Biologisk Institut

 

 
  1. 2023
  2. Udgivet

    Microscale imaging sheds light on species-specific strategies for photo-regulation and photo-acclimation of microphytobenthic diatoms

    Jesus, B., Jauffrais, T., Trampe, Erik, Méléder, V., Ribeiro, L., Bernhard, J. M., Geslin, E. & Kühl, Michael, 2023, I: Environmental Microbiology. 25, 12, s. 3087-3103 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Genome-wide characterization of extrachromosomal circular DNA in gastric cancer and its potential role in carcinogenesis and cancer progression

    Jiang, X., Pan, Xiaoguang, Li, W., Han, Peng, Yu, J., Li, J., Zhang, H., Lv, W., Zhang, Y., He, Y. & Xiang, X., 2023, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 80, 7, 18 s., 191.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Soil uptake of VOCs exceeds production when VOCs are readily available

    Jiao, Yi, Kramshøj, M., Davie-Martin, Cleo Lisa, Albers, C. N. & Rinnan, Riikka, 2023, I: Soil Biology and Biochemistry. 185, 12 s., 109153.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Volatile organic compound release across a permafrost-affected peatland

    Jiao, Yi, Davie-Martin, Cleo Lisa, Kramshøj, M., Christiansen, C. T., Lee, H., Althuizen, I. H. J. & Rinnan, Riikka, 2023, I: Geoderma. 430, 10 s., 116355.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    A consortium of three-bacteria isolated from human feces inhibits formation of atherosclerotic deposits and lowers lipid levels in a mouse model

    Jie, Z., Zhu, Q., Zou, Y., Wu, Q., Qin, M., He, D., Lin, X., Tong, X., Zhang, J., Jie, Z., Luo, W., Xiao, X., Chen, S., Wu, Y., Guo, G., Zheng, S., Li, Y., Lai, W., Yang, H., Wang, J. & 6 flere, Xiao, L., Chen, J., Zhang, T., Kristiansen, Karsten, Jia, H. & Zhong, S., 2023, I: iScience. 26, 6, 22 s., 106960.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Mitigation of Greenhouse Gas Emissions from Rice via Manipulation of Key Root Traits

    Jimenez Serna, Juan de la Cruz & Pedersen, Ole, 2023, I: Rice. 16, 1, 10 s., 24.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Bacillus thuringiensis toxins divert progenitor cells toward enteroendocrine fate by decreasing cell adhesion with intestinal stem cells in Drosophila

    Jneid, Rouba, Loudhaief, Rihab, Zucchini-Pascal, N., Nawrot-Esposito, M. P., Fichant, A., Rousset, R., Bonis, M., Osman, D. & Gallet, A., 2023, I: eLife. 12, 34 s., e80179.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Centenarians have a diverse gut virome with the potential to modulate metabolism and promote healthy lifespan

    Johansen, Joachim, Atarashi, K., Arai, Y., Hirose, N., Sørensen, Søren Johannes, Vatanen, T., Knip, M., Honda, K., Xavier, R. J., Rasmussen, Simon & Plichta, D. R., 2023, I: Nature Microbiology. 8, s. 1064-1078 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    The GPCR adaptor protein Norbin regulates S1PR1 trafficking and the morphology, cell cycle and survival of PC12 cells

    Johansen, Valdemar Brimnes Ingemann, Hampson, E., Tsonou, E., Pantarelli, C., Chu, J. Y., Crossland, L., Okkenhaug, H., Massey, A. J., Hornigold, D. C., Welch, H. C. E. & Chetwynd, S. A., 2023, I: Scientific Reports. 13, 1, 13 s., 18237.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    A Gluten-Free Diet during Pregnancy and Early Life Increases Short Chain Fatty Acid-Producing Bacteria and Regulatory T Cells in Prediabetic NOD Mice

    Johansen, Valdemar Brimnes Ingemann, Færø, D., Buschard, K., Kristiansen, Karsten, Pociot, Flemming, Kiilerich, P., Josefsen, K., Haupt-jorgensen, M. & Antvorskov, J. C., 2023, I: Cells. 12, 12, 15 s., 1567.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Sarcopenia in chronic obstructive pulmonary disease: skeletal muscle gasping for air?

    Johansen, Valdemar Brimnes Ingemann, 2023, I: Journal of Physiology. 601, 5, s. 883-885

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    The Impact of Dietary Factors during Pregnancy on the Development of Islet Autoimmunity and Type 1 Diabetes: A Systematic Literature Review

    Johansen, Valdemar Brimnes Ingemann, Josefsen, K. & Antvorskov, J. C., 2023, I: Nutrients. 15, 20, 24 s., 4333.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Global analysis of multi-mutants to improve protein function

    Johansson, Kristoffer Enøe, Lindorff-Larsen, Kresten & Winther, Jakob R., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 8, 15 s., 168034.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Prediction of Quality-control Degradation Signals in Yeast Proteins

    Johansson, Kristoffer Enøe, Mashahreh, B., Hartmann-Petersen, Rasmus, Ravid, T. & Lindorff-Larsen, Kresten, 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 2, 9 s., 167915.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Transient accumulation and bidirectional movement of KIF13B in primary cilia

    Juhl, A. D., Anvarian, Zeinab, Kuhns, S., Berges, J., Andersen, J. S., Wüstner, D. & Pedersen, Lotte Bang, 2023, I: Journal of Cell Science. 136, 5, 8 s., jcs259257.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Association of SLC12A1 and GLUR4 Ion Transporters with Neoadjuvant Chemoresistance in Luminal Locally Advanced Breast Cancer

    Justo-Garrido, M., López-Saavedra, A., Alcaraz, N., Cortés-González, C. C., Oñate-Ocaña, L. F., Caro-Sánchez, C. H. S., Castro-Hernández, C., Arriaga-Canon, C., Díaz-Chávez, J. & Herrera, L. A., 2023, I: International Journal of Molecular Sciences. 24, 22, 16 s., 16104.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Intraspecific trait variability is a key feature underlying high Arctic plant community resistance to climate warming

    Jónsdóttir, I. S., Halbritter, A. H., Christiansen, C. T., Althuizen, I. H. J., Haugum, S. V., Henn, J. J., Björnsdóttir, K., Maitner, B. S., Malhi, Y., Michaletz, S. T., Roos, R. E., Klanderud, K., Lee, H., Enquist, B. J. & Vandvik, V., 2023, I: Ecological Monographs. 93, 1, 21 s., e1555.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Staying below the Radar: Unraveling a New Family of Ubiquitous “Cryptic” Non-Tailed Temperate Vibriophages and Implications for Their Bacterial Hosts

    Kalatzis, P. G., Mauritzen, Jesper Juel, Winther-Have, Caroline Sophie W, Michniewski, S., Millard, A., Tsertou, M. I., Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 2023, I: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 23 s., 3937.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Lysine deserts prevent adventitious ubiquitylation of ubiquitin-proteasome components

    Kampmeyer, Caroline, Grønbæk-Thygesen, Martin, Oelerich, N., Tatham, M. H., Cagiada, Matteo, Lindorff-Larsen, K., Boomsma, Wouter, Hofmann, K. & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2023, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 80, 6, 18 s., 143.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    A genome and single-nucleus cerebral cortex transcriptome atlas of the short-finned pilot whale Globicephala macrorhynchus

    Kang, H., Liu, Qun, Seim, I., Zhang, W., Li, H., Gao, H., Lin, W., Lin, M., Zhang, P., Zhang, Y., Gao, H., Wang, Y., Qin, Yating, Liu, M., Dong, L., Yang, Z., Zhang, Y., Han, L., Fan, G. & Li, S., 2023, I: Molecular Ecology Resources. 23, 5, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Ultrastructure and molecular phylogeny of Phalansterium foulumis sp. nov. (Amoebozoa Variosea)

    Karpov, S. A., Smakova, L. A., Malavin, S. A., Ekelund, Flemming & Smirnov, A. V., 2023, I: Protistology. 17, 3, s. 129-141 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Congeneric temperate orchids recruit similar—yet differentially abundant—endophytic bacterial communities that are uncoupled from soil, but linked to host phenology and population size

    Kaur, J., Harder, Christoffer Bugge & Sharma, J., 2023, I: American Journal of Botany. 110, 5, 16 s., e16168.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Metaboloepigenetics in cancer, immunity and cardiovascular disease

    Keating, S. T. & El-Osta, A., 2023, I: Cardiovascular Research. 119, 2, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Antifouling potential of enzymes applied to reverse osmosis membranes

    Khani, M., Hansen, Mads Frederik, Knoechel, Susanne, Rasekh, B., Ghasemipanah, K., Zamir, S. M., Nosrati, M. & Burmølle, Mette, 2023, I: Biofilm. 5, 9 s., 100119.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Editorial: Signaling by primary cilia in development and disease

    Kim, S. E., Nechipurenko, I. & Christensen, Søren Tvorup, 2023, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 11, 3 s., 1186367.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet
  28. Udgivet

    Oxygen Depletion in Arctic Lakes: Circumpolar Trends, Biogeochemical Processes, and Implications of Climate Change

    Klanten, Y., Couture, R. M., Christoffersen, Kirsten Seestern, Vincent, W. F. & Antoniades, D., 2023, I: Global Biogeochemical Cycles. 37, 5, 20 s., e2022GB007616.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Linkages between seagrass tissue O2 dynamics and ecosystem oxidation and feedbacks are revealed using microsensors in situ

    Koch, M., Johnson, C., MacLeod, K., Travis, L., Madden, C. & Pedersen, Ole, 2023, s. 221. 1 s.

    Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Confusion will be my epitaph: genome-scale discordance stifles phylogenetic resolution of Holothuroidea

    Koch, N. M., Tilic, E., Miller, A. K., Stiller, Josefin & Rouse, G. W., 2023, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 290, 2002, 11 s., 20230988.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Genetics as a novel tool in mining impact assessment and biomonitoring of critically endangered western chimpanzees in the Nimba Mountains, Guinea

    Koops, K., Humle, T., Frandsen, P., Fitzgerald, M., D'Auvergne, L., Jackson, H. A., Børsting, Claus, Siegismund, Hans Redlef, Soumah, A. G. & Hvilsom, C., 2023, I: Conservation Science and Practice. 5, 4, 17 s., e12898.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Close coupling of plant functional types with soil microbial community composition drives soil carbon and nutrient cycling in tundra heath

    Koranda, M., Rinnan, Riikka & Michelsen, Anders, 2023, I: Plant and Soil. 488, s. 551-572 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Monomeric α-synuclein activates the plasma membrane calcium pump

    Kowalski, A., Betzer, C., Larsen, S. T., Gregersen, E., Newcombe, Estella Anne, Bermejo, M. C., Bendtsen, V. W., Diemer, J., Ernstsen, C. V., Jain, S., Bou, A. E., Langkilde, Annette Eva, Nejsum, L. N., Klipp, E., Edwards, R., Kragelund, Birthe Brandt, Jensen, P. H. & Nissen, Poul, 2023, I: EMBO Journal. 42, 23, 21 s., e111122.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet
  35. Udgivet
  36. Udgivet

    Response to: "Correspondence on "Safety and efficacy of faecal microbiota transplantation for active peripheral psoriatic arthritis: An exploratory randomised placebo-controlled trial'' by McGonagle et al

    Kragsnaes, M. S., Kjeldsen, J., Horn, H. C., Munk, H. L., Pedersen, J. K., Just, S. A., Ahlquist, P., Davidsen, J. R., Nilsson, A. C., Röttger, R., Kruhøffer, M., Marchesi, J. R., Kristiansen, Karsten, Christensen, R. & Ellingsen, T., 2023, I: Annals of the Rheumatic Diseases. 82, 7, 2 s., e165.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskning

  37. Udgivet

    Isolation, (bio)synthetic studies and evaluation of antimicrobial properties of drimenol-type sesquiterpenes of Termitomyces fungi

    Kreuzenbeck, N. B., Dhiman, S., Roman, D., Burkhardt, I., Conlon, B. H., Fricke, J., Guo, H., Blume, J., Görls, H., Poulsen, Michael, Dickschat, J. S., Köllner, T. G., Arndt, H. & Beemelmanns, C., 2023, I: Communications Chemistry. 6, 14 s., 79.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    cAMP competitively inhibits periplasmic phosphatases to coordinate nutritional growth with competence of Haemophilus influenzae

    Kronborg, Kristina & Zhang, Yong, 2023, I: Journal of Biological Chemistry. 299, 12, 13 s., 105404.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    A global catalog of whole-genome diversity from 233 primate species

    Kuderna, L. F. K., Gao, H., Janiak, M. C., Kuhlwilm, M., Orkin, J. D., Bataillon, T., Manu, S., Valenzuela, A., Bergman, J., Rousselle, M., Silva, F. E., Agueda, L., Blanc, J., Gut, M., de Vries, D., Goodhead, I., Harris, R. A., Raveendran, M., Jensen, A., Chuma, I. S. & 55 flere, Horvath, J. E., Hvilsom, C., Juan, D., Frandsen, P., Schraiber, J. G., de Melo, F. R., Bertuol, F., Byrne, H., Sampaio, I., Farias, I., Valsecchi, J., Messias, M., da Silva, M. N. F., Trivedi, M., Rossi, R., Hrbek, T., Andriaholinirina, N., Rabarivola, C. J., Zaramody, A., Jolly, C. J., Phillips-Conroy, J., Wilkerson, G., Abee, C., Simmons, J. H., Fernandez-Duque, E., Kanthaswamy, S., Shiferaw, F., Wu, D., Zhou, L., Shao, Y., KU, thw266, Keyyu, J. D., Knauf, S., Le, M. D., Lizano, E., Merker, S., Navarro, A., Nadler, T., Khor, C. C., Lee, J., Tan, P., Lim, W. K., Kitchener, A. C., Zinner, D., Gut, I., Melin, A. D., Guschanski, K., Schierup, M. H., Beck, R. M. D., Umapathy, G., Roos, C., Boubli, J. P., Rogers, J., Farh, K. K. H. & Marques Bonet, T., 2023, I: Science (New York, N.Y.). 380, 6648, s. 906-913 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Biological soil crusts on agricultural soils of mesic regions promote microbial cross-kingdom co-occurrences and nutrient retention

    Kurth, J. K., Albrecht, M., Glaser, K., Karsten, U., Vestergaard, G., Armbruster, M., Kublik, S., Schmid, C. A. O., Schloter, M. & Schulz, S., 2023, I: Frontiers in Microbiology. 14, 16 s., 1169958.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Fitting Force Field Parameters to NMR Relaxation Data

    Kümmerer, Felix, Orioli, S. & Lindorff-Larsen, Kresten, 5 jun. 2023, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 19, 12, s. 3741-3751 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Rare Catechol-O-methyltransferase Missense Variants Are Structurally Unstable Proteasome Targets

    Larsen, Fia Brunsgaard Valsted, Cagiada, Matteo, Dideriksen, J., Stein, Amelie, Lindorff-Larsen, Kresten & Hartmann-Petersen, Rasmus, 2023, I: Biochemistry. 62, 8, 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Fra forsøg til forankring: Flersproget faglig skrivning på bacheloruddannelsen i biokemi

    Larsen, Sanne, Laursen, Katja Årosin & Skriver, Karen, 3 maj 2023, I: Dansk universitetspædagogisk tidsskrift [online]. s. 25-40 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  44. Udgivet

    Mind the gap

    Larsen-Ledet, Sven & Stein, Amelie, 2023, I: Structure. 31, 6, s. 641-643 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Rooting depth and xylem vulnerability are independent woody plant traits jointly selected by aridity, seasonality, and water table depth

    Laughlin, D. C., Siefert, A., Fleri, J. R., Tumber-Dávila, S. J., Hammond, W. M., Sabatini, F. M., Damasceno, G., Aubin, I., Field, R., Hatim, M. Z., Jansen, S., Lenoir, J., Lens, F., McCarthy, J. K., Niinemets, Ü., Phillips, O. L., Attorre, F., Bergeron, Y., Bruun, H. H., Byun, C. & 18 flere, Ćušterevska, R., Dengler, J., De Sanctis, M., Dolezal, J., Jiménez-Alfaro, B., Hérault, B., Homeier, J., Kattge, J., Meir, P., Mencuccini, M., Noroozi, J., Nowak, A., Peñuelas, J., Schmidt, M., Škvorc, Ž., Sultana, F., Ugarte, R. M. & Bruelheide, H., 2023, I: New Phytologist. 240, 5, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Evidence that the domesticated fungus Leucoagaricus gongylophorus recycles its cytoplasmic contents as nutritional rewards to feed its leafcutter ant farmers

    A. Leal-Dutra, Caio, Yuen, L. M., Guedes, B. A. M., Contreras Serrano, Marta, Marques, P. E. & Shik, Jonathan Z., 2023, I: IMA Fungus. 14, 1, 13 s., 19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Horse vocal communication: Investigating the function and production mechanisms of biphonation

    Lefevre, R. A., 2023, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 208 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

  48. Udgivet

    Fungi and bacteria in the beds of rural and urban infants correlate with later risk of atopic diseases

    Lehtimäki, J., Gupta, S., Hjelmsø, M., Shah, S., Thorsen, Jonathan Jan Ilve, Rasmussen, Morten Arendt, Soverini, M., Li, Xuan Ji, Russel, J., Trivedi, Urvish, Brix, S., Bønnelykke, Klaus, Chawes, Bo Lund Krogsgaard, Bisgaard, H., Sørensen, Søren Johannes & Stokholm, Jakob, 2023, I: Clinical and Experimental Allergy. 53, 12, s. 1268-1278 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Liquid-Liquid Phase Separation Primes Spider Silk Proteins for Fiber Formation via a Conditional Sticker Domain

    Leppert, A., Chen, G., Lama, D., Sahin, Cagla, Railaite, V., Shilkova, O., Arndt, T., Marklund, E. G., Lane, D. P., Rising, A. & Landreh, M., 2023, I: Nano Letters. 23, 12, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Revised fission yeast gene and allele nomenclature guidelines for machine readability

    Lera-ramírez, M., Bähler, J., Mata, J., Rutherford, K., Hoffman, C. S., Lambert, S., Oliferenko, S., Martin, S. G., Gould, K. L., Du, L., Sabatinos, S. A., Forsburg, S. L., Nielsen, Olaf, Nurse, P. & Wood, V., 2023, I: Genetics. 225, 3, 10 s., iyad143.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Targeted imaging of uPAR expression in vivo with cyclic AE105 variants

    Leth, Julie Maja, Newcombe, Estella Anne, Grønnemose, A. L., Jørgensen, Jesper Tranekjær, Qvist, K., Clausen, Anne Skovsbo, Knudsen, Line Bruhn Schneider, Kjær, Andreas, Kragelund, Birthe Brandt, Jørgensen, Thomas Jørgen Dyreborg & Ploug, Michael, 2023, I: Scientific Reports. 13, 17 s., 17248.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. Udgivet

    Resolution of eleven reported and five novel Podaxis species based on ITS phylogeny, phylogenomics, morphology, ecology, and geographic distribution

    Li, Guangshuo, A. Leal-Dutra, Caio, Cuesta Mate, Ana, Conlon, B. H., Peereboom, N., Beemelmanns, C., Aanen, D. K., Rosendahl, Søren, de Beer, Z. W. & Poulsen, Michael, 2023, I: Persoonia: Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi. 51, s. 257-279 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    Convergent molecular evolution of thermogenesis and circadian rhythm in Arctic ruminants

    Li, M., Li, X., Wu, Z., Zhang, G., Wang, N., Dou, M., Liu, S., Yang, C., Meng, G., Sun, H., Hvilsom, C., Xie, G., Li, Y., Li, Z. H., Wang, W., Jiang, Y., Heller, Rasmus & Wang, Y., 2023, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 290, 1999, 10 s., 20230538.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Seasonal and diel patterns of biogenic volatile organic compound fluxes in a subarctic tundra

    Li, Tao, Baggesen, N., Seco, Roger & Rinnan, Riikka, 2023, I: Atmospheric Environment. 292, 12 s., 119430.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    A catalog of bacterial reference genomes from cultivated human oral bacteria

    Li, W., Liang, H., Lin, X., Hu, T., Wu, Z., He, W., Wang, M., Zhang, J., Jie, Zhuye, Jin, X., Xu, X., Wang, J., Yang, H., Zhang, W., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2023, I: npj Biofilms and Microbiomes. 9, 1, 13 s., 45.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    Differential responses of the gut microbiome and resistome to antibiotic exposures in infants and adults

    Li, Xuan Ji, Brejnrod, A., Thorsen, J., Zachariasen, Trine, Trivedi, Urvish, Russel, J., Vestergaard, G. A., Stokholm, Jakob, Rasmussen, Morten Arendt & Sørensen, Søren Johannes, 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 16 s., 8526.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    A clade of RHH proteins ubiquitous in Sulfolobales and their viruses regulates cell cycle progression

    Li, X., Lozano-Madueno, C., Martinez Alvarez, Laura & Peng, Xu, 2023, I: Nucleic acids symposium series. 51, 4, 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    Fast and accurate out-of-core PCA framework for large scale biobank data

    Li, Z., Meisner, Jonas & Albrechtsen, Anders, 2023, I: Genome Research. 33, 9, s. 1599-1608 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  59. Udgivet

    The history of Coast Salish “woolly dogs” revealed by ancient genomics and Indigenous Knowledge

    Lin, A. T., Hammond-Kaarremaa, L., Liu, H-L., Stantis, C., McKechnie, I., Pavel, M., Pavel, S. S. M., Wyss, S. S., Sparrow, D. Q., Carr, K., Aninta, S. G., Perri, A., Hartt, J., Bergström, A., Carmagnini, A., Charlton, S., Dalén, L., Feuerborn, T. R., France, C. A. M., Gopalakrishnan, S. & 13 flere, Grimes, V., Harris, A., Kavich, G., Sacks, B. N., Sinding, Mikkel Holger Strander, Skoglund, P., Stanton, D. W. G., Ostrander, E. A., Larson, G., Armstrong, C. G., Frantz, L. A. F., Hawkins, M. T. R. & Kistler, L., 2023, I: Science. 382, 6676, s. 1303-1309 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  60. Udgivet

    A quantitative trait locus conferring flood tolerance to deepwater rice regulates the formation of two distinct types of aquatic adventitious roots

    Lin, C., Peralta Ogorek, Lucas León, Liu, D., Pedersen, Ole & Sauter, M., 2023, I: New Phytologist. 238, 4, 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  61. Udgivet

    Molecular basis for inhibition of type III-B CRISPR-Cas by an archaeal viral anti-CRISPR protein

    Lin, Jinzhong, Alfastsen, L., Bhoobalan, Yuvaraj & Peng, Xu, 2023, I: Cell Host and Microbe. 31, 11, s. 1837-1849.e5 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  62. Udgivet

    Underestimated Interannual Variability of Terrestrial Vegetation Production by Terrestrial Ecosystem Models

    Lin, S., Hu, Z., Wang, Y., Chen, X., He, B., Song, Z., Sun, S., Wu, C., Zheng, Y., Xia, X., Liu, L., Tang, Jing, Sun, Q., Joos, F. & Yuan, W., 2023, I: Global Biogeochemical Cycles. 37, 4, 15 s., e2023GB007696.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  63. Udgivet

    The genomic landscape of reference genomes of cultivated human gut bacteria

    Lin, X., Hu, T., Chen, J., Liang, H., Zhou, J., Wu, Z., Ye, C., Jin, X., Xu, X., Zhang, W., Jing, X., Yang, T., Wang, J., Yang, H., Kristiansen, Karsten, Xiao, L. & Zou, Y., 2023, I: Nature Communications. 14, 1, 11 s., 1663.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  64. Udgivet

    Cationic amphiphilic antihistamines inhibit STAT3 via Ca2+-dependent lysosomal H+ efflux

    Liu, B., Chen, R., Zhang, Y., Huang, J., Luo, Y., Rosthøj, Susanne, Zhao, C. & Jaattela, Marja, 2023, I: Cell Reports. 42, 2, 20 s., 112137.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  65. Udgivet

    Integrative genetic and single cell RNA sequencing analysis provides new clues to the amyotrophic lateral sclerosis neurodegeneration

    Liu, H., Guan, Liping, Deng, M., Bolund, L., Kristiansen, Karsten, Zhang, J., Luo, Y. & Zhang, Z., 2023, I: Frontiers in Neuroscience. 17, 10 s., 1116087.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  66. Udgivet

    Development of a novel SRAP-SCAR marker for rapid identification of lager and ale types in brewer's yeast

    Liu, J., Cai, G., Li, X. & Lu, J., 2023, I: Molecular Biology Reports. 50, 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  67. Udgivet

    Mendelian randomization analyses reveal causal relationships between the human microbiome and longevity

    Liu, X., Zou, L., Nie, C., Qin, Y., Tong, X., Wang, J., Yang, H., Xu, X., Jin, X., Xiao, L., Zhang, T., Min, J., Zeng, Y., Jia, H. & Hou, Y., 2023, I: Scientific Reports. 13, 1, 13 s., 5127.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  68. Udgivet

    Sex differences in the oral microbiome, host traits, and their causal relationships

    Liu, X., Tong, X., Jie, Z., Zhu, J., Tian, L., Sun, Q., Ju, Y., Zou, L., Lu, H., Qiu, X., Li, Q., Liao, Y., Lian, H., Zuo, Y., Chen, X., Rao, W., Ren, Y., Wang, Y., Zi, J., Wang, R. & 11 flere, Xu, X., Yang, H., Wang, J., Zong, Y., Liu, W., Hou, Y., Jin, X., Xiao, L., Kristiansen, Karsten, Jia, H. & Zhang, T., 2023, I: iScience. 26, 1, 23 s., 105839.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  69. Udgivet

    The C:N: P stoichiometry in bryophytes: relationships with habitat, climate and growth form

    Liu, X., Wang, Z., Li, X., Bao, W. & Rousk, Kathrin, 2023, I: National Science Review. 10, 4, 3 s., nwad060.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  70. Udgivet

    Allometric relationships between leaf and petiole traits across 31 floating-leaved plants reveal a different adaptation pattern from terrestrial plants

    Liu, Y., Liu, H., Båstrup-Spohr, Lars, Li, Z., Li, W., Pan, J. & Cao, Y., 2023, I: Annals of Botany. 131, 3, 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  71. Udgivet

    Clinical diagnosis of genetic disorders at both single-nucleotide and chromosomal levels based on BGISEQ-500 platform

    Liu, Y., Mao, L., Huang, H., Li, W., Man, J., Zhang, W., Wang, L., Li, L., Sun, Y., Zhai, T., Guo, X., Du, L., Huang, J., Li, H., Wan, Y. & Wei, X., 2023, I: Human Genome Variation. 10, 1, 43 s., 15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  72. Udgivet

    Variational Open-Domain Question Answering

    Liévin, V., Motzfeldt, A. G., Jensen, I. R. & Winther, Ole, 2023, I: Proceedings of Machine Learning Research. 202, s. 20950-20977 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelForskningfagfællebedømt

  73. Udgivet

    The Drosophila tumor necrosis factor receptor, Wengen, couples energy expenditure with gut immunity

    Loudhaief, Rihab, Jneid, Rouba, Christensen, Christian Fokdal, Mackay, Duncan John, Andersen, Ditte Skovaa & Colombani, Julien, 2023, I: Science Advances. 9, 23, 15 s., eadd4977.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  74. Udgivet

    Ancient dolphin genomes reveal rapid repeated adaptation to coastal waters

    Louis, Marie Georgette Yolande J, Korlević, P., Nykänen, M., Archer, F., Berrow, S., Brownlow, A., Lorenzen, Eline, O'Brien, J., Post, K., Racimo, Fernando, Rogan, E., Rosel, P. E., Sinding, Mikkel Holger Strander, van der Es, H., Wales, N., Fontaine, M. C., Gaggiotti, O. E. & Foote, A. D., 2023, I: Nature Communications. 14, 13 s., 4020.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  75. Udgivet
  76. Udgivet

    Phagotrophic Protists Modulate Copper Resistance of the Bacterial Community in Soil

    Lv, Z., Xu, M., Liu, Y., Rønn, Regin, Rensing, C., Liu, S., Gao, S., Liao, H., Liu, Y. R., Chen, W., Zhu, Y. G., Huang, Q. & Hao, X., 2023, I: Environmental Science and Technology. 57, 9, s. 3590-3601 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  77. Udgivet

    Soil aggregates affect the legacy effect of copper pollution on the microbial communities

    Lv, Z., Rønn, Regin, Liao, H., Rensing, C., Chen, W., Huang, Q. & Hao, X., 2023, I: Soil Biology and Biochemistry. 182, 10 s., 109048.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  78. Udgivet

    Non-invasive investigation of the morphology and optical properties of the upside-down jellyfish Cassiopea with optical coherence tomography

    Lyndby, N. H., Murthy, Swathi, Bessette, S., Jakobsen, S. L., Meibom, A. & Kühl, Michael, 2023, I: Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. 290, 2007, 11 s., 20230127.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  79. Udgivet

    The mesoglea buffers the physico-chemical microenvironment of photosymbionts in the upside-down jellyfish Cassiopea sp.

    Lyndby, N. H., Murray, M. C., Trampe, Erik, Meibom, A. & Kühl, Michael, 2023, I: Frontiers in Ecology and Evolution. 11, 12 s., 1112742.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  80. Udgivet

    Regulation of plant immunity via small RNA-mediated control of NLR expression

    López Márquez, Diego, Del-Espino, Á., Ruiz-Albert, J., Bejarano, E. R., Brodersen, Peter & Beuzón, C. R., 2023, I: Journal of Experimental Botany. 74, 19, s. 6052-6068 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  81. Udgivet

    Draft genomes of seven isolates from Danish wastewater facilities belonging to Pseudomonas, Bacillus, Pseudochrobactrum, Brevundimonas, and Pandoraea

    Maccario, Lorrie, Silva, A. F., Nesme, Joseph, Amador Hierro, Cristina Isabel, Sørensen, Søren Johannes, Cooper, V. S. & Røder, Henriette Lyng, 2023, I: Microbiology resource announcements. 12, 12, 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  82. Udgivet

    Progesterone distribution in the trigeminal system and its role to modulate sensory neurotransmission: influence of sex

    Maddahi, A., Warfvinge, K., Holm, A., Edvinsson, J. C. A., Reducha, Philip Victor, Kazantzi, Spyridoula, Haanes, Kristian Agmund & Edvinsson, L., 2023, I: Journal of Headache and Pain. 24, 1, 16 s., 154.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  83. Udgivet

    Den danske checkliste over bier er blevet opdateret

    Madsen, Henning Bang, Calabuig, Isabel & Rasmussen, C., 2023

    Publikation: AndetUdgivelser på nettet - Net-publikationFormidling

  84. Udgivet

    Molecular insights into alginate beta-lactoglobulin A multivalencies: The foundation for their amorphous aggregates and coacervation

    Madsen, M., Prestel, Andreas, Madland, E., Westh, P., Tondervik, A., Sletta, H., Peters, G. H. J., Aachmann, F. L. L., Kragelund, Birthe Brandt & Svensson, B., 2023, I: Protein Science. 32, 2, 15 s., 4556.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  85. Udgivet

    Fission yeast Swi2 designates cell-type specific donor and stimulates Rad51-driven strand exchange for mating-type switching

    Maki, T., Thon, Genevieve & Iwasaki, H., 2023, I: Nucleic acids symposium series. 51, 8, 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  86. E-pub ahead of print

    Carbon and nitrogen uptake through photosynthesis and feeding by photosymbiotic Acantharia

    Mansour, J. S., Hansen, Per Juel, Leroux, C. & Not, F., 2023, (E-pub ahead of print) I: Open Research Europe.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  87. Udgivet

    Environmental predictors of lake fish diversity across gradients in lake age and spatial scale

    Martinsen, K. T., Kristensen, E., Båstrup-Spohr, Lars, Søndergaard, M., Carl, Henrik, Jeppesen, E., Sand-Jensen, Kaj & Kragh, T., 2023, I: Freshwater Biology. 68, 7, 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  88. Udgivet

    Predicting lake bathymetry from the topography of the surrounding terrain using deep learning

    Martinsen, K. T., Sand-Jensen, Kaj & Selvan, Raghav, 2023, I: Limnology and Oceanography: Methods. 21, 10, s. 625-636

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  89. Udgivet

    Plant YTHDF proteins are direct effectors of antiviral immunity against an N6-methyladenosine-containing RNA virus

    Martínez-Pérez, M., Aparicio, F., Arribas Hernandez, Laura, Tankmar, Mathias Due, Rennie, Sarah, von Bülow, Sören, Lindorff-Larsen, Kresten, Brodersen, Peter & Pallas, V., 2023, I: EMBO Journal. 42, 18, 17 s., e113378.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  90. Udgivet

    Effects of Glacial Flour on Marine Micro-plankton: Evidences from Natural Communities of Greenlandic Fjords and Experimental Studies

    Maselli, Maira, Meire, L., Meire, P. & Hansen, Per Juel, 2023, I: Protist. 174, 1, 17 s., 125928.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  91. Udgivet

    Redox state and altered pyruvate metabolism contribute to a dose-dependent metformin-induced lactate production of human myotubes

    Maurer, J., Zhao, X., Irmler, M., Gudiksen, Anders, Pilmark, N. S., Li, Q., Goj, T., Beckers, J., Hrabě De Angelis, M., Birkenfeld, A. L., Peter, A., Lehmann, R., Pilegaard, Henriette, Karstoft, Kristian, Xu, G. & Weigert, C., 2023, I: American Journal of Physiology: Cell Physiology. 325, 4, s. C1131-C1143 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  92. Udgivet

    Strain-specific quorum-sensing responses determine virulence properties in Vibrio anguillarum

    Mauritzen, Jesper Juel, Søndberg, E., Kalatzis, Panagiotis, Roager, L., Gram, L., Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2023, I: Environmental Microbiology. 25, 7, 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  93. Udgivet

    A host of armor: Prokaryotic immune strategies against mobile genetic elements

    Mayo-Muñoz, D., Pinilla Redondo, Rafael, Birkholz, N. & Fineran, P. C., 2023, I: Cell Reports. 42, 7, 14 s., 112672.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  94. Udgivet

    The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics

    Mc Cartney, A. M., Formenti, G., Mouton, A., Panis, D. D., Marins, L. S., Leitão, H. G., Diedericks, G., Kirangwa, J., Morselli, M., Salces-Ortiz, J., Escudero, N., Iannucci, A., Natali, C., Svardal, H., Fernández, R., Pooter, T. D., Joris, G., Strazisar, M., Wood, J., Herron, K. E. & 30 flere, Seehausen, O., Watts, P. C., Shaw, F., Davey, R. P., Minotto, A., Fernández, J. M., Böhne, A., Alegria, C., Alioto, T., Alves, P. C., Amorim, I. R., Aury, J., Backstrom, N., Baldrian, P., Baltrunaite, L., Barta, E., Bed’Hom, B., Belser, C., Bergsten, J., Bertrand, L., Bilandžija, H., Binzer-Panchal, M., Bista, I., Blaxter, M., Borges, P. A., Dias, G. B., Bosse, M., Garg, S., Madsen, O. & Stiller, Josefin, 2023, 51 s. (bioRxiv).

    Publikation: Working paperPreprintForskning

  95. Udgivet

    Pooled analysis of frontal lobe transcriptomic data identifies key mitophagy gene changes in Alzheimer's disease brain

    Mei, T., Li, Yuan, Orduña Dolado, A., Li, Zhiquan, Andersson, Robin, Berliocchi, Laura & Rasmussen, Lene Juel, 2023, I: Frontiers in Aging Neuroscience. 15, 14 s., 1101216.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  96. Udgivet

    When gluttony strikes: how high-fat diet impairs hepatic Ca2+ signalling

    Merrild, C. & Johansen, Valdemar Brimnes Ingemann, 2023, I: Journal of Physiology. 601, 12, s. 2245-2247

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKommentar/debatForskningfagfællebedømt

  97. Udgivet

    Primary cilia as dynamic and diverse signalling hubs in development and disease

    Mill, P., Christensen, Søren Tvorup & Pedersen, Lotte Bang, 2023, I: Nature Reviews. Genetics. 24, 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  98. Udgivet

    The Mixoplankton Database (MDB): Diversity of photo‐phago‐trophic plankton in form, function, and distribution across the global ocean

    Mitra, A., Caron, D. A., Faure, E., Flynn, K. J., Leles, S. G., Hansen, Per Juel, McManus, G. B., Not, F., Rosario Gomes, H. D., Santoferrara, L. F., Stoecker, D. K. & Tillmann, U., 2023, I: Journal of Eukaryotic Microbiology. 70, 4, 25 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  99. Udgivet

    High nutrient loads hinder successful restoration of natural habitats in freshwater wetlands

    Moeslund, J. E., Andersen, D. K., Brunbjerg, A. K., Bruun, Hans Henrik, Fløjgaard, C., McQueen, S. N., Nygaard, B. & Ejrnæs, R., 2023, I: Restoration Ecology. 31, 7, 13 s., e13796.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  100. Udgivet

    Microplastic pollution associated with reduced respiration in seagrass (Zostera marina L.) and associated epiphytes

    Molin, J. M., Groth-Andersen, W. E., Hansen, Per Juel, Kühl, Michael & Brodersen, Kasper Elgetti, 2023, I: Frontiers in Marine Science. 10, 14 s., 1216299.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  101. Udgivet

    Plasmid permissiveness of wastewater microbiomes can be predicted from 16S rRNA sequences by machine learning

    Moradigaravand, D., Li, L., Dechesne, A., Nesme, Joseph, de la Cruz, R., Ahmad, H., Banzhaf, M., Sørensen, Søren Johannes, Smets, B. F. & Kreft, J. U., 2023, I: Bioinformatics (Oxford, England). 39, 7, 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt