986.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Assessment of fecal DNA extraction protocols for metagenomic studies

    Yang, F., Sun, J., Luo, H., Ren, H., Zhou, H., Lin, Y., Han, Mo, Chen, B., Liao, H., Brix, S., Li, J., Yang, H., Kristiansen, Karsten & Zhong, H., 2020, I: GigaScience. 9, 7, 12 s., giaa071.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Assessment of the Representativeness of MODIS Aerosol Optical Depth Products at Different Temporal Scales Using Global AERONET Measurements

    Tong, Y., Feng, L., Sun, K. & Tang, Jing, 2020, I: Remote Sensing. 12, 14, 26 s., 2330.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    August Krogh (1874-1949): Nobelprisen i "Fysiologi eller Medicin" 1920

    Larsen, Erik Hviid, 2020, Københavns Universitets Almanak: Skriv- og rejse-kalender. 2 udg. s. 88-95 8 s. (Københavns Universitets almanak. Skriv- og rejse-kalender).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiFormidling

  37. Udgivet

    Autophagy mediate cellular reprogramming

    Chevalier, J. R., 2020, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  38. Udgivet

    Autophagy mediates temporary reprogramming and dedifferentiation in plant somatic cells

    Rodriguez, Eleazar, Chevalier, J., Olsen, J., Ansbøl, J., Kapousidou, V., Zuo, Zhangli Thomsen, Svenning, S., Loefke, C., Koemeda, S., Drozdowskyj, P. S., Jez, J., Durnberger, G., Kuenzl, F., Schutzbier, M., Mechtler, K., Ebstrup, E. N., Lolle, S., Dagdas, Y. & Petersen, Morten, 2020, I: EMBO Journal. 39, 4, 11 s., e103315.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Avidity within the N-terminal anchor drives α-synuclein membrane interaction and insertion

    Cholak, E., Bugge, K., Khondker, A., Gauger, K., Pedraz-Cuesta, E., Pedersen, M. E., Bucciarelli, S., Vestergaard, Bente, Pedersen, Stine Helene Falsig, Rheinstädter, M. C., Langkilde, Annette Eva & Kragelund, Birthe Brandt, 2020, I: FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. 34, 6, s. 7462-7482 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Azo dying of α-keratin material improves microbial keratinase screening and standardization

    Gonzalo, M., Espersen, R., Al-Soud, W. A., Cristiano Falco, F., Hägglund, Per Mårten, Sørensen, Søren Johannes, Svensson, B. & Jacquiod, S., 2020, I: Microbial Biotechnology. 13, 4, s. 984-996

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Background insect herbivory increases with local elevation but makes minor contribution to element cycling along natural gradients in the Subarctic

    Kristensen, J. A., Michelsen, Anders & Metcalfe, D. B., 2020, I: Ecology and Evolution. 10, 20, s. 11684-11698 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Bacterial Chromosome Replication and DNA Repair During the Stringent Response

    Sinha, A. K., Løbner-Olesen, Anders & Riber, Leise, 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 9 s., 582113.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Bacteriophages: Emerging Applications in Medicine, Food, and Biotechnology

    Sohail, H. A., Coffey, A., Debrowska, K., Meyer, I. M., Middelboe, Mathias, Sohail, M. & Clokie, M. R. J., 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 2, s. 75-82 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Bacteriophages as Biocontrol Agents for Flavobacterium psychrophilum Biofilms and Rainbow Trout Infections

    Sundell, K., Landor, L., Castillo, D., Middelboe, Mathias & Wiklund, T., 2020, I: PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 4, s. 198-204 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Beta-1 and Not Beta-3 Adrenergic Receptors May Be the Primary Regulator of Human Brown Adipocyte Metabolism

    Riis-Vestergaard, M. J., Richelsen, B., Bruun, J. M., Li, W., Hansen, Jacob B. & Pedersen, S. B., 2020, I: The Journal of clinical endocrinology and metabolism. 105, 4, 12 s., dgz298.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Beyond Cholera: Characterization of zot-Encoding Filamentous Phages in the Marine Fish Pathogen Vibrio anguillarum

    Mauritzen, Jesper Juel, Castillo, D., Tan, D., Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2020, I: Viruses. 12, 7, 17 s., 730.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Bezlotoxumab for prevention of Clostridium difficile infection recurrence: Distinguishing relapse from reinfection with whole genome sequencing

    Zeng, Z., Zhao, Hailong, Dorr, M. B., Shen, J., Wilcox, M. H., Poxton, I. R., Guris, D., Li, J. & Shaw, P. M., 2020, I: Anaerobe. 61, 6 s., 102137.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Bidirectional cyclical flows increase energetic costs of station holding for a labriform swimming fish, Cymatogaster aggregata

    Luongo, S. M., Ruth, A., Gervais, C. R., Korsmeyer, K. E., Johansen, J. L., Domenici, P. & Steffensen, John Fleng, 2020, I: Conservation Physiology. 8, 1, 11 s., coaa077.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Bier

    Madsen, Henning Bang, 2020, Den danske Rødliste. Moeslund, J. E. (red.). Aarhus Universitet, DCE – Nationalt Center for Miljø og Energi

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til rapportForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Biocontrol of Bacterial Wilt Disease Through Complex Interaction Between Tomato Plant, Antagonists, the Indigenous Rhizosphere Microbiota, and Ralstonia solanacearum

    Elsayed, T. R., Jacquiod, S., Nour, E. H., Sørensen, Søren Johannes & Smalla, K., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 10, 15 s., 2835.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Biogenic Volatile Organic Compounds in Arctic Soil: A Field Study of Concentrations and Variability With Vegetation Cover

    Larsen, Lærke Wester, Kramshøj, M., Albers, C. N. & Rinnan, Riikka, 2020, I: Journal of Geophysical Research: Biogeosciences. 125, 7, 15 s., e2019JG005551.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt