Biologisk Institut

 

 
  1. 2023
  2. Udgivet

    The quantitative importance of key root traits for radial water loss under low water potential

    Song, Zhiwei, Zonta, F., Peralta Ogorek, Lucas León, Bastegaard, V. K., Herzog, Max, Pellegrini, Elisa & Pedersen, Ole, 2023, I: Plant and Soil. 482, 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    The ABA/LANCL1/2 Hormone/Receptor System Controls Adipocyte Browning and Energy Expenditure

    Spinelli, S., Cossu, V., Passalacqua, M., Hansen, Jacob B., Guida, L., Magnone, M., Sambuceti, G., Marini, C., Sturla, L. & Zocchi, E., 2023, I: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 27 s., 3489.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Hydrostatic pressure induces transformations in the organic matter and microbial community composition of marine snow particles

    Stief, P., Schauberger, C., Becker, K. W., Elvert, M., Balmonte, J. P., Franco-Cisterna, B., Middelboe, Mathias & Glud, R. N., 2023, I: Communications Earth and Environment. 4, 1, 14 s., 377.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Range-wide population genomics of common seadragons shows secondary contact over a former barrier and insights on illegal capture

    Stiller, Josefin, Wilson, N. G. & Rouse, G., 2023, I: BMC Biology. 21, 17 s., 129.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Characterization of industrially-produced Lacticaseibacillus rhamnosus GG and Lactobacillus acidophilus LA-5: Analysis of genomic integrity, transcriptome and phenotypes

    Strickertsson, Marianne Stage, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 206 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  7. Udgivet

    Floods stress in lowland rice production: experiences of rice farmers in Kilombero and Lower-Rufiji floodplains, Tanzania

    Sulle Michael, P., Mwakyusa, L., G. Sanga, H., J. Shitindi, M., Kwaslema, D. R., Herzog, Max, L. Meliyo, J. & Massawe, B. H. J., 2023, I: Frontiers in Sustainable Food Systems. 7, 18 s., 1206754.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Uncovering spatiotemporal pattern of floods with Sentinel-1 synthetic aperture radar in major rice-growing river basins of Tanzania

    Sulle Michael, P., G. Sanga, H., J. Shitindi, M., Herzog, Max, L. Meliyo, J. & Massawe, B. H. J., 2023, I: Frontiers in Earth Science. 11, 15 s., 1183834.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Age-dependent changes in the gut microbiota and serum metabolome correlate with renal function and human aging

    Sun, L., Li, Z., Hu, C., Ding, J., Zhou, Q., Pang, G., Wu, Z., Yang, R., Li, S., Li, J., Cai, J., Sun, Y., Li, R., Zhen, H., Sun, S., Zhang, J., Fang, M., Chen, Z., Lv, Y., Cao, Q. & 36 flere, Sun, Y., Gong, R., Huang, Z., Duan, Y., Liu, H., Dong, J., Li, J., Ruan, J., Lu, H., He, B., Li, N., Li, T., Xue, W., Li, Y., Shen, J., Yang, F., Zhao, C., Liang, Q., Zhang, M., Chen, C., Gong, H., Hou, Y., Wang, J., Zhang, Y., Yang, H., Zhu, S., Xiao, L., Jin, Z., Guo, H., Zhao, P., Brix, S., Xu, X., Jia, H., Kristiansen, Karsten, Yang, Z. & Nie, C., 2023, I: Aging Cell. 22, 12, 20 s., e14028.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    How protons pave the way to aggressive cancers

    Swietach, P., Boedtkjer, E. & Pedersen, Stine Helene Falsig, 2023, I: Nature Reviews Cancer. 23, s. 825-841 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Historic Sampling of a Vanishing Beast: Population Structure and Diversity in the Black Rhinoceros

    Sánchez-Barreiro, F., Westbury, Binia De Cahsan, Westbury, Michael Vincent, Sun, Xin, Margaryan, Ashot, Fontsere, Claudia, Bruford, M. W., Russo, I. M., Kalthoff, D. C., Sicheritz-Pontén, Thomas, Petersen, Bent, Dalén, L., KU, thw266, Marquès-Bonet, T., Gilbert, M Thomas P & Moodley, Y., 2023, I: Molecular Biology and Evolution. 40, 9, 19 s., msad180.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    An overview of plasmid transfer in the plant microbiome

    Sánchez-Salazar, A. M., Taparia, Tanvi, Olesen, Asmus Kalckar, Acuña, J. J., Sørensen, Søren Johannes & Jorquera, M. A., 2023, I: Plasmid. 127, 11 s., 102695.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Methane and carbon dioxide fluxes at high spatiotemporal resolution from a small temperate lake

    Sø, Jonas Stage, Sand-Jensen, Kaj, Martinsen, K. T., Polauke, E., Kjær, Johan Emil, Reitzel, K. & Kragh, T., 2023, I: Science of the Total Environment. 878, 11 s., 162895.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Nyt udstyr måler tabene af metan og CO2 fra søer

    Sø, Jonas Stage, Sand-Jensen, Kaj, Martinsen, K. T. & Kragh, T., 25 maj 2023, Videnskab.dk.

    Publikation: AndetUdgivelser på nettet - Net-publikationFormidling

  15. Udgivet

    The lichen genera Gondwania and Transdrakea gen. nov. (Teloschistaceae) - speciation in three southern continents

    Søchting, Ulrik, Sancho, L. G. & Arup, U., 2023, I: Plant and Fungal Systematics. 68, 2, s. 304-319 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Synergistic effects of agonists and two-pore-domain potassium channels on secretory responses of human pancreatic duct cells Capan-1

    Sørensen, Christiane Elisabeth, Trauzold, A., Christensen, Nynne, Tawfik, D., Szczepanowski, M. & Novak, Ivana, 2023, I: Pflügers Archiv - European Journal of Physiology. 475, 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Living on the edge – first survey of loriciferans along the Atacama Trench

    Sørensen, Martin Vinther, Herranz, Maria, Grzelak, K., Shimabukuro, M., Kristensen, Reinhardt Møbjerg & Zeppilli, D., 2023, I: European Journal of Taxonomy. 879, s. 162-187

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Every refuge has its price: Ostreobium as a model for understanding how algae can live in rock and stay in business

    Tandon, K., Pasella, M. M., Iha, C., Ricci, F., Hu, J., O'Kelly, C. J., Medina, M., Kühl, Michael & Verbruggen, H., 2023, I: Seminars in Cell and Developmental Biology. 134, s. 27-36 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    High-latitude vegetation changes will determine future plant volatile impacts on atmospheric organic aerosols

    Tang, Jing, Zhou, P., Miller, P. A., Schurgers, Guy, Gustafson, A., Makkonen, R., Fu, Y. H. & Rinnan, Riikka, 2023, I: npj Climate and Atmospheric Science. 6, 1, 13 s., 147.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Comment on “Intrinsic protein disorder uncouples affinity from binding specificity

    Teilum, Kaare, Olsen, Johan Gotthardt & Kragelund, Birthe Brandt, 2023, I: Protein Science. 32, 4, 2 s., e4602.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Possible signs of recovery of the nearly extirpated Spitsbergen bowhead whales: calves observed in east Greenland

    Tervo, O. M., Louis, Marie Georgette Yolande J, Sinding, Mikkel Holger Strander, Heide-Jørgensen, M. P. & Hansen, R. G., 2023, I: Polar Research. 42, 4 s., 8809.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Improved predictions of phase behaviour of intrinsically disordered proteins by tuning the interaction range

    Tesei, Giulio & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: Open Research Europe. 2, 94, 24 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    DeepPeptide predicts cleaved peptides in proteins using conditional random fields

    Teufel, Felix Georg, Refsgaard, J. C., Madsen, C. T., Stahlhut, C., Grønborg, M., Winther, Ole & Madsen, D., 2023, I: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 10, 6 s., btad616.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Deorphanizing Peptides Using Structure Prediction

    Teufel, Felix Georg, Refsgaard, J. C., Kasimova, M. A., Deibler, K., Madsen, C. T., Stahlhut, C., Grønborg, M., Winther, Ole & Madsen, D., 2023, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 63, 9, 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    GraphPart: homology partitioning for biological sequence analysis

    Teufel, Felix Georg, Gíslason, M. H., Almagro Armenteros, J. J., Johansen, A. R., Winther, Ole & Nielsen, H., 2023, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 5, 4, 9 s., lqad088.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Drying of Springs in the Himalayan Region of Nepal: Perspectives of Local Government Leaders on Causes, Consequences, and Conservation Efforts

    Thapa, B., Bhattarai, C., Dahal, N., Tiwari, S. & Jacobsen, Dean, 2023, I: Mountain Research and Development. 43, 4, s. R9-R15 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    How genomics can help biodiversity conservation

    The European Reference Genome Atlas Consortium, T. E. R. G. A. C., 2023, I: Trends in Genetics. 39, 7, 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Conformational and oligomeric states of SPOP from small-angle X-ray scattering and molecular dynamics simulations

    Thomasen, Emil, Cuneo, M. J., Mittag, T. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: eLife. 12, 23 s., e84147.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Flock social behaviour and vocal communication in Eupsittula conures

    Thomsen, Heidi Maria, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 195 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  30. Udgivet

    The airway microbiota of neonates colonized with asthma-associated pathogenic bacteria

    Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Li, Xuan Ji, Peng, Shuang, Sunde, R. B., Shah, S. A., Bhattacharyya, M., Poulsen, C. S., Poulsen, Christina Egeø, Leal Rodriguez, C., Widdowson, Michael Lawrence, Neumann, A. U., Trivedi, Urvish, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bønnelykke, Klaus, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2023, I: Nature Communications. 14, 12 s., 6668.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    A novel splice-affecting HNF1A variant with large population impact on diabetes in Greenland

    Thuesen, A. C. B., Stæger, F. F., Kaci, A., Solheim, M. H., Aukrust, I., Jørsboe, E., Santander, C. G., Andersen, M. K., Li, Z., Gilly, A., Stinson, S. E., Gjesing, A. P., Bjerregaard, P., Pedersen, M. L., Larsen, C. V. L., Grarup, N., Jørgensen, M. E., Zeggini, E., Bjørkhaug, L., Njølstad, P. R. & 3 flere, Albrechtsen, Anders, Moltke, Ida & Hansen, Torben, 2023, I: The Lancet Regional Health - Europe. 24, 12 s., 100529.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Interpreting the molecular mechanisms of disease variants in human transmembrane proteins

    Tiemann, Johanna Katarina Sofie, Zschach, Henrike, Lindorff-Larsen, Kresten & Stein, Amelie, 2023, I: Biophysical Journal. 122, 11, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    The cellular 3D printer of a marine bristle worm—chaetogenesis in Platynereis dumerilii (Audouin & Milne Edwards, 1834) (Annelida)

    Tilic, E., Herkenrath, T., Kirfel, G. & Bartolomaeus, T., 2023, I: Cell and Tissue Research. 391, s. 305-322

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Use of Probiotics to Control Biofilm Formation in Food Industries

    Tomé, A. R., Carvalho, F. M., Teixeira-Santos, R., Burmølle, Mette, Mergulhão, F. J. M. & Gomes, L. C., 2023, I: Antibiotics. 12, 4, 17 s., 754.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Can the Wild Perennial, Rhizomatous Rice Species Oryza longistaminata be a Candidate for De Novo Domestication?

    Tong, Shuai, Ashikari, M., Nagai, K. & Pedersen, Ole, 2023, I: Rice. 16, 1, 20 s., 13.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Responses of key root traits in the genus Oryza to soil flooding mimicked by stagnant, deoxygenated nutrient solution

    Tong, Shuai, Kjær, Johan Emil, Peralta Ogorek, Lucas León, Pellegrini, Elisa, Song, Zhiwei, Pedersen, Ole & Herzog, Max, 2023, I: Journal of Experimental Botany. 74, 6, 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    The resilience journey of rice: Root traits, genome editing and silicon-mediated strategies for enhanced abiotic stress tolerance in rice

    Tong, Shuai, 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 139 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  38. Udgivet

    Activity of root-knot nematodes associated with composition of a nematode-attached microbiome and the surrounding soil microbiota

    Topalovic, Olivera, Bak, Frederik, Santos, S., Sikder, M. M., Sapkota, R., Ekelund, Flemming, Nicolaisen, Mette Haubjerg & Vestergård, M., 2023, I: FEMS Microbiology Ecology. 99, 9, 11 s., fiad091.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Editorial: Drivers of host-microbiome interactions in the rhizosphere

    Topalovic, Olivera, Koorem, K. & Wilschut, R. A., 2023, I: Frontiers in Plant Science. 14, 3 s., 1294388.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Nematodes as suppressors and facilitators of plant performance

    Topalovic, Olivera & Geisen, S., 2023, I: New Phytologist. 238, 6, s. 2305-2312

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    The histone demethylase KDM5C functions as a tumor suppressor in AML by repression of bivalently marked immature genes

    Trempenau, M. L., Schuster, Mikkel Bruhn, Pundhir, Sachin, Araújo Pereira, Mafalda, Kalvisa, A., Tapia, Marta Cecylia, Su, Jinyu, Ge, Y., de Boer, Bauke, Balhuizen, Alexander, Bagger, F. O., Shliaha, P., Sroczynska, P., Walfridsson, J., Grønbæk, Kirsten, Theilgaard-Mønch, Kim, Jensen, O. N., Helin, K. & Porse, Bo Torben, 2023, I: Leukemia. 37, 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Parental exposure to heat waves improves offspring reproductive investment in Tetranychus urticae (Acari: Tetranychidae), but not in its predator, Phytoseiulus persimilis (Acari: Phytoseiidae)

    Tscholl, T., Nachman, Gøsta Støger, Spangl, B., Scalmani, I. & Walzer, A., 2023, I: Ecology and Evolution. 13, 11, 20 s., e10748.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Reproducing during Heat Waves: Influence of Juvenile and Adult Environment on Fecundity of a Pest Mite and Its Predator

    Tscholl, T., Nachman, Gøsta Støger, Spangl, B., Serve, H. C. & Walzer, A., 2023, I: Biology. 12, 4, 22 s., 554.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Comparative molecular and morphological species delineation of Halammohydra Remane, 1927 (Hydrozoa): with the description of four new species

    Tödter, L., Worsaae, Katrine & Schmidt-Rhaesa, A., 2023, I: Organisms Diversity and Evolution. 23, s. 455-476 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Cold-stimulated brown adipose tissue activation is related to changes in serum metabolites relevant to NAD+ metabolism in humans

    U-Din, M., de Mello, V. D., Tuomainen, M., Raiko, J., Niemi, T., Fromme, T., Klåvus, A., Gautier, N., Haimilahti, K., Lehtonen, M., Kristiansen, Karsten, Newman, J. W., Pietiläinen, K. H., Pihlajamäki, J., Amri, E. Z., Klingenspor, M., Nuutila, P., Pirinen, E., Hanhineva, K. & Virtanen, K. A., 26 sep. 2023, I: Cell Reports. 42, 9, 23 s., 113131.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Emerging roles of the CIP2A–TopBP1 complex in genome integrity

    Ummethum, Henning Ole, Li, Jiayi, Lisby, Michael & Østergaard, Vibe Hallundbæk, 2023, I: NAR Cancer. 5, 4, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Accurate protein stability predictions from homology models

    Valanciute, A., Nygaard, L., Zschach, Henrike, Maglegaard Jepsen, M., Lindorff-Larsen, Kresten & Stein, Amelie, 2023, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 21, s. 66-73 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Evaluation of population structure inferred by principal component analysis or the admixture model

    Van Waaij, J., Li, Song, Garcia Erill, Genís, Albrechtsen, Anders & Wiuf, Carsten, 2023, I: Genetics. 225, 2, 14 s., iyad157.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Plant traits and associated data from a warming experiment, a seabird colony, and along elevation in Svalbard

    Vandvik, V., Halbritter, A. H., Althuizen, I. H. J., Christiansen, C. T., Henn, J. J., Jónsdóttir, I. S., Klanderud, K., Macias-Fauria, M., Malhi, Y., Maitner, B. S., Michaletz, S., Roos, R. E., Telford, R. J., Bass, P., Björnsdóttir, K., Bustamante, L. L. V., Chmurzynski, A., Chen, S., Haugum, S. V., Kemppinen, J. & 15 flere, Lepley, K., Li, Y., Linabury, M., Matos, I. S., Neto-Bradley, B. M., Ng, M., Niittynen, P., Östman, S., Pánková, K., Roth, N., Castorena, M., Spiegel, M., Thomson, E., Vågenes, A. S. & Enquist, B. J., 2023, I: Scientific Data. 10, 1, 21 s., 578.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Structural characterization of human tryptophan hydroxylase 2 reveals that L-Phe is superior to L-Trp as the regulatory domain ligand

    Vedel, I. M., Prestel, Andreas, Zhang, Z., Skawinska, N. T., Stark, H., Harris, Pernille, Kragelund, Birthe Brandt & Peters, G. H. J., 2023, I: Structure (London, England : 1993). 31, 6, s. 689-699e6 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Decoupled phylogenetic and functional diversity in European grasslands

    Večeřa, M., Axmanová, I., Chytrý, M., Divíšek, J., Ndiribe, C., Mones, G. V., Čeplová, N., Aćić, S., Bahn, M., Bergamini, A., Boenisch, G., Biurrun, I., Bruun, H. H., Byun, C., Catford, J. A., Cerabolini, B. E. L., Cornelissen, J. H. C., Dengler, J., Jansen, F., Jansen, S. & 17 flere, Kattge, J., Kozub, Ł., Kuzemko, A., Minden, V., Mitchell, R. M., Moeslund, J. E., Mori, A. S., Niinemets, Ü., Ruprecht, E., Rusina, S., Šilc, U., Soudzilovskaia, N. A., van Bodegom, P. M., Vassilev, K., Weiher, E., Wright, I. J. & Lososová, Z., 2023, I: Preslia. 95, 4, s. 413-445 33 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt